More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0310 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008530  LGAS_0310  preprotein translocase subunit SecY  100 
 
 
431 aa  856    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  unclonable  8.823840000000001e-28 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1463  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  63.81 
 
 
438 aa  577  1.0000000000000001e-163  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000110167  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0215  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  58.93 
 
 
444 aa  527  1e-148  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0614  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  59.04 
 
 
448 aa  494  1e-139  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00397866  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2381  preprotein translocase subunit SecY  52.09 
 
 
439 aa  469  1.0000000000000001e-131  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00042664  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0078  preprotein translocase subunit SecY  53.5 
 
 
434 aa  466  9.999999999999999e-131  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0917629  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1887  preprotein translocase subunit SecY  52.09 
 
 
431 aa  451  1.0000000000000001e-126  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.729916  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0130  preprotein translocase subunit SecY  46.68 
 
 
433 aa  385  1e-106  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0066731  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0161  preprotein translocase subunit SecY  46.68 
 
 
433 aa  385  1e-106  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000198533  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0130  preprotein translocase subunit SecY  46.68 
 
 
433 aa  385  1e-106  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00164171  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0126  preprotein translocase subunit SecY  46.68 
 
 
433 aa  385  1e-106  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0265701  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0124  preprotein translocase subunit SecY  46.68 
 
 
433 aa  385  1e-106  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.64549  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0151  preprotein translocase subunit SecY  46.68 
 
 
433 aa  386  1e-106  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0158065  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0130  preprotein translocase subunit SecY  46.68 
 
 
433 aa  385  1e-106  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00952483  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0131  preprotein translocase subunit SecY  48.28 
 
 
430 aa  387  1e-106  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.129381  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5175  preprotein translocase subunit SecY  46.68 
 
 
433 aa  386  1e-106  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000485174  unclonable  4.1263e-25 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0125  preprotein translocase subunit SecY  46.68 
 
 
433 aa  387  1e-106  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00395698  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0127  preprotein translocase subunit SecY  48.05 
 
 
430 aa  388  1e-106  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2412  preprotein translocase subunit SecY  46.59 
 
 
434 aa  385  1e-105  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00625491  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0124  preprotein translocase subunit SecY  47.61 
 
 
433 aa  383  1e-105  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000327784  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2766  preprotein translocase subunit SecY  45.91 
 
 
434 aa  381  1e-104  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00224272  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2547  preprotein translocase subunit SecY  45.56 
 
 
434 aa  380  1e-104  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0673869  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2503  preprotein translocase subunit SecY  45.56 
 
 
434 aa  381  1e-104  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000332806  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2469  preprotein translocase subunit SecY  45.56 
 
 
434 aa  380  1e-104  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0545369  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2298  preprotein translocase subunit SecY  46.31 
 
 
430 aa  379  1e-104  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2734  preprotein translocase subunit SecY  45.56 
 
 
434 aa  380  1e-104  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.356112  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2747  preprotein translocase subunit SecY  45.56 
 
 
434 aa  380  1e-104  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.787541  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2742  preprotein translocase subunit SecY  45.56 
 
 
434 aa  380  1e-104  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.53667e-23 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2545  preprotein translocase subunit SecY  45.79 
 
 
434 aa  381  1e-104  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000778926 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2257  preprotein translocase subunit SecY  46.31 
 
 
430 aa  379  1e-104  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0110363  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1811  preprotein translocase subunit SecY  45.85 
 
 
430 aa  374  1e-102  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.741103  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2790  preprotein translocase subunit SecY  45.56 
 
 
434 aa  372  1e-102  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000168645  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1843  preprotein translocase subunit SecY  45.31 
 
 
434 aa  370  1e-101  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.019643  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2691  preprotein translocase, SecY subunit  39.45 
 
 
430 aa  317  4e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.803147  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0245  preprotein translocase subunit SecY  40.05 
 
 
424 aa  311  2e-83  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.101058  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0235  preprotein translocase subunit SecY  38.81 
 
 
419 aa  307  2.0000000000000002e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00849669  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1726  preprotein translocase, SecY subunit  39.59 
 
 
435 aa  307  2.0000000000000002e-82  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000716119  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0306  preprotein translocase subunit SecY  40.05 
 
 
421 aa  306  4.0000000000000004e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0894763  normal  0.194972 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2313  preprotein translocase subunit SecY  38.81 
 
 
421 aa  306  4.0000000000000004e-82  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0367996  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0442  preprotein translocase subunit SecY  39.82 
 
 
429 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1504  preprotein translocase subunit SecY  40.05 
 
 
419 aa  303  3.0000000000000004e-81  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2135  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  39.55 
 
 
428 aa  300  3e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.233384  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0778  preprotein translocase, SecY subunit  38.86 
 
 
430 aa  296  4e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000100686  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2440  preprotein translocase subunit SecY  37.39 
 
 
420 aa  295  9e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0886  preprotein translocase subunit SecY  38.27 
 
 
418 aa  291  2e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.609907  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0142  preprotein translocase, SecY subunit  45.27 
 
 
355 aa  290  3e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.58947e-61 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0867  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  39.23 
 
 
442 aa  289  5.0000000000000004e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000152006  hitchhiker  0.00837403 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0517  preprotein translocase, SecY subunit  39.08 
 
 
443 aa  289  7e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.120445  unclonable  0.0000000000266535 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0347  preprotein translocase, SecY subunit  39.08 
 
 
443 aa  289  7e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.742267  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1931  preprotein translocase subunit SecY  39.41 
 
 
445 aa  288  9e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.776856  normal  0.537809 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1000  preprotein translocase, SecY subunit  38.07 
 
 
419 aa  287  2.9999999999999996e-76  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00382146  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1366  preprotein translocase subunit SecY  37.3 
 
 
437 aa  286  4e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000833152  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0622  preprotein translocase, SecY subunit  37.44 
 
 
444 aa  286  4e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.925436 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0953  preprotein translocase subunit SecY  37.42 
 
 
435 aa  286  4e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0415377  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2986  preprotein translocase subunit SecY  37.1 
 
 
448 aa  285  1.0000000000000001e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.135734  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4006  preprotein translocase, SecY subunit  38.18 
 
 
450 aa  284  2.0000000000000002e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000605815  hitchhiker  0.000026914 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1165  preprotein translocase, SecY subunit  38.6 
 
 
450 aa  285  2.0000000000000002e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000330141  normal  0.11389 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1384  preprotein translocase subunit SecY  38.57 
 
 
443 aa  284  3.0000000000000004e-75  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.378018 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1565  preprotein translocase subunit SecY  38.34 
 
 
443 aa  283  3.0000000000000004e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.112443  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2633  preprotein translocase, SecY subunit  37 
 
 
431 aa  283  4.0000000000000003e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3308  preprotein translocase subunit SecY  36.75 
 
 
435 aa  283  4.0000000000000003e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000602472 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1086  preprotein translocase subunit SecY  37.05 
 
 
435 aa  282  7.000000000000001e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.135642  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3647  preprotein translocase, SecY subunit  37.22 
 
 
442 aa  282  9e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00118801  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2837  preprotein translocase subunit SecY  36.32 
 
 
435 aa  281  2e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1856  preprotein translocase, SecY subunit  36.44 
 
 
446 aa  281  2e-74  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0112849  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1926  preprotein translocase, SecY subunit  38.13 
 
 
449 aa  280  3e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.796685  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1745  preprotein translocase subunit SecY  37.19 
 
 
437 aa  280  3e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.261464  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0677  preprotein translocase subunit SecY  38.86 
 
 
482 aa  280  4e-74  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1953  preprotein translocase subunit SecY  38.64 
 
 
447 aa  279  7e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5144  preprotein translocase, SecY subunit  36 
 
 
437 aa  279  8e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.552257 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1118  preprotein translocase subunit SecY  37.33 
 
 
428 aa  278  1e-73  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.348488  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3985  preprotein translocase, SecY subunit  37.61 
 
 
448 aa  278  1e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00342615  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1926  preprotein translocase subunit SecY  38.64 
 
 
447 aa  278  1e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.228643  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2038  preprotein translocase subunit SecY  38.64 
 
 
447 aa  278  1e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3318  preprotein translocase subunit SecY  38.1 
 
 
441 aa  278  2e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.150394  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0425  preprotein translocase subunit SecY  38.23 
 
 
437 aa  277  3e-73  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.65116  normal  0.157207 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2158  preprotein translocase, SecY subunit  36.22 
 
 
426 aa  277  3e-73  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00470545  normal  0.460281 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4363  preprotein translocase subunit SecY  37.61 
 
 
437 aa  276  4e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0120386  normal  0.169527 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1206  preprotein translocase SecY subunit  37.98 
 
 
457 aa  276  4e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.533641  normal  0.0165275 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4934  preprotein translocase, SecY subunit  37.03 
 
 
439 aa  276  5e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000290796  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0728  preprotein translocase, SecY subunit  37.36 
 
 
429 aa  276  5e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00054251  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3686  preprotein translocase, SecY subunit  36.54 
 
 
441 aa  276  6e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.000792509  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2626  preprotein translocase subunit SecY  35.51 
 
 
442 aa  276  7e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.512513  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0721  preprotein translocase subunit SecY  36.65 
 
 
435 aa  276  7e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3885  preprotein translocase subunit SecY  36.59 
 
 
437 aa  276  7e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0708  preprotein translocase, SecY subunit  37.28 
 
 
438 aa  275  8e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.274333 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0080  preprotein translocase subunit SecY  39.11 
 
 
441 aa  275  8e-73  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0404503  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6594  preprotein translocase subunit SecY  36.36 
 
 
436 aa  275  1.0000000000000001e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0973  preprotein translocase subunit SecY  37.98 
 
 
428 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2198  preprotein translocase, SecY subunit  36.41 
 
 
448 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0470035  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5050  preprotein translocase subunit SecY  37.18 
 
 
444 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.478224  normal  0.981585 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0326  preprotein translocase subunit SecY  35.59 
 
 
437 aa  275  1.0000000000000001e-72  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000568003 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0862  preprotein translocase, SecY subunit  35.83 
 
 
438 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.148817  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0339  preprotein translocase subunit SecY  37.05 
 
 
440 aa  274  3e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000142446  unclonable  0.0000000706243 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0646  preprotein translocase subunit SecY  35.71 
 
 
435 aa  274  3e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00379524  hitchhiker  0.000000811889 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0441  preprotein translocase subunit SecY  38.5 
 
 
443 aa  274  3e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1374  preprotein translocase subunit SecY  37.53 
 
 
431 aa  273  3e-72  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0289241  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0680  preprotein translocase subunit SecY  37 
 
 
437 aa  273  3e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1106  protein translocase subunit SecY/sec61 alpha  35.54 
 
 
438 aa  273  4.0000000000000004e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.105713 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4301  preprotein translocase, SecY subunit  35.63 
 
 
432 aa  273  6e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>