More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfl142 on replicon NC_006055
Organism: Mesoplasma florum L1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006055  Mfl142  preprotein translocase subunit SecY  100 
 
 
486 aa  972    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.779959  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0677  preprotein translocase subunit SecY  69.48 
 
 
482 aa  656    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5175  preprotein translocase subunit SecY  39.61 
 
 
433 aa  301  1e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000485174  unclonable  4.1263e-25 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0125  preprotein translocase subunit SecY  39.82 
 
 
433 aa  301  2e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00395698  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0151  preprotein translocase subunit SecY  39.74 
 
 
433 aa  301  2e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0158065  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0130  preprotein translocase subunit SecY  39.74 
 
 
433 aa  300  4e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0066731  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0130  preprotein translocase subunit SecY  39.74 
 
 
433 aa  300  4e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00164171  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0126  preprotein translocase subunit SecY  39.74 
 
 
433 aa  300  4e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0265701  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0124  preprotein translocase subunit SecY  39.74 
 
 
433 aa  300  4e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.64549  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0130  preprotein translocase subunit SecY  39.74 
 
 
433 aa  300  4e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00952483  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0161  preprotein translocase subunit SecY  39.74 
 
 
433 aa  300  4e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000198533  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2381  preprotein translocase subunit SecY  37.73 
 
 
439 aa  295  2e-78  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00042664  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2691  preprotein translocase, SecY subunit  38.67 
 
 
430 aa  293  4e-78  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.803147  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2469  preprotein translocase subunit SecY  37.47 
 
 
434 aa  290  5.0000000000000004e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0545369  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2412  preprotein translocase subunit SecY  37.61 
 
 
434 aa  289  8e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00625491  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2766  preprotein translocase subunit SecY  36.95 
 
 
434 aa  286  4e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00224272  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0245  preprotein translocase subunit SecY  34.92 
 
 
471 aa  286  4e-76  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2747  preprotein translocase subunit SecY  37.03 
 
 
434 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.787541  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2742  preprotein translocase subunit SecY  37.25 
 
 
434 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.53667e-23 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2545  preprotein translocase subunit SecY  37.25 
 
 
434 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000778926 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2503  preprotein translocase subunit SecY  37.03 
 
 
434 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000332806  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2547  preprotein translocase subunit SecY  37.03 
 
 
434 aa  281  1e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0673869  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2734  preprotein translocase subunit SecY  37.03 
 
 
434 aa  281  1e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.356112  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0124  preprotein translocase subunit SecY  39.08 
 
 
433 aa  282  1e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000327784  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0614  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  38.5 
 
 
448 aa  281  2e-74  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00397866  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2298  preprotein translocase subunit SecY  37.98 
 
 
430 aa  280  3e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2257  preprotein translocase subunit SecY  37.98 
 
 
430 aa  280  3e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0110363  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1463  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  36.22 
 
 
438 aa  279  8e-74  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000110167  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0127  preprotein translocase subunit SecY  37.98 
 
 
430 aa  278  2e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1887  preprotein translocase subunit SecY  36.53 
 
 
431 aa  276  7e-73  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.729916  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0078  preprotein translocase subunit SecY  36.24 
 
 
434 aa  275  1.0000000000000001e-72  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0917629  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2790  preprotein translocase subunit SecY  36.95 
 
 
434 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000168645  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0310  preprotein translocase subunit SecY  38.04 
 
 
431 aa  273  7e-72  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  unclonable  8.823840000000001e-28 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1843  preprotein translocase subunit SecY  36.56 
 
 
434 aa  271  1e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.019643  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0131  preprotein translocase subunit SecY  37.5 
 
 
430 aa  271  2e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.129381  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1811  preprotein translocase subunit SecY  38.22 
 
 
430 aa  270  5.9999999999999995e-71  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.741103  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf420  preprotein translocase subunit SecY  31.3 
 
 
490 aa  268  2e-70  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0442  preprotein translocase subunit SecY  36.59 
 
 
429 aa  264  3e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0215  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  35.4 
 
 
444 aa  260  5.0000000000000005e-68  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1847  preprotein translocase subunit SecY  36.59 
 
 
441 aa  249  7e-65  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.838745  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1931  preprotein translocase subunit SecY  34.78 
 
 
445 aa  246  4.9999999999999997e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.776856  normal  0.537809 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1374  preprotein translocase, SecY subunit  34.99 
 
 
444 aa  245  9.999999999999999e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.285774  normal  0.105212 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0979  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  32.52 
 
 
447 aa  243  7.999999999999999e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000479753  hitchhiker  0.00549319 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0886  preprotein translocase subunit SecY  35.48 
 
 
418 aa  241  2e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.609907  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0973  preprotein translocase subunit SecY  32.88 
 
 
428 aa  241  2e-62  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2459  preprotein translocase, SecY subunit  33.04 
 
 
447 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2181  preprotein translocase, SecY subunit  33.04 
 
 
447 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.318083 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0234  preprotein translocase subunit SecY  33.79 
 
 
438 aa  240  4e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2440  preprotein translocase subunit SecY  32.95 
 
 
420 aa  240  4e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0560  preprotein translocase, SecY subunit  35.81 
 
 
442 aa  239  5.999999999999999e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1165  preprotein translocase, SecY subunit  33.41 
 
 
450 aa  238  1e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000330141  normal  0.11389 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0231  preprotein translocase subunit SecY  33.26 
 
 
438 aa  238  1e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.832784  normal  0.264762 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0245  preprotein translocase subunit SecY  33.03 
 
 
424 aa  238  2e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.101058  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2756  preprotein translocase, SecY subunit  34.23 
 
 
443 aa  238  2e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.373135  normal  0.477854 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1310  preprotein translocase subunit SecY  34.68 
 
 
436 aa  238  2e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.206198  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1976  preprotein translocase subunit SecY  34.31 
 
 
446 aa  237  3e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.923807  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1374  preprotein translocase subunit SecY  34.68 
 
 
431 aa  238  3e-61  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0289241  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4363  preprotein translocase subunit SecY  33.56 
 
 
437 aa  238  3e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0120386  normal  0.169527 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2313  preprotein translocase subunit SecY  33.41 
 
 
421 aa  238  3e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0367996  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1831  preprotein translocase subunit SecY  32.05 
 
 
443 aa  237  4e-61  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.321149  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2144  preprotein translocase, SecY subunit  32.82 
 
 
447 aa  237  4e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0728  preprotein translocase, SecY subunit  34.72 
 
 
429 aa  237  4e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00054251  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2198  preprotein translocase, SecY subunit  33.26 
 
 
448 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0470035  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1856  preprotein translocase, SecY subunit  34.37 
 
 
446 aa  236  5.0000000000000005e-61  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0112849  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2209  preprotein translocase subunit SecY  33.18 
 
 
443 aa  236  7e-61  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000211329  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4006  preprotein translocase, SecY subunit  32.82 
 
 
450 aa  236  9e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000605815  hitchhiker  0.000026914 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2214  preprotein translocase subunit SecY  32.8 
 
 
439 aa  236  9e-61  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.180024  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1726  preprotein translocase, SecY subunit  32.33 
 
 
435 aa  236  1.0000000000000001e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000716119  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1213  preprotein translocase subunit SecY  33.86 
 
 
446 aa  235  1.0000000000000001e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0333  preprotein translocase, SecY subunit  33.56 
 
 
445 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.110878  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1046  preprotein translocase subunit SecY  32.21 
 
 
441 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.303562  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0857  preprotein translocase subunit SecY  33.85 
 
 
442 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09050  preprotein translocase subunit SecY  33.85 
 
 
442 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.224184 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1062  preprotein translocase subunit SecY  32.21 
 
 
441 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.160681  normal  0.323313 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1074  preprotein translocase subunit SecY  32.21 
 
 
441 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0309  preprotein translocase subunit SecY  32.3 
 
 
443 aa  234  3e-60  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0197098  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1450  preprotein translocase subunit SecY  33.41 
 
 
446 aa  234  3e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.337945  normal  0.16685 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3985  preprotein translocase, SecY subunit  33.33 
 
 
448 aa  233  4.0000000000000004e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00342615  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1928  preprotein translocase, SecY subunit  33.79 
 
 
445 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1176  preprotein translocase subunit SecY  33.86 
 
 
446 aa  233  4.0000000000000004e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0379017  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0646  preprotein translocase, SecY subunit  33.93 
 
 
444 aa  233  5e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.617938  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4528  preprotein translocase subunit SecY  33.93 
 
 
444 aa  233  5e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.447133  normal  0.242735 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2986  preprotein translocase subunit SecY  33.41 
 
 
448 aa  233  5e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.135734  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2379  preprotein translocase subunit SecY  34.01 
 
 
425 aa  233  6e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0780  preprotein translocase subunit SecY  34.84 
 
 
457 aa  233  6e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4934  preprotein translocase, SecY subunit  33.86 
 
 
439 aa  233  8.000000000000001e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000290796  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1953  preprotein translocase subunit SecY  33.94 
 
 
447 aa  232  9e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0862  preprotein translocase, SecY subunit  31 
 
 
438 aa  232  1e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.148817  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1006  preprotein translocase subunit SecY  33.62 
 
 
446 aa  232  1e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.38875  hitchhiker  0.00669682 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2135  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  31.44 
 
 
428 aa  232  1e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.233384  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2694  preprotein translocase subunit SecY  34.01 
 
 
425 aa  232  1e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0709  preprotein translocase subunit SecY  32.13 
 
 
437 aa  231  2e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000243192  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5059  preprotein translocase subunit SecY  33.55 
 
 
442 aa  231  2e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000898122  normal  0.284155 
 
 
-
 
NC_002620  TC0797  preprotein translocase subunit SecY  33.11 
 
 
457 aa  231  3e-59  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.14214  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0622  preprotein translocase, SecY subunit  33.26 
 
 
444 aa  231  3e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.925436 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2038  preprotein translocase subunit SecY  33.94 
 
 
447 aa  231  3e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3721  preprotein translocase subunit SecY  34.32 
 
 
439 aa  231  3e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0507  preprotein translocase subunit SecY  33.26 
 
 
443 aa  230  4e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0640452  normal  0.0135524 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4729  preprotein translocase subunit SecY  33.26 
 
 
443 aa  230  4e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0376135  normal  0.430849 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0446  preprotein translocase subunit SecY  32.97 
 
 
443 aa  230  5e-59  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000813945  hitchhiker  0.000170824 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>