21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4832 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_4832  zinc finger SWIM domain-containing protein  100 
 
 
140 aa  278  1e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2701  zinc finger SWIM domain-containing protein  39.67 
 
 
541 aa  71.2  0.000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.322732  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0334  hypothetical protein  29.5 
 
 
589 aa  50.4  0.000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0990  zinc finger SWIM domain-containing protein  32.12 
 
 
611 aa  48.5  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3113  hypothetical protein  31.37 
 
 
129 aa  47.8  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.327115  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3359  hypothetical protein  31.37 
 
 
129 aa  47.8  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.852787  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3332  hypothetical protein  31.37 
 
 
129 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04240  hypothetical protein  34.18 
 
 
577 aa  47.4  0.00008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0253557  normal  0.72499 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3036  zinc finger SWIM domain-containing protein  31.13 
 
 
129 aa  46.6  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.57121  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3318  hypothetical protein  29.23 
 
 
152 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2110  zinc finger SWIM domain-containing protein  30.91 
 
 
129 aa  45.4  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.165938  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1653  zinc finger SWIM domain protein  34.45 
 
 
605 aa  45.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.170243  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0118  zinc finger SWIM domain protein  35 
 
 
848 aa  45.8  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.428898  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3868  SNF2-like  32.18 
 
 
896 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3311  hypothetical protein  34.94 
 
 
129 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0475736  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3331  hypothetical protein  28.23 
 
 
129 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3100  hypothetical protein  33.33 
 
 
129 aa  43.9  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.122576  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3003  hypothetical protein  33.33 
 
 
129 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00136475  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03993  hypothetical protein  35.04 
 
 
543 aa  42  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1920  hypothetical protein  38.46 
 
 
129 aa  42  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1131  zinc finger SWIM domain protein  37.97 
 
 
266 aa  42  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>