21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A0334 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A0334  hypothetical protein  100 
 
 		 589 aa  1226    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2013  zinc finger SWIM domain-containing protein  22.52 
 
 		 608 aa  87.8  5e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.450022 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03993  hypothetical protein  25.51 
 
 		 543 aa  75.9  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1485  zinc finger SWIM domain protein  23.68 
 
 		 656 aa  61.6  0.00000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2701  zinc finger SWIM domain-containing protein  25 
 
 		 541 aa  57.8  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.322732  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2647  zinc finger SWIM domain protein  28.5 
 
 		 222 aa  53.1  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.714804 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0118  zinc finger SWIM domain protein  36.59 
 
 		 848 aa  52.8  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.428898  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0165  zinc finger SWIM domain protein  25 
 
 		 266 aa  51.2  0.00005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4832  zinc finger SWIM domain-containing protein  29.5 
 
 		 140 aa  50.4  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1131  zinc finger SWIM domain protein  26.95 
 
 		 266 aa  49.7  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6037  zinc finger SWIM domain protein  32 
 
 		 162 aa  50.1  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3936  zinc finger SWIM domain-containing protein  26.27 
 
 		 601 aa  50.1  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1139  zinc finger SWIM domain-containing protein  26.13 
 
 		 550 aa  48.5  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.256553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04240  hypothetical protein  25.81 
 
 		 577 aa  48.1  0.0004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0253557  normal  0.72499 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1766  non-specific serine/threonine protein kinase  36.26 
 
 		 1055 aa  47.8  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6013  zinc finger SWIM domain-containing protein  29.63 
 
 		 143 aa  47  0.0009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0209337  normal  0.153916 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0801  hypothetical protein  32.97 
 
 		 1088 aa  45.8  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0735  hypothetical protein  22.07 
 
 		 639 aa  45.8  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3437  zinc finger SWIM domain-containing protein  31.03 
 
 		 142 aa  45.1  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0899  zinc finger SWIM domain protein  39.06 
 
 		 603 aa  44.7  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.727484  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0772  hypothetical protein  31.87 
 
 		 1088 aa  43.9  0.009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>