53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_0118 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_0118  zinc finger SWIM domain protein  100 
 
 
848 aa  1712    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.428898  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1485  zinc finger SWIM domain protein  51.52 
 
 
656 aa  597  1e-169  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1484  hypothetical protein  69.72 
 
 
151 aa  211  5e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2883  zinc finger SWIM domain protein  35.69 
 
 
273 aa  164  6e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0165  zinc finger SWIM domain protein  35.85 
 
 
266 aa  141  4.999999999999999e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1131  zinc finger SWIM domain protein  35.18 
 
 
266 aa  134  6.999999999999999e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0990  zinc finger SWIM domain-containing protein  43.56 
 
 
611 aa  80.9  0.00000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3248  SNF2 helicase associated domain-containing protein  30.2 
 
 
1084 aa  65.5  0.000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1179  hypothetical protein  22.94 
 
 
570 aa  62.8  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3437  zinc finger SWIM domain-containing protein  42.86 
 
 
142 aa  62.4  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0988  zinc finger SWIM domain protein  24.26 
 
 
567 aa  62  0.00000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2647  zinc finger SWIM domain protein  41.58 
 
 
222 aa  61.2  0.00000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.714804 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2005  zinc finger SWIM domain protein  25.65 
 
 
566 aa  60.5  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000079081  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04240  hypothetical protein  24.47 
 
 
577 aa  59.3  0.0000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0253557  normal  0.72499 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0547  hypothetical protein  41.67 
 
 
640 aa  57.4  0.000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1928  SWIM Zn-finger  35.96 
 
 
613 aa  57.4  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.366569  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6037  zinc finger SWIM domain protein  31.13 
 
 
162 aa  55.8  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0208  SNF2 helicase-related protein  30.08 
 
 
1209 aa  54.7  0.000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0735  hypothetical protein  30.4 
 
 
639 aa  53.9  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0905  non-specific serine/threonine protein kinase  36.96 
 
 
1120 aa  53.1  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0334  hypothetical protein  36.59 
 
 
589 aa  52.8  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0899  zinc finger SWIM domain protein  42.65 
 
 
603 aa  52  0.00005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.727484  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3868  SNF2-like  34.74 
 
 
896 aa  51.2  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2013  zinc finger SWIM domain-containing protein  23.24 
 
 
608 aa  51.2  0.00008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.450022 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3596  non-specific serine/threonine protein kinase  36.28 
 
 
1105 aa  51.2  0.00009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.270477 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0250  zinc finger SWIM domain protein  25.62 
 
 
580 aa  50.8  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0283  SNF2-related protein  42.65 
 
 
1062 aa  50.8  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0801  hypothetical protein  35 
 
 
1088 aa  49.3  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1653  zinc finger SWIM domain protein  33.73 
 
 
605 aa  48.9  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.170243  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3314  SNF2-related protein  39.02 
 
 
1096 aa  48.9  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0772  hypothetical protein  29.06 
 
 
1088 aa  48.9  0.0004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2701  zinc finger SWIM domain-containing protein  34.21 
 
 
541 aa  48.5  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.322732  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8415  zinc finger SWIM domain protein  38.36 
 
 
240 aa  47  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10820  helicase protein  30.16 
 
 
872 aa  46.6  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0081  SNF2 family helicase  31.53 
 
 
1181 aa  47  0.002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0816  zinc finger SWIM domain protein  34.29 
 
 
144 aa  46.6  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.397835 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2451  SNF2-related protein  31.25 
 
 
1087 aa  46.2  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1669  non-specific serine/threonine protein kinase  25.22 
 
 
1068 aa  46.2  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1687  non-specific serine/threonine protein kinase  35.37 
 
 
1105 aa  46.2  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.306833  normal  0.099326 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1877  helicase, putative  27.91 
 
 
1064 aa  45.8  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.609799  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1317  zinc finger SWIM domain-containing protein  43.04 
 
 
432 aa  45.8  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4317  zinc finger SWIM domain protein  29.07 
 
 
600 aa  46.2  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2499  Non-specific serine/threonine protein kinase  30.86 
 
 
1082 aa  45.8  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000806643  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1815  putative helicase  29.07 
 
 
1064 aa  45.8  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4832  zinc finger SWIM domain-containing protein  35 
 
 
140 aa  45.8  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3931  SNF2-related  32.22 
 
 
1178 aa  45.8  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0899  hypothetical protein  38.75 
 
 
641 aa  45.4  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1060  Non-specific serine/threonine protein kinase  35.16 
 
 
1113 aa  45.1  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.28014  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0942  DNA helicase, SNF2/RAD54 family  35.16 
 
 
1113 aa  45.1  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03993  hypothetical protein  22.54 
 
 
543 aa  44.7  0.008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1618  SWF/SNF family helicase  26.74 
 
 
1064 aa  44.3  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31767  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3526  putative helicase  26.74 
 
 
1064 aa  44.3  0.01  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1851  putative helicase  26.74 
 
 
1064 aa  44.3  0.01  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000970317 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>