12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5366 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5366  hypothetical protein  100 
 
 		 411 aa  797    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1139  zinc finger SWIM domain-containing protein  32.07 
 
 		 550 aa  127  5e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.256553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01150  hypothetical protein  42.17 
 
 		 390 aa  110  5e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3936  zinc finger SWIM domain-containing protein  27.42 
 
 		 601 aa  108  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2701  zinc finger SWIM domain-containing protein  29.66 
 
 		 541 aa  106  8e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.322732  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3426  hypothetical protein  39.57 
 
 		 355 aa  101  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2013  zinc finger SWIM domain-containing protein  26.91 
 
 		 608 aa  99  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.450022 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0826  hypothetical protein  28.77 
 
 		 392 aa  67  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0843  hypothetical protein  28.77 
 
 		 392 aa  67  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03993  hypothetical protein  27.35 
 
 		 543 aa  65.5  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1290  hypothetical protein  20.92 
 
 		 404 aa  48.1  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.761653  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2679  hypothetical protein  29.76 
 
 		 503 aa  43.5  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495169  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>