37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2883 on replicon NC_012028
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012028  Hlac_2883  zinc finger SWIM domain protein  100 
 
 		 273 aa  551  1e-156  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0165  zinc finger SWIM domain protein  46.99 
 
 		 266 aa  237  2e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1131  zinc finger SWIM domain protein  46.99 
 
 		 266 aa  229  5e-59  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1485  zinc finger SWIM domain protein  36.01 
 
 		 656 aa  168  7e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0118  zinc finger SWIM domain protein  35.69 
 
 		 848 aa  164  1.0000000000000001e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.428898  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04240  hypothetical protein  29.57 
 
 		 577 aa  62.8  0.000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0253557  normal  0.72499 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0988  zinc finger SWIM domain protein  24.36 
 
 		 567 aa  62.4  0.000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1179  hypothetical protein  22.52 
 
 		 570 aa  57.8  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1653  zinc finger SWIM domain protein  35.16 
 
 		 605 aa  57  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.170243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0990  zinc finger SWIM domain-containing protein  29.29 
 
 		 611 aa  54.7  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0899  zinc finger SWIM domain protein  34.45 
 
 		 603 aa  53.5  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.727484  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3437  zinc finger SWIM domain-containing protein  31.25 
 
 		 142 aa  52.4  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2647  zinc finger SWIM domain protein  40.24 
 
 		 222 aa  52.4  0.000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.714804 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3936  zinc finger SWIM domain-containing protein  26.92 
 
 		 601 aa  51.2  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1367  zinc finger SWIM domain-containing protein  30.25 
 
 		 229 aa  49.3  0.00006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.388054  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1928  SWIM Zn-finger  26.07 
 
 		 613 aa  49.3  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.366569  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0283  SNF2-related protein  30.86 
 
 		 1062 aa  49.3  0.00008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2701  zinc finger SWIM domain-containing protein  37.93 
 
 		 541 aa  48.5  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.322732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3248  SNF2 helicase associated domain-containing protein  38.03 
 
 		 1084 aa  47  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0644  zinc finger SWIM domain-containing protein  32.38 
 
 		 229 aa  47  0.0004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8415  zinc finger SWIM domain protein  35.4 
 
 		 240 aa  46.2  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1309  zinc finger SWIM domain-containing protein  31.31 
 
 		 229 aa  45.8  0.0007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2013  zinc finger SWIM domain-containing protein  23.84 
 
 		 608 aa  45.8  0.0007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.450022 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1196  zinc finger SWIM domain-containing protein  30.19 
 
 		 231 aa  45.8  0.0008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0208  SNF2 helicase-related protein  36.78 
 
 		 1209 aa  45.4  0.0009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2005  zinc finger SWIM domain protein  28 
 
 		 566 aa  44.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000079081  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1077  zinc finger SWIM domain-containing protein  33.81 
 
 		 142 aa  44.3  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.209971 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1424  non-specific serine/threonine protein kinase  29.41 
 
 		 1066 aa  43.5  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.106706  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2499  Non-specific serine/threonine protein kinase  26.99 
 
 		 1082 aa  43.5  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000806643  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0250  zinc finger SWIM domain protein  27.2 
 
 		 580 aa  43.5  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0547  hypothetical protein  41.56 
 
 		 640 aa  43.5  0.004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1036  SNF2 helicase associated domain-containing protein  35.37 
 
 		 832 aa  43.1  0.005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1317  zinc finger SWIM domain-containing protein  38.96 
 
 		 432 aa  43.1  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3596  non-specific serine/threonine protein kinase  34.91 
 
 		 1105 aa  42.7  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.270477 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0994  SNF2-related:helicase-like:Zinc finger, SWIM-type  34.83 
 
 		 1142 aa  42.7  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.424079 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0905  non-specific serine/threonine protein kinase  36.36 
 
 		 1120 aa  42.4  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3036  zinc finger SWIM domain-containing protein  29.09 
 
 		 129 aa  42.4  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.57121  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>