47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3437 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_3437  zinc finger SWIM domain-containing protein  100 
 
 
142 aa  293  5e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0990  zinc finger SWIM domain-containing protein  40.71 
 
 
611 aa  105  3e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1928  SWIM Zn-finger  36.5 
 
 
613 aa  100  6e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.366569  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1653  zinc finger SWIM domain protein  36.03 
 
 
605 aa  87.4  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.170243  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0165  zinc finger SWIM domain protein  32.85 
 
 
266 aa  69.3  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1485  zinc finger SWIM domain protein  40.74 
 
 
656 aa  63.5  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1131  zinc finger SWIM domain protein  30.28 
 
 
266 aa  62.8  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0644  zinc finger SWIM domain-containing protein  33.64 
 
 
229 aa  62  0.000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0118  zinc finger SWIM domain protein  42.86 
 
 
848 aa  62.4  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.428898  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1367  zinc finger SWIM domain-containing protein  32.73 
 
 
229 aa  62  0.000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.388054  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1179  hypothetical protein  37.8 
 
 
570 aa  58.9  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1309  zinc finger SWIM domain-containing protein  30.58 
 
 
229 aa  57.4  0.00000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0899  zinc finger SWIM domain protein  34.13 
 
 
603 aa  57.4  0.00000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.727484  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1077  zinc finger SWIM domain-containing protein  38.26 
 
 
142 aa  57.4  0.00000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.209971 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1318  zinc finger SWIM domain-containing protein  31.78 
 
 
229 aa  56.2  0.0000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.835204  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0988  zinc finger SWIM domain protein  41.89 
 
 
567 aa  53.1  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0547  hypothetical protein  34.85 
 
 
640 aa  52.8  0.000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2883  zinc finger SWIM domain protein  31.25 
 
 
273 aa  52.4  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0816  zinc finger SWIM domain protein  34.48 
 
 
144 aa  52  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.397835 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2005  zinc finger SWIM domain protein  27.82 
 
 
566 aa  51.2  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000079081  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1766  non-specific serine/threonine protein kinase  34.34 
 
 
1055 aa  50.4  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6037  zinc finger SWIM domain protein  33.09 
 
 
162 aa  50.1  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2647  zinc finger SWIM domain protein  30.88 
 
 
222 aa  50.1  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.714804 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2013  zinc finger SWIM domain-containing protein  26.67 
 
 
608 aa  49.7  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.450022 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0801  hypothetical protein  33.33 
 
 
1088 aa  46.2  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0772  hypothetical protein  33.33 
 
 
1088 aa  46.2  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2701  zinc finger SWIM domain-containing protein  28.47 
 
 
541 aa  46.2  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.322732  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0551  hypothetical protein  32.67 
 
 
701 aa  45.1  0.0003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0334  hypothetical protein  31.03 
 
 
589 aa  45.1  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1317  zinc finger SWIM domain-containing protein  35.06 
 
 
432 aa  43.9  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0899  hypothetical protein  32.5 
 
 
641 aa  43.9  0.0008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2110  zinc finger SWIM domain-containing protein  35 
 
 
129 aa  43.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.165938  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2601  SNF2-related protein  30 
 
 
1086 aa  42.7  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1196  zinc finger SWIM domain-containing protein  31.03 
 
 
231 aa  42.4  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0250  zinc finger SWIM domain protein  40 
 
 
580 aa  42.7  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3874  Non-specific serine/threonine protein kinase  35.06 
 
 
1261 aa  41.6  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.646878  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3472  SNF2-related protein  31.33 
 
 
1100 aa  41.6  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4317  zinc finger SWIM domain protein  30.21 
 
 
600 aa  41.6  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1815  putative helicase  29.07 
 
 
1064 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1618  SWF/SNF family helicase  27.47 
 
 
1064 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31767  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2580  non-specific serine/threonine protein kinase  32.18 
 
 
1069 aa  40.4  0.007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00984411  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2451  SNF2-related protein  48 
 
 
1087 aa  40.8  0.007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1851  putative helicase  29.07 
 
 
1064 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000970317 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1653  SWF/SNF family helicase  29.07 
 
 
1064 aa  40.4  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1669  non-specific serine/threonine protein kinase  27.91 
 
 
1068 aa  40.4  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1671  helicase  29.07 
 
 
1064 aa  40.4  0.009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.480924  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1804  helicase  29.07 
 
 
1064 aa  40.4  0.009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>