24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_04240 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_04240  hypothetical protein  100 
 
 		 577 aa  1186    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0253557  normal  0.72499 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1131  zinc finger SWIM domain protein  28.33 
 
 		 266 aa  68.9  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0988  zinc finger SWIM domain protein  24.9 
 
 		 567 aa  65.9  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0165  zinc finger SWIM domain protein  30.43 
 
 		 266 aa  65.5  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1485  zinc finger SWIM domain protein  24.16 
 
 		 656 aa  65.1  0.000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2883  zinc finger SWIM domain protein  29.57 
 
 		 273 aa  62.8  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0250  zinc finger SWIM domain protein  26.11 
 
 		 580 aa  61.6  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1036  SNF2 helicase associated domain-containing protein  34.83 
 
 		 832 aa  60.8  0.00000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2013  zinc finger SWIM domain-containing protein  23.83 
 
 		 608 aa  57.8  0.0000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.450022 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1139  zinc finger SWIM domain-containing protein  28.71 
 
 		 550 aa  57.8  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.256553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0283  SNF2-related protein  35.53 
 
 		 1062 aa  57.4  0.0000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0118  zinc finger SWIM domain protein  23.4 
 
 		 848 aa  53.1  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.428898  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1179  hypothetical protein  22.5 
 
 		 570 aa  52.4  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3248  SNF2 helicase associated domain-containing protein  33.33 
 
 		 1084 aa  50.8  0.00007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2005  zinc finger SWIM domain protein  26.15 
 
 		 566 aa  50.4  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000079081  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2701  zinc finger SWIM domain-containing protein  33.33 
 
 		 541 aa  48.1  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.322732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0334  hypothetical protein  25.81 
 
 		 589 aa  48.1  0.0005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4832  zinc finger SWIM domain-containing protein  34.18 
 
 		 140 aa  47.4  0.0008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0942  DNA helicase, SNF2/RAD54 family  35.23 
 
 		 1113 aa  47  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3458  SNF2-related protein  36.36 
 
 		 1077 aa  46.6  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1060  Non-specific serine/threonine protein kinase  35.23 
 
 		 1113 aa  47  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.28014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3868  SNF2-like  30.77 
 
 		 896 aa  45.4  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1815  putative helicase  31.07 
 
 		 1064 aa  44.7  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1766  non-specific serine/threonine protein kinase  32.93 
 
 		 1055 aa  44.7  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>