56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1084 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_3943  citrate lyase, alpha subunit  75 
 
 		 512 aa  802    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000277042 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3858  citrate lyase, alpha subunit  74.41 
 
 		 512 aa  796    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1084  citrate lyase, alpha subunit  100 
 
 		 512 aa  1036    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1165  citrate lyase, alpha subunit  52.9 
 
 		 519 aa  538  9.999999999999999e-153  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.776939  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4206  citrate lyase, alpha subunit  50.78 
 
 		 518 aa  528  1e-148  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000987109  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0326  citrate lyase, alpha subunit  53.24 
 
 		 534 aa  505  9.999999999999999e-143  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1371  citrate lyase, alpha subunit  51.85 
 
 		 517 aa  502  1e-141  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0970  citrate lyase, alpha subunit  48.24 
 
 		 511 aa  500  1e-140  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0341  citrate lyase, alpha subunit  52.44 
 
 		 518 aa  498  1e-140  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0024  citrate lyase, alpha subunit  52.05 
 
 		 518 aa  496  1e-139  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1249  citrate lyase, alpha subunit  53.75 
 
 		 510 aa  483  1e-135  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0940044 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0066  citrate lyase subunit alpha  50.3 
 
 		 506 aa  475  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.597387 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0065  citrate lyase subunit alpha  50.3 
 
 		 506 aa  474  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0067  citrate lyase, alpha subunit  50.3 
 
 		 506 aa  474  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.139514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0066  citrate lyase, alpha subunit  50.3 
 
 		 506 aa  474  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0068  citrate lyase, alpha subunit  50.3 
 
 		 506 aa  473  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0675  citrate lyase, alpha subunit  49.9 
 
 		 509 aa  469  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0661  citrate lyase, alpha subunit  49.9 
 
 		 509 aa  469  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0721  citrate lyase subunit alpha  49.7 
 
 		 509 aa  467  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.331125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0780  citrate lyase, alpha subunit  49.9 
 
 		 509 aa  468  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.495863  normal  0.466757 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0734  citrate lyase subunit alpha  49.9 
 
 		 509 aa  468  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0634  citrate lyase, alpha subunit  51.71 
 
 		 510 aa  466  9.999999999999999e-131  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1631  citrate lyase, alpha subunit  51.96 
 
 		 498 aa  467  9.999999999999999e-131  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0703  citrate lyase, alpha subunit  51.5 
 
 		 510 aa  462  1e-129  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04690  citrate lyase, alpha subunit  48.31 
 
 		 497 aa  463  1e-129  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00572  hypothetical protein  51.5 
 
 		 510 aa  464  1e-129  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3010  citrate lyase, alpha subunit  51.28 
 
 		 510 aa  462  1e-129  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.049663  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3029  citrate lyase, alpha subunit  51.5 
 
 		 510 aa  464  1e-129  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0637  citrate lyase alpha chain  51.5 
 
 		 510 aa  464  1e-129  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.559114  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0666  citrate lyase alpha chain  51.5 
 
 		 510 aa  464  1e-129  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00583  citrate lyase, citrate-ACP transferase (alpha) subunit  51.5 
 
 		 510 aa  464  1e-129  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0529  citrate lyase, alpha subunit  51.07 
 
 		 510 aa  457  1e-127  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1755  citrate lyase, alpha subunit  50.11 
 
 		 509 aa  456  1e-127  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0423  citrate lyase, alpha subunit  47.85 
 
 		 512 aa  452  1.0000000000000001e-126  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3168  citrate lyase, alpha subunit  50.43 
 
 		 501 aa  448  1e-125  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.385767  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2028  citrate lyase, alpha subunit  49.68 
 
 		 509 aa  451  1e-125  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.578582  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2319  citrate lyase, alpha subunit  48.83 
 
 		 509 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3372  citrate lyase, alpha subunit  48.19 
 
 		 505 aa  445  1e-123  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0954315 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2217  citrate lyase, alpha subunit  48.19 
 
 		 507 aa  441  9.999999999999999e-123  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2407  citrate lyase, alpha subunit  47 
 
 		 512 aa  437  1e-121  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0227211  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6121  citrate lyase, alpha subunit  51.04 
 
 		 508 aa  425  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.32733 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2962  citrate lyase, alpha subunit  41.37 
 
 		 536 aa  397  1e-109  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0727414  normal  0.222216 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1427  citrate CoA-transferase  38.49 
 
 		 515 aa  298  2e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.749143 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7279  Acetyl-CoA hydrolase/transferase  26.86 
 
 		 430 aa  52.8  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2815  acetyl-CoA hydrolase/transferase  24.26 
 
 		 437 aa  52.4  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1439  acetyl-CoA hydrolase/transferase  24.26 
 
 		 437 aa  51.2  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2213  succinate CoA transferase  31.2 
 
 		 505 aa  50.8  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.285742  normal  0.144104 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1217  Acetyl-CoA hydrolase  30.83 
 
 		 483 aa  49.7  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.872767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0292  Acetyl-CoA hydrolase  26.17 
 
 		 510 aa  45.4  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1257  acetyl-CoA hydrolase/transferase  23.99 
 
 		 453 aa  44.7  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.747278 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4138  putative acetyl-CoA hydrolase/transferase  36.54 
 
 		 397 aa  44.7  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5056  succinate CoA transferase  24.14 
 
 		 504 aa  44.3  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.265353 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0141  acetyl-CoA hydrolase/transferase  25.15 
 
 		 426 aa  43.9  0.007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0123  acetyl-CoA hydrolase/transferase  25.57 
 
 		 441 aa  43.5  0.008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.281675 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0066  succinate CoA transferase  23.45 
 
 		 506 aa  43.5  0.01  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0046  Acetyl-CoA hydrolase  23.45 
 
 		 506 aa  43.5  0.01  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.505771 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>