29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8415 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_8415  zinc finger SWIM domain protein  100 
 
 
240 aa  480  1e-135  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2013  zinc finger SWIM domain-containing protein  34.07 
 
 
608 aa  66.2  0.0000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.450022 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6037  zinc finger SWIM domain protein  34.97 
 
 
162 aa  61.6  0.000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2647  zinc finger SWIM domain protein  40.24 
 
 
222 aa  57.4  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.714804 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03993  hypothetical protein  31.09 
 
 
543 aa  55.1  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2701  zinc finger SWIM domain-containing protein  31.45 
 
 
541 aa  53.5  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.322732  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3936  zinc finger SWIM domain-containing protein  34.62 
 
 
601 aa  50.1  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3776  zinc finger SWIM domain-containing protein  39.73 
 
 
539 aa  48.5  0.00008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1485  zinc finger SWIM domain protein  37.66 
 
 
656 aa  48.5  0.00009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5038  zinc finger SWIM domain-containing protein  40.28 
 
 
539 aa  48.1  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5417  hypothetical protein  39.73 
 
 
539 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5363  hypothetical protein  39.73 
 
 
539 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1332  zinc finger SWIM domain protein  35.21 
 
 
537 aa  47.4  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5369  hypothetical protein  39.73 
 
 
539 aa  47  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0118  zinc finger SWIM domain protein  38.36 
 
 
848 aa  47  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.428898  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3215  zinc finger SWIM domain protein  35.14 
 
 
535 aa  46.6  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0504166  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5335  hypothetical protein  39.73 
 
 
539 aa  47  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000885338 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5587  hypothetical protein  39.73 
 
 
539 aa  47  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0142216 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1139  zinc finger SWIM domain-containing protein  32.86 
 
 
550 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.256553  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5486  hypothetical protein  39.73 
 
 
539 aa  47  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4940  hypothetical protein  39.73 
 
 
539 aa  47  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4925  hypothetical protein  39.73 
 
 
539 aa  47  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5095  hypothetical protein  39.73 
 
 
539 aa  47  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2883  zinc finger SWIM domain protein  35.4 
 
 
273 aa  46.2  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3353  zinc finger SWIM domain protein  33.78 
 
 
548 aa  45.4  0.0008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0165  zinc finger SWIM domain protein  29.09 
 
 
266 aa  43.1  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0334  hypothetical protein  29.41 
 
 
589 aa  43.1  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01150  hypothetical protein  35.71 
 
 
390 aa  43.1  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4317  zinc finger SWIM domain protein  34.41 
 
 
600 aa  42.4  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>