28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2701 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_2701  zinc finger SWIM domain-containing protein  100 
 
 		 541 aa  1078    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.322732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2013  zinc finger SWIM domain-containing protein  28.02 
 
 		 608 aa  156  1e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.450022 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3936  zinc finger SWIM domain-containing protein  26.78 
 
 		 601 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1139  zinc finger SWIM domain-containing protein  28.24 
 
 		 550 aa  131  3e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.256553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5366  hypothetical protein  29.66 
 
 		 411 aa  107  4e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03993  hypothetical protein  26.97 
 
 		 543 aa  105  1e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3426  hypothetical protein  32.69 
 
 		 355 aa  84  0.000000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05420  hypothetical protein  29.96 
 
 		 291 aa  79.7  0.0000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.508748  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4832  zinc finger SWIM domain-containing protein  39.67 
 
 		 140 aa  71.2  0.00000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3248  SNF2 helicase associated domain-containing protein  37.11 
 
 		 1084 aa  61.6  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2647  zinc finger SWIM domain protein  29.36 
 
 		 222 aa  61.6  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.714804 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0334  hypothetical protein  25 
 
 		 589 aa  57.8  0.0000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1653  zinc finger SWIM domain protein  30.71 
 
 		 605 aa  56.6  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.170243  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2005  zinc finger SWIM domain protein  27.78 
 
 		 566 aa  55.1  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000079081  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0165  zinc finger SWIM domain protein  38.57 
 
 		 266 aa  54.7  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0990  zinc finger SWIM domain-containing protein  29.85 
 
 		 611 aa  54.7  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8415  zinc finger SWIM domain protein  31.45 
 
 		 240 aa  53.5  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01150  hypothetical protein  27.49 
 
 		 390 aa  51.2  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1928  SWIM Zn-finger  28.79 
 
 		 613 aa  49.7  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.366569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0988  zinc finger SWIM domain protein  23.27 
 
 		 567 aa  48.9  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0250  zinc finger SWIM domain protein  23.2 
 
 		 580 aa  49.3  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2883  zinc finger SWIM domain protein  37.93 
 
 		 273 aa  48.5  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0118  zinc finger SWIM domain protein  34.21 
 
 		 848 aa  48.5  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.428898  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04240  hypothetical protein  33.33 
 
 		 577 aa  47.8  0.0005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0253557  normal  0.72499 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1485  zinc finger SWIM domain protein  26.29 
 
 		 656 aa  47.4  0.0007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3437  zinc finger SWIM domain-containing protein  28.47 
 
 		 142 aa  46.2  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6037  zinc finger SWIM domain protein  31.11 
 
 		 162 aa  45.8  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0899  hypothetical protein  36.52 
 
 		 641 aa  45.4  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>