24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0400 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0400  hypothetical protein  100 
 
 		 480 aa  947    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0338221  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3092  hypothetical protein  50.73 
 
 		 512 aa  452  1.0000000000000001e-126  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3739  hypothetical protein  49.9 
 
 		 505 aa  449  1e-125  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4191  hypothetical protein  50.1 
 
 		 478 aa  449  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.554467  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1856  hypothetical protein  45.09 
 
 		 479 aa  416  9.999999999999999e-116  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1786  hypothetical protein  45.09 
 
 		 479 aa  414  1e-114  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.766735  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0644  hypothetical protein  44.58 
 
 		 479 aa  411  1e-113  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.426994  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3863  hypothetical protein  46.56 
 
 		 476 aa  392  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00584301  normal  0.146165 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0989  hypothetical protein  37.5 
 
 		 480 aa  281  2e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.00407781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0142  hypothetical protein  38.36 
 
 		 474 aa  263  6.999999999999999e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.000223018  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0387  hypothetical protein  39.71 
 
 		 512 aa  241  2e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2679  hypothetical protein  38.38 
 
 		 503 aa  240  5e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0355  hypothetical protein  38.16 
 
 		 513 aa  237  4e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.335502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0311  hypothetical protein  37.96 
 
 		 513 aa  235  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.353136 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2146  hypothetical protein  38.24 
 
 		 459 aa  231  2e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.107944  normal  0.048736 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5784  hypothetical protein  25.36 
 
 		 468 aa  129  1.0000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2038  hypothetical protein  27.46 
 
 		 466 aa  97.8  4e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.561134  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2407  hypothetical protein  27.27 
 
 		 431 aa  95.9  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1436  hypothetical protein  28 
 
 		 448 aa  95.5  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1010  hypothetical protein  33.04 
 
 		 120 aa  58.5  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000066035  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1007  hypothetical protein  28.02 
 
 		 386 aa  57.8  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.450732  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03993  hypothetical protein  25.94 
 
 		 543 aa  48.5  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2013  zinc finger SWIM domain-containing protein  24.86 
 
 		 608 aa  48.1  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.450022 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05420  hypothetical protein  28.88 
 
 		 291 aa  47  0.0008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.508748  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>