38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_2013 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_2013  zinc finger SWIM domain-containing protein  100 
 
 		 608 aa  1247    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.450022 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3936  zinc finger SWIM domain-containing protein  30.91 
 
 		 601 aa  268  2.9999999999999995e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03993  hypothetical protein  26.55 
 
 		 543 aa  165  2.0000000000000002e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1139  zinc finger SWIM domain-containing protein  25.86 
 
 		 550 aa  161  4e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.256553  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2701  zinc finger SWIM domain-containing protein  28.02 
 
 		 541 aa  143  8e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.322732  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05420  hypothetical protein  31.23 
 
 		 291 aa  124  7e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.508748  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0735  hypothetical protein  24.69 
 
 		 639 aa  103  8e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5366  hypothetical protein  26.91 
 
 		 411 aa  99  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3426  hypothetical protein  29.78 
 
 		 355 aa  97.4  7e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6037  zinc finger SWIM domain protein  37.84 
 
 		 162 aa  88.6  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0334  hypothetical protein  22.52 
 
 		 589 aa  87.8  5e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0989  hypothetical protein  24.6 
 
 		 480 aa  81.3  0.00000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.00407781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0843  hypothetical protein  21.83 
 
 		 392 aa  70.5  0.00000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0826  hypothetical protein  21.83 
 
 		 392 aa  70.5  0.00000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0899  hypothetical protein  22.83 
 
 		 641 aa  70.1  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5365  zinc finger SWIM domain-containing protein  26.49 
 
 		 348 aa  66.2  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8415  zinc finger SWIM domain protein  34.07 
 
 		 240 aa  66.2  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2005  zinc finger SWIM domain protein  28.32 
 
 		 566 aa  65.1  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000079081  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1893  hypothetical protein  24.24 
 
 		 507 aa  65.1  0.000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00616409  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2647  zinc finger SWIM domain protein  25.78 
 
 		 222 aa  62.4  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.714804 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0250  zinc finger SWIM domain protein  22.16 
 
 		 580 aa  59.3  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04240  hypothetical protein  23.83 
 
 		 577 aa  57.8  0.0000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0253557  normal  0.72499 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1653  zinc finger SWIM domain protein  35.29 
 
 		 605 aa  55.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.170243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01150  hypothetical protein  25.95 
 
 		 390 aa  55.1  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1131  zinc finger SWIM domain protein  31.63 
 
 		 266 aa  54.7  0.000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0988  zinc finger SWIM domain protein  23.14 
 
 		 567 aa  52.8  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6220  zinc finger SWIM domain-containing protein  26.13 
 
 		 221 aa  52.8  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0165  zinc finger SWIM domain protein  30.28 
 
 		 266 aa  52  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0899  zinc finger SWIM domain protein  46.15 
 
 		 603 aa  51.2  0.00006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.727484  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1317  zinc finger SWIM domain-containing protein  22.41 
 
 		 432 aa  50.8  0.00007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3437  zinc finger SWIM domain-containing protein  26.67 
 
 		 142 aa  49.7  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0283  SNF2-related protein  38.98 
 
 		 1062 aa  49.3  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0118  zinc finger SWIM domain protein  33.33 
 
 		 848 aa  48.5  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.428898  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0400  hypothetical protein  25.41 
 
 		 480 aa  47.8  0.0005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0338221  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1485  zinc finger SWIM domain protein  29.35 
 
 		 656 aa  47.8  0.0007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2883  zinc finger SWIM domain protein  23.84 
 
 		 273 aa  45.8  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1672  zinc finger, SWIM-type  40.28 
 
 		 131 aa  44.7  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0138295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1036  SNF2 helicase associated domain-containing protein  33.78 
 
 		 832 aa  44.3  0.006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>