52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0990 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0990  zinc finger SWIM domain-containing protein  100 
 
 		 611 aa  1229    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1928  SWIM Zn-finger  32.34 
 
 		 613 aa  274  3e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.366569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1653  zinc finger SWIM domain protein  32.02 
 
 		 605 aa  239  9e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.170243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3437  zinc finger SWIM domain-containing protein  40.71 
 
 		 142 aa  105  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0118  zinc finger SWIM domain protein  43.96 
 
 		 848 aa  78.2  0.0000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.428898  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0165  zinc finger SWIM domain protein  35.2 
 
 		 266 aa  71.2  0.00000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0899  hypothetical protein  23.85 
 
 		 641 aa  70.9  0.00000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1131  zinc finger SWIM domain protein  35.43 
 
 		 266 aa  67.4  0.0000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1485  zinc finger SWIM domain protein  36.26 
 
 		 656 aa  65.5  0.000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1179  hypothetical protein  37.8 
 
 		 570 aa  59.3  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3314  SNF2-related protein  33.68 
 
 		 1096 aa  58.2  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0988  zinc finger SWIM domain protein  25 
 
 		 567 aa  57.4  0.0000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1077  zinc finger SWIM domain-containing protein  36.36 
 
 		 142 aa  57  0.0000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.209971 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6037  zinc finger SWIM domain protein  34.72 
 
 		 162 aa  55.5  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2883  zinc finger SWIM domain protein  29.29 
 
 		 273 aa  54.7  0.000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2451  SNF2-related protein  33.75 
 
 		 1087 aa  55.1  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2701  zinc finger SWIM domain-containing protein  29.85 
 
 		 541 aa  54.3  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.322732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2601  SNF2-related protein  44.3 
 
 		 1086 aa  53.9  0.000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2005  zinc finger SWIM domain protein  34.57 
 
 		 566 aa  53.1  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000079081  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0547  hypothetical protein  27.36 
 
 		 640 aa  52.8  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21150  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  37 
 
 		 1143 aa  52.4  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2408  SNF2-related  35.29 
 
 		 1163 aa  52.4  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.644608  normal  0.0402994 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3248  SNF2 helicase associated domain-containing protein  39.77 
 
 		 1084 aa  51.6  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0081  SNF2 family helicase  32.71 
 
 		 1181 aa  51.6  0.00004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1815  putative helicase  29.19 
 
 		 1064 aa  50.4  0.00009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0250  zinc finger SWIM domain protein  22.22 
 
 		 580 aa  48.5  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4832  zinc finger SWIM domain-containing protein  32.12 
 
 		 140 aa  48.1  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0816  zinc finger SWIM domain protein  36 
 
 		 144 aa  48.1  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.397835 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1877  helicase, putative  28.8 
 
 		 1064 aa  48.1  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.609799  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3868  SNF2-like  33.59 
 
 		 896 aa  47.4  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1925  putative helicase  26.51 
 
 		 1064 aa  47  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2499  Non-specific serine/threonine protein kinase  30.77 
 
 		 1082 aa  47  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000806643  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0114  SNF2-related protein  32.61 
 
 		 1080 aa  47  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1618  SWF/SNF family helicase  26.51 
 
 		 1064 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31767  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3239  non-specific serine/threonine protein kinase  31.07 
 
 		 876 aa  45.8  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3526  putative helicase  27.33 
 
 		 1064 aa  45.4  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1851  putative helicase  26.51 
 
 		 1064 aa  45.8  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000970317 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1671  helicase  26.51 
 
 		 1064 aa  45.8  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.480924  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2228  SNF2-related  36.25 
 
 		 1088 aa  45.4  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1804  helicase  26.51 
 
 		 1064 aa  45.8  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1766  non-specific serine/threonine protein kinase  34.44 
 
 		 1055 aa  45.1  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1653  SWF/SNF family helicase  26.51 
 
 		 1064 aa  45.1  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4987  Non-specific serine/threonine protein kinase  31.4 
 
 		 1155 aa  45.1  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.894116  normal  0.0382537 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0053  SNF2-related protein  41.94 
 
 		 1141 aa  44.7  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2647  zinc finger SWIM domain protein  34.21 
 
 		 222 aa  44.7  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.714804 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1983  Non-specific serine/threonine protein kinase  38.46 
 
 		 1089 aa  44.7  0.006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1664  putative helicase  34.85 
 
 		 1150 aa  44.3  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0566301 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0104  SNF2-related protein  37.14 
 
 		 1086 aa  43.9  0.008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1669  non-specific serine/threonine protein kinase  29.07 
 
 		 1068 aa  43.9  0.008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0208  SNF2 helicase-related protein  31.87 
 
 		 1209 aa  43.9  0.009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2013  zinc finger SWIM domain-containing protein  20.6 
 
 		 608 aa  43.9  0.009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.450022 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1317  zinc finger SWIM domain-containing protein  40.24 
 
 		 432 aa  43.5  0.01  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>