53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1631 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE1631  citrate lyase, alpha subunit  100 
 
 		 498 aa  1016    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4206  citrate lyase, alpha subunit  53.61 
 
 		 518 aa  523  1e-147  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000987109  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1084  citrate lyase, alpha subunit  51.96 
 
 		 512 aa  467  9.999999999999999e-131  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1165  citrate lyase, alpha subunit  50.61 
 
 		 519 aa  459  9.999999999999999e-129  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.776939  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1371  citrate lyase, alpha subunit  49.57 
 
 		 517 aa  444  1e-123  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3858  citrate lyase, alpha subunit  47.25 
 
 		 512 aa  442  1e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3943  citrate lyase, alpha subunit  47.25 
 
 		 512 aa  444  1e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000277042 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1249  citrate lyase, alpha subunit  46.06 
 
 		 510 aa  414  1e-114  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0940044 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0066  citrate lyase, alpha subunit  44.31 
 
 		 506 aa  411  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0065  citrate lyase subunit alpha  44.31 
 
 		 506 aa  410  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0067  citrate lyase, alpha subunit  44.31 
 
 		 506 aa  411  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.139514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0068  citrate lyase, alpha subunit  44.31 
 
 		 506 aa  411  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0066  citrate lyase subunit alpha  44.31 
 
 		 506 aa  411  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.597387 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0024  citrate lyase, alpha subunit  46.75 
 
 		 518 aa  409  1e-113  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0341  citrate lyase, alpha subunit  46.75 
 
 		 518 aa  409  1e-113  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1755  citrate lyase, alpha subunit  43.42 
 
 		 509 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00572  hypothetical protein  44.01 
 
 		 510 aa  403  1e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0326  citrate lyase, alpha subunit  47.07 
 
 		 534 aa  404  1e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0637  citrate lyase alpha chain  44.01 
 
 		 510 aa  403  1e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.559114  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3029  citrate lyase, alpha subunit  44.01 
 
 		 510 aa  403  1e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0634  citrate lyase, alpha subunit  44.01 
 
 		 510 aa  402  1e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00583  citrate lyase, citrate-ACP transferase (alpha) subunit  44.01 
 
 		 510 aa  403  1e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3010  citrate lyase, alpha subunit  44.01 
 
 		 510 aa  403  1e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.049663  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0703  citrate lyase, alpha subunit  43.8 
 
 		 510 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2028  citrate lyase, alpha subunit  44.25 
 
 		 509 aa  400  9.999999999999999e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.578582  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0970  citrate lyase, alpha subunit  44.47 
 
 		 511 aa  399  9.999999999999999e-111  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0666  citrate lyase alpha chain  44.01 
 
 		 510 aa  402  9.999999999999999e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04690  citrate lyase, alpha subunit  42.15 
 
 		 497 aa  397  1e-109  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0529  citrate lyase, alpha subunit  43.8 
 
 		 510 aa  397  1e-109  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3372  citrate lyase, alpha subunit  45.34 
 
 		 505 aa  395  1e-109  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0954315 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0675  citrate lyase, alpha subunit  43.38 
 
 		 509 aa  391  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2217  citrate lyase, alpha subunit  42.94 
 
 		 507 aa  391  1e-107  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0721  citrate lyase subunit alpha  43.17 
 
 		 509 aa  390  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.331125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0661  citrate lyase, alpha subunit  43.38 
 
 		 509 aa  391  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0780  citrate lyase, alpha subunit  43.38 
 
 		 509 aa  390  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.495863  normal  0.466757 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0734  citrate lyase subunit alpha  43.38 
 
 		 509 aa  390  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6121  citrate lyase, alpha subunit  48.45 
 
 		 508 aa  384  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.32733 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0423  citrate lyase, alpha subunit  46.68 
 
 		 512 aa  385  1e-105  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2319  citrate lyase, alpha subunit  42.28 
 
 		 509 aa  382  1e-105  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2407  citrate lyase, alpha subunit  41.56 
 
 		 512 aa  372  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0227211  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3168  citrate lyase, alpha subunit  41.67 
 
 		 501 aa  368  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.385767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1427  citrate CoA-transferase  41.72 
 
 		 515 aa  353  4e-96  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.749143 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2962  citrate lyase, alpha subunit  43.17 
 
 		 536 aa  338  9.999999999999999e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0727414  normal  0.222216 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3051  putative succinyl-CoA/coenzyme A transferase  27.93 
 
 		 496 aa  48.1  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.282197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2807  Acetyl-CoA hydrolase/transferase  27.49 
 
 		 503 aa  48.1  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00135825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1541  coenzyme A transferase  24.92 
 
 		 508 aa  48.1  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2697  coenzyme A transferase  36.49 
 
 		 269 aa  47.4  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2304  succinate CoA transferase  26.42 
 
 		 503 aa  46.6  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0363976  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0292  Acetyl-CoA hydrolase  29.33 
 
 		 510 aa  45.4  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4309  Acetyl-CoA hydrolase  30.08 
 
 		 500 aa  43.9  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2589  acetyl-CoA hydrolase/transferase  23.24 
 
 		 490 aa  44.3  0.006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0404  glutaconate CoA-transferase  39.51 
 
 		 269 aa  43.5  0.008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00014468  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16700  acetyl-CoA hydrolase/transferase family protein  27.64 
 
 		 498 aa  43.1  0.01  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>