47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1485 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1485  zinc finger SWIM domain protein  100 
 
 		 656 aa  1311    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0118  zinc finger SWIM domain protein  51.52 
 
 		 848 aa  611  1e-173  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.428898  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2883  zinc finger SWIM domain protein  36.01 
 
 		 273 aa  168  2e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0165  zinc finger SWIM domain protein  37.92 
 
 		 266 aa  148  3e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1131  zinc finger SWIM domain protein  33.96 
 
 		 266 aa  126  1e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0990  zinc finger SWIM domain-containing protein  36.26 
 
 		 611 aa  65.1  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04240  hypothetical protein  24.16 
 
 		 577 aa  65.1  0.000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0253557  normal  0.72499 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0988  zinc finger SWIM domain protein  24.55 
 
 		 567 aa  63.2  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3437  zinc finger SWIM domain-containing protein  40.74 
 
 		 142 aa  63.5  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1179  hypothetical protein  23.36 
 
 		 570 aa  61.6  0.00000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0334  hypothetical protein  23.68 
 
 		 589 aa  61.6  0.00000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1928  SWIM Zn-finger  24.27 
 
 		 613 aa  58.2  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.366569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2005  zinc finger SWIM domain protein  27.53 
 
 		 566 aa  58.2  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000079081  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0899  zinc finger SWIM domain protein  46.58 
 
 		 603 aa  57  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.727484  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1143  hypothetical protein  28.46 
 
 		 147 aa  56.6  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3936  zinc finger SWIM domain-containing protein  25.35 
 
 		 601 aa  55.1  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0905  non-specific serine/threonine protein kinase  35.87 
 
 		 1120 aa  55.1  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10820  helicase protein  41.77 
 
 		 872 aa  54.7  0.000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3248  SNF2 helicase associated domain-containing protein  38.27 
 
 		 1084 aa  53.9  0.000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2647  zinc finger SWIM domain protein  37.86 
 
 		 222 aa  52.8  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.714804 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2580  non-specific serine/threonine protein kinase  32.58 
 
 		 1069 aa  52.8  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00984411  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0208  SNF2 helicase-related protein  37.96 
 
 		 1209 aa  52  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0547  hypothetical protein  40.79 
 
 		 640 aa  52  0.00003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0283  SNF2-related protein  39.06 
 
 		 1062 aa  50.8  0.00007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1877  helicase, putative  31.46 
 
 		 1064 aa  48.9  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.609799  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0816  zinc finger SWIM domain protein  37.33 
 
 		 144 aa  48.5  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.397835 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8415  zinc finger SWIM domain protein  37.66 
 
 		 240 aa  48.5  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0735  hypothetical protein  38.36 
 
 		 639 aa  48.1  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2013  zinc finger SWIM domain-containing protein  29.35 
 
 		 608 aa  47.8  0.0007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.450022 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1671  helicase  30.34 
 
 		 1064 aa  47  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.480924  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1653  SWF/SNF family helicase  30.34 
 
 		 1064 aa  46.6  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1618  SWF/SNF family helicase  30.34 
 
 		 1064 aa  47.4  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31767  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3868  SNF2-like  32.28 
 
 		 896 aa  47.4  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1804  helicase  30.34 
 
 		 1064 aa  47  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2451  SNF2-related protein  31.33 
 
 		 1087 aa  47.4  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2110  zinc finger SWIM domain-containing protein  35.06 
 
 		 129 aa  47  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.165938  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2701  zinc finger SWIM domain-containing protein  26.29 
 
 		 541 aa  47  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.322732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1851  putative helicase  30.34 
 
 		 1064 aa  47  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000970317 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3526  putative helicase  29.21 
 
 		 1064 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1815  putative helicase  32.58 
 
 		 1064 aa  47.4  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1653  zinc finger SWIM domain protein  31.03 
 
 		 605 aa  46.2  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.170243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4317  zinc finger SWIM domain protein  28 
 
 		 600 aa  46.2  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1925  putative helicase  30.34 
 
 		 1064 aa  46.2  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1669  non-specific serine/threonine protein kinase  29.21 
 
 		 1068 aa  45.8  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2228  SNF2-related  32.26 
 
 		 1088 aa  44.7  0.006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2499  Non-specific serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 		 1082 aa  43.9  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000806643  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1920  hypothetical protein  38.24 
 
 		 129 aa  43.9  0.01  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>