18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6037 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6037  zinc finger SWIM domain protein  100 
 
 		 162 aa  331  3e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2013  zinc finger SWIM domain-containing protein  37.84 
 
 		 608 aa  88.6  3e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.450022 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03993  hypothetical protein  40.87 
 
 		 543 aa  66.2  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8415  zinc finger SWIM domain protein  34.97 
 
 		 240 aa  61.6  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2647  zinc finger SWIM domain protein  41.86 
 
 		 222 aa  58.5  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.714804 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0118  zinc finger SWIM domain protein  31.13 
 
 		 848 aa  56.2  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.428898  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0990  zinc finger SWIM domain-containing protein  34.72 
 
 		 611 aa  55.5  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1653  zinc finger SWIM domain protein  37.23 
 
 		 605 aa  54.3  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.170243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1131  zinc finger SWIM domain protein  34.53 
 
 		 266 aa  53.9  0.0000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3936  zinc finger SWIM domain-containing protein  32.19 
 
 		 601 aa  52  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3437  zinc finger SWIM domain-containing protein  33.09 
 
 		 142 aa  50.1  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0334  hypothetical protein  32 
 
 		 589 aa  50.1  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2701  zinc finger SWIM domain-containing protein  31.11 
 
 		 541 aa  45.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.322732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1139  zinc finger SWIM domain-containing protein  34.09 
 
 		 550 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.256553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0165  zinc finger SWIM domain protein  47.92 
 
 		 266 aa  44.7  0.0006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0618  zinc finger, SWIM-type  33.98 
 
 		 186 aa  43.5  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.485971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6013  zinc finger SWIM domain-containing protein  29.57 
 
 		 143 aa  42.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0209337  normal  0.153916 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1766  non-specific serine/threonine protein kinase  34.07 
 
 		 1055 aa  41.2  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>