23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0989 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_0989  hypothetical protein  100 
 
 		 480 aa  962    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.00407781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0400  hypothetical protein  37.5 
 
 		 480 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0338221  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3092  hypothetical protein  37.42 
 
 		 512 aa  271  2.9999999999999997e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3739  hypothetical protein  37.05 
 
 		 505 aa  267  2.9999999999999995e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4191  hypothetical protein  34.1 
 
 		 478 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.554467  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1856  hypothetical protein  34.3 
 
 		 479 aa  234  3e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1786  hypothetical protein  34.3 
 
 		 479 aa  233  5e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.766735  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0644  hypothetical protein  32.5 
 
 		 479 aa  231  2e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.426994  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3863  hypothetical protein  32.03 
 
 		 476 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00584301  normal  0.146165 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2679  hypothetical protein  30.16 
 
 		 503 aa  194  2e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0387  hypothetical protein  31.08 
 
 		 512 aa  189  8e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0311  hypothetical protein  30.1 
 
 		 513 aa  188  2e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.353136 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0355  hypothetical protein  29.9 
 
 		 513 aa  186  8e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.335502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0142  hypothetical protein  31.28 
 
 		 474 aa  181  2.9999999999999997e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.000223018  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5784  hypothetical protein  28.9 
 
 		 468 aa  159  7e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2146  hypothetical protein  31.89 
 
 		 459 aa  135  9.999999999999999e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.107944  normal  0.048736 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1436  hypothetical protein  30.05 
 
 		 448 aa  102  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2038  hypothetical protein  27.61 
 
 		 466 aa  100  6e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.561134  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2407  hypothetical protein  27.51 
 
 		 431 aa  95.5  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2013  zinc finger SWIM domain-containing protein  24.6 
 
 		 608 aa  81.3  0.00000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.450022 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1007  hypothetical protein  30.23 
 
 		 386 aa  79.7  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.450732  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1139  zinc finger SWIM domain-containing protein  25.27 
 
 		 550 aa  57.8  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.256553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1010  hypothetical protein  31.73 
 
 		 120 aa  54.7  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000066035  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>