18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_3215 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_3215  zinc finger SWIM domain protein  100 
 
 
535 aa  1104    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0504166  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1332  zinc finger SWIM domain protein  61.71 
 
 
537 aa  647    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3353  zinc finger SWIM domain protein  50.46 
 
 
548 aa  539  9.999999999999999e-153  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5038  zinc finger SWIM domain-containing protein  26.88 
 
 
539 aa  182  1e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5369  hypothetical protein  27 
 
 
539 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5587  hypothetical protein  26.81 
 
 
539 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0142216 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5335  hypothetical protein  27.17 
 
 
539 aa  173  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000885338 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3776  zinc finger SWIM domain-containing protein  27.08 
 
 
539 aa  171  2e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5486  hypothetical protein  27.17 
 
 
539 aa  171  3e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5095  hypothetical protein  27.17 
 
 
539 aa  171  3e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4925  hypothetical protein  26.98 
 
 
539 aa  168  2e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5417  hypothetical protein  26.79 
 
 
539 aa  167  4e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5363  hypothetical protein  26.6 
 
 
539 aa  167  5e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4940  hypothetical protein  26.79 
 
 
539 aa  167  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4317  zinc finger SWIM domain protein  22.32 
 
 
600 aa  124  3e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8415  zinc finger SWIM domain protein  35.14 
 
 
240 aa  46.6  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1290  hypothetical protein  32.43 
 
 
404 aa  45.8  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.761653  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0413  hypothetical protein  25 
 
 
452 aa  45.4  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0229298  normal  0.0390239 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>