53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1131 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_1131  zinc finger SWIM domain protein  100 
 
 
266 aa  530  1e-149  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0165  zinc finger SWIM domain protein  62.41 
 
 
266 aa  337  9.999999999999999e-92  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2883  zinc finger SWIM domain protein  46.99 
 
 
273 aa  229  5e-59  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0118  zinc finger SWIM domain protein  35.18 
 
 
848 aa  134  1.9999999999999998e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.428898  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1485  zinc finger SWIM domain protein  33.96 
 
 
656 aa  126  3e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04240  hypothetical protein  28.33 
 
 
577 aa  68.9  0.00000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0253557  normal  0.72499 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0990  zinc finger SWIM domain-containing protein  35.43 
 
 
611 aa  67  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3437  zinc finger SWIM domain-containing protein  30.28 
 
 
142 aa  62.8  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0899  zinc finger SWIM domain protein  32.65 
 
 
603 aa  62.4  0.000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.727484  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1928  SWIM Zn-finger  32.03 
 
 
613 aa  60.8  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.366569  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1653  zinc finger SWIM domain protein  29.2 
 
 
605 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.170243  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0988  zinc finger SWIM domain protein  33.61 
 
 
567 aa  55.5  0.0000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2013  zinc finger SWIM domain-containing protein  31.63 
 
 
608 aa  54.7  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.450022 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6037  zinc finger SWIM domain protein  34.53 
 
 
162 aa  53.9  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0905  non-specific serine/threonine protein kinase  37.5 
 
 
1120 aa  52.8  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3248  SNF2 helicase associated domain-containing protein  36.59 
 
 
1084 aa  52.8  0.000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1179  hypothetical protein  23.38 
 
 
570 aa  52.4  0.000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2451  SNF2-related protein  35 
 
 
1087 aa  52  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3868  SNF2-like  32.17 
 
 
896 aa  52  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2005  zinc finger SWIM domain protein  30.66 
 
 
566 aa  50.8  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000079081  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0334  hypothetical protein  26.95 
 
 
589 aa  49.7  0.00005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10820  helicase protein  32.73 
 
 
872 aa  48.5  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0664  SNF2-related protein  37.5 
 
 
1125 aa  47.4  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1766  non-specific serine/threonine protein kinase  34.44 
 
 
1055 aa  47.4  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0547  hypothetical protein  37.66 
 
 
640 aa  47  0.0003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0735  hypothetical protein  40.3 
 
 
639 aa  47  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1618  SWF/SNF family helicase  27.59 
 
 
1064 aa  45.8  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31767  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1671  helicase  27.59 
 
 
1064 aa  45.8  0.0008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.480924  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1851  putative helicase  27.59 
 
 
1064 aa  45.8  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000970317 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0208  SNF2 helicase-related protein  35.29 
 
 
1209 aa  45.4  0.0008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1804  helicase  27.59 
 
 
1064 aa  45.8  0.0008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3314  SNF2-related protein  33 
 
 
1096 aa  45.4  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0816  zinc finger SWIM domain protein  33.75 
 
 
144 aa  44.7  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.397835 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3526  putative helicase  27.59 
 
 
1064 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0942  DNA helicase, SNF2/RAD54 family  32.93 
 
 
1113 aa  45.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1653  SWF/SNF family helicase  27.59 
 
 
1064 aa  44.7  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1925  putative helicase  27.59 
 
 
1064 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1060  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.93 
 
 
1113 aa  45.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.28014  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3936  zinc finger SWIM domain-containing protein  35.44 
 
 
601 aa  45.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2110  zinc finger SWIM domain-containing protein  36.11 
 
 
129 aa  45.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.165938  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1877  helicase, putative  27.59 
 
 
1064 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.609799  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1318  zinc finger SWIM domain-containing protein  25.89 
 
 
229 aa  44.3  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.835204  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4317  zinc finger SWIM domain protein  34.15 
 
 
600 aa  44.7  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1669  non-specific serine/threonine protein kinase  27.59 
 
 
1068 aa  44.7  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03993  hypothetical protein  27.78 
 
 
543 aa  44.3  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0250  zinc finger SWIM domain protein  32.32 
 
 
580 aa  43.9  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1317  zinc finger SWIM domain-containing protein  37.5 
 
 
432 aa  43.9  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1920  hypothetical protein  34.18 
 
 
129 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3036  zinc finger SWIM domain-containing protein  30.59 
 
 
129 aa  43.1  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.57121  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1309  zinc finger SWIM domain-containing protein  25.9 
 
 
229 aa  42.7  0.006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2499  Non-specific serine/threonine protein kinase  34.88 
 
 
1082 aa  42.7  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000806643  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1815  putative helicase  27.59 
 
 
1064 aa  42.7  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1672  zinc finger, SWIM-type  30.53 
 
 
131 aa  42.4  0.008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0138295  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>