29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3936 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_3936  zinc finger SWIM domain-containing protein  100 
 
 		 601 aa  1219    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2013  zinc finger SWIM domain-containing protein  30.91 
 
 		 608 aa  271  2e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.450022 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2701  zinc finger SWIM domain-containing protein  26.66 
 
 		 541 aa  142  3e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.322732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03993  hypothetical protein  27.43 
 
 		 543 aa  140  8.999999999999999e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5366  hypothetical protein  27.27 
 
 		 411 aa  105  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3426  hypothetical protein  32.08 
 
 		 355 aa  103  8e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1139  zinc finger SWIM domain-containing protein  25.22 
 
 		 550 aa  88.2  4e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.256553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05420  hypothetical protein  27.6 
 
 		 291 aa  71.6  0.00000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.508748  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2647  zinc finger SWIM domain protein  30.29 
 
 		 222 aa  63.2  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.714804 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0988  zinc finger SWIM domain protein  26.92 
 
 		 567 aa  57.8  0.0000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1485  zinc finger SWIM domain protein  25.69 
 
 		 656 aa  57  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1653  zinc finger SWIM domain protein  39.44 
 
 		 605 aa  54.7  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.170243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6037  zinc finger SWIM domain protein  32.19 
 
 		 162 aa  52.4  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0283  SNF2-related protein  38.33 
 
 		 1062 aa  51.6  0.00004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0334  hypothetical protein  26.32 
 
 		 589 aa  51.6  0.00004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0142  hypothetical protein  27.68 
 
 		 474 aa  51.6  0.00005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.000223018  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2883  zinc finger SWIM domain protein  26.92 
 
 		 273 aa  51.2  0.00005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5365  zinc finger SWIM domain-containing protein  26.38 
 
 		 348 aa  50.4  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8415  zinc finger SWIM domain protein  34.62 
 
 		 240 aa  50.4  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1766  non-specific serine/threonine protein kinase  36.62 
 
 		 1055 aa  49.3  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1179  hypothetical protein  25.98 
 
 		 570 aa  48.1  0.0005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6220  zinc finger SWIM domain-containing protein  46.3 
 
 		 221 aa  47  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1036  SNF2 helicase associated domain-containing protein  31.73 
 
 		 832 aa  45.8  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0826  hypothetical protein  27.46 
 
 		 392 aa  45.4  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0843  hypothetical protein  27.46 
 
 		 392 aa  45.4  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2005  zinc finger SWIM domain protein  26.09 
 
 		 566 aa  45.1  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000079081  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1131  zinc finger SWIM domain protein  38.57 
 
 		 266 aa  45.1  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04240  hypothetical protein  25.74 
 
 		 577 aa  43.9  0.008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0253557  normal  0.72499 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2601  SNF2-related protein  39.24 
 
 		 1086 aa  43.9  0.008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>