32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0988 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_0988  zinc finger SWIM domain protein  100 
 
 
567 aa  1172    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1179  hypothetical protein  37.13 
 
 
570 aa  382  1e-105  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2005  zinc finger SWIM domain protein  26.29 
 
 
566 aa  171  4e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000079081  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1143  hypothetical protein  50.34 
 
 
147 aa  155  2.9999999999999998e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0250  zinc finger SWIM domain protein  24.38 
 
 
580 aa  155  2.9999999999999998e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04240  hypothetical protein  24.9 
 
 
577 aa  66.2  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0253557  normal  0.72499 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1485  zinc finger SWIM domain protein  24.55 
 
 
656 aa  63.2  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2883  zinc finger SWIM domain protein  24.36 
 
 
273 aa  62.4  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0165  zinc finger SWIM domain protein  28.93 
 
 
266 aa  60.1  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0990  zinc finger SWIM domain-containing protein  25 
 
 
611 aa  57.8  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0547  hypothetical protein  26.06 
 
 
640 aa  57  0.000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0118  zinc finger SWIM domain protein  23.83 
 
 
848 aa  56.2  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.428898  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1131  zinc finger SWIM domain protein  33.61 
 
 
266 aa  55.5  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3248  SNF2 helicase associated domain-containing protein  31.43 
 
 
1084 aa  53.5  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3437  zinc finger SWIM domain-containing protein  41.89 
 
 
142 aa  53.1  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2013  zinc finger SWIM domain-containing protein  23.14 
 
 
608 aa  52.8  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.450022 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0816  zinc finger SWIM domain protein  38.2 
 
 
144 aa  50.4  0.00009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.397835 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3318  hypothetical protein  30.95 
 
 
152 aa  49.3  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2701  zinc finger SWIM domain-containing protein  23.27 
 
 
541 aa  49.3  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.322732  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03993  hypothetical protein  25.1 
 
 
543 aa  47.8  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2110  zinc finger SWIM domain-containing protein  28.57 
 
 
129 aa  47.8  0.0006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.165938  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1653  zinc finger SWIM domain protein  22.84 
 
 
605 aa  47.4  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.170243  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3113  hypothetical protein  30.95 
 
 
129 aa  46.2  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.327115  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3332  hypothetical protein  30.95 
 
 
129 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3311  hypothetical protein  30.95 
 
 
129 aa  46.2  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0475736  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3036  zinc finger SWIM domain-containing protein  29.17 
 
 
129 aa  46.2  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.57121  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3359  hypothetical protein  30.95 
 
 
129 aa  46.2  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.852787  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3936  zinc finger SWIM domain-containing protein  25.21 
 
 
601 aa  45.1  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0419  zinc finger SWIM domain protein  28.57 
 
 
376 aa  44.7  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0551  hypothetical protein  27.93 
 
 
701 aa  44.7  0.005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1036  SNF2 helicase associated domain-containing protein  38.36 
 
 
832 aa  43.9  0.007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1920  hypothetical protein  29.76 
 
 
129 aa  43.5  0.01  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>