21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_1139 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_1139  zinc finger SWIM domain-containing protein  100 
 
 		 550 aa  1103    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.256553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2013  zinc finger SWIM domain-containing protein  25.86 
 
 		 608 aa  161  4e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.450022 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2701  zinc finger SWIM domain-containing protein  28.24 
 
 		 541 aa  131  4.0000000000000003e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.322732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5366  hypothetical protein  32.07 
 
 		 411 aa  127  8.000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01150  hypothetical protein  27.63 
 
 		 390 aa  91.3  4e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3936  zinc finger SWIM domain-containing protein  25.22 
 
 		 601 aa  87.8  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03993  hypothetical protein  25.1 
 
 		 543 aa  76.6  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3426  hypothetical protein  33.01 
 
 		 355 aa  66.2  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2647  zinc finger SWIM domain protein  28.76 
 
 		 222 aa  62.8  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.714804 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0250  zinc finger SWIM domain protein  25.43 
 
 		 580 aa  60.1  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0989  hypothetical protein  25.27 
 
 		 480 aa  57.8  0.0000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.00407781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2005  zinc finger SWIM domain protein  26.79 
 
 		 566 aa  57.4  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000079081  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04240  hypothetical protein  28.71 
 
 		 577 aa  57.4  0.0000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0253557  normal  0.72499 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1653  zinc finger SWIM domain protein  29.53 
 
 		 605 aa  53.5  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.170243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0843  hypothetical protein  25.91 
 
 		 392 aa  50.1  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0826  hypothetical protein  25.91 
 
 		 392 aa  50.1  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0334  hypothetical protein  26.13 
 
 		 589 aa  48.5  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8415  zinc finger SWIM domain protein  32.86 
 
 		 240 aa  46.6  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0165  zinc finger SWIM domain protein  27.43 
 
 		 266 aa  45.4  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6037  zinc finger SWIM domain protein  34.09 
 
 		 162 aa  44.7  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0118  zinc finger SWIM domain protein  25.51 
 
 		 848 aa  43.5  0.009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.428898  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>