25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0735 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0735  hypothetical protein  100 
 
 
639 aa  1285    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0899  hypothetical protein  29.37 
 
 
641 aa  254  4.0000000000000004e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1893  hypothetical protein  31.31 
 
 
507 aa  224  4e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00616409  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1317  zinc finger SWIM domain-containing protein  28.96 
 
 
432 aa  155  2e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2013  zinc finger SWIM domain-containing protein  24.69 
 
 
608 aa  103  9e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.450022 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1324  hypothetical protein  32.46 
 
 
184 aa  97.4  7e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1672  zinc finger, SWIM-type  37.5 
 
 
131 aa  59.3  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0138295  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0942  DNA helicase, SNF2/RAD54 family  31.82 
 
 
1113 aa  53.1  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1060  Non-specific serine/threonine protein kinase  31.82 
 
 
1113 aa  53.1  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.28014  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0118  zinc finger SWIM domain protein  39.13 
 
 
848 aa  52.4  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.428898  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2601  SNF2-related protein  38.36 
 
 
1086 aa  51.2  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0905  non-specific serine/threonine protein kinase  37.5 
 
 
1120 aa  50.1  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0285  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.58 
 
 
1102 aa  49.7  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1485  zinc finger SWIM domain protein  38.36 
 
 
656 aa  48.1  0.0005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0114  SNF2-related protein  34.12 
 
 
1080 aa  47  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1131  zinc finger SWIM domain protein  40.3 
 
 
266 aa  47  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0334  hypothetical protein  22.07 
 
 
589 aa  45.8  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10820  helicase protein  29.21 
 
 
872 aa  45.8  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30090  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  31.87 
 
 
1227 aa  46.2  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0208  SNF2 helicase-related protein  36.36 
 
 
1209 aa  46.2  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3931  SNF2-related  43.14 
 
 
1178 aa  45.4  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21150  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  30.47 
 
 
1143 aa  45.1  0.004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0053  SNF2-related protein  31.91 
 
 
1141 aa  45.1  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0516  Non-specific serine/threonine protein kinase  34.25 
 
 
1104 aa  44.3  0.007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0578806 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0770  SNF2-related protein  32.93 
 
 
1081 aa  44.3  0.008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>