18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2647 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2647  zinc finger SWIM domain protein  100 
 
 		 222 aa  441  1e-123  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.714804 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2013  zinc finger SWIM domain-containing protein  29.33 
 
 		 608 aa  78.2  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.450022 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3936  zinc finger SWIM domain-containing protein  30.29 
 
 		 601 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1139  zinc finger SWIM domain-containing protein  28.76 
 
 		 550 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.256553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6037  zinc finger SWIM domain protein  35.4 
 
 		 162 aa  65.9  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8415  zinc finger SWIM domain protein  35.04 
 
 		 240 aa  65.1  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0334  hypothetical protein  28.5 
 
 		 589 aa  64.3  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2701  zinc finger SWIM domain-containing protein  29.36 
 
 		 541 aa  63.9  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.322732  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0118  zinc finger SWIM domain protein  45.68 
 
 		 848 aa  60.1  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.428898  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3437  zinc finger SWIM domain-containing protein  30.88 
 
 		 142 aa  57.8  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1485  zinc finger SWIM domain protein  37.86 
 
 		 656 aa  53.9  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2883  zinc finger SWIM domain protein  40.24 
 
 		 273 aa  52.8  0.000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0990  zinc finger SWIM domain-containing protein  28.44 
 
 		 611 aa  51.6  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3472  SNF2-related protein  34.07 
 
 		 1100 aa  47.4  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04240  hypothetical protein  32.32 
 
 		 577 aa  43.9  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0253557  normal  0.72499 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03993  hypothetical protein  24.63 
 
 		 543 aa  43.5  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0899  zinc finger SWIM domain protein  40.91 
 
 		 603 aa  42.7  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.727484  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1928  SWIM Zn-finger  29.01 
 
 		 613 aa  41.6  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.366569  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>