21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_01150 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_01150  hypothetical protein  100 
 
 		 390 aa  764    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5366  hypothetical protein  31.12 
 
 		 411 aa  133  3.9999999999999996e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1139  zinc finger SWIM domain-containing protein  27.63 
 
 		 550 aa  103  4e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.256553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3426  hypothetical protein  33.21 
 
 		 355 aa  71.2  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2013  zinc finger SWIM domain-containing protein  25.55 
 
 		 608 aa  54.7  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.450022 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8415  zinc finger SWIM domain protein  35.71 
 
 		 240 aa  53.9  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3776  zinc finger SWIM domain-containing protein  31.33 
 
 		 539 aa  48.1  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5038  zinc finger SWIM domain-containing protein  23.44 
 
 		 539 aa  47  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1332  zinc finger SWIM domain protein  31.25 
 
 		 537 aa  47  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3215  zinc finger SWIM domain protein  29.49 
 
 		 535 aa  46.6  0.0008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0504166  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4317  zinc finger SWIM domain protein  27.78 
 
 		 600 aa  46.2  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1893  hypothetical protein  27.91 
 
 		 507 aa  44.7  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00616409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2701  zinc finger SWIM domain-containing protein  27.49 
 
 		 541 aa  43.5  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.322732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5335  hypothetical protein  31.51 
 
 		 539 aa  43.1  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000885338 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5095  hypothetical protein  31.51 
 
 		 539 aa  43.1  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5486  hypothetical protein  31.51 
 
 		 539 aa  43.1  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4940  hypothetical protein  31.51 
 
 		 539 aa  43.1  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4925  hypothetical protein  31.51 
 
 		 539 aa  43.1  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05420  hypothetical protein  29.73 
 
 		 291 aa  43.1  0.009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.508748  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5587  hypothetical protein  31.51 
 
 		 539 aa  42.7  0.01  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0142216 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5417  hypothetical protein  31.51 
 
 		 539 aa  42.7  0.01  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>