21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR1856 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009505  BOV_1786  hypothetical protein  99.79 
 
 		 479 aa  974    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.766735  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1856  hypothetical protein  100 
 
 		 479 aa  977    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0644  hypothetical protein  63.6 
 
 		 479 aa  630  1e-179  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.426994  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4191  hypothetical protein  57.02 
 
 		 478 aa  553  1e-156  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.554467  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3863  hypothetical protein  53.25 
 
 		 476 aa  491  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00584301  normal  0.146165 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3092  hypothetical protein  48.54 
 
 		 512 aa  457  1e-127  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3739  hypothetical protein  47.91 
 
 		 505 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0400  hypothetical protein  45.09 
 
 		 480 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0338221  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0142  hypothetical protein  37.39 
 
 		 474 aa  264  2e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.000223018  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0989  hypothetical protein  34.3 
 
 		 480 aa  234  3e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.00407781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2146  hypothetical protein  35.86 
 
 		 459 aa  229  1e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.107944  normal  0.048736 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0311  hypothetical protein  34.08 
 
 		 513 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.353136 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0355  hypothetical protein  34.07 
 
 		 513 aa  219  1e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.335502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0387  hypothetical protein  33.13 
 
 		 512 aa  218  2e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2679  hypothetical protein  31.69 
 
 		 503 aa  208  1e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5784  hypothetical protein  27.48 
 
 		 468 aa  139  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2038  hypothetical protein  23.84 
 
 		 466 aa  90.1  7e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.561134  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2407  hypothetical protein  23.86 
 
 		 431 aa  85.9  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1436  hypothetical protein  24.19 
 
 		 448 aa  80.1  0.00000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1010  hypothetical protein  30.91 
 
 		 120 aa  59.7  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000066035  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1007  hypothetical protein  21.95 
 
 		 386 aa  44.7  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.450732  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>