More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0677 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007633  MCAP_0677  preprotein translocase subunit SecY  100 
 
 		 482 aa  950    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl142  preprotein translocase subunit SecY  69.48 
 
 		 486 aa  627  1e-178  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.779959  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2381  preprotein translocase subunit SecY  39.4 
 
 		 439 aa  307  4.0000000000000004e-82  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00042664  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0245  preprotein translocase subunit SecY  36.04 
 
 		 471 aa  305  2.0000000000000002e-81  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2691  preprotein translocase, SecY subunit  39.26 
 
 		 430 aa  302  8.000000000000001e-81  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.803147  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5175  preprotein translocase subunit SecY  40 
 
 		 433 aa  302  1e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000485174  unclonable  4.1263e-25 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0125  preprotein translocase subunit SecY  39.77 
 
 		 433 aa  301  2e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00395698  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0151  preprotein translocase subunit SecY  40.14 
 
 		 433 aa  300  3e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0158065  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0130  preprotein translocase subunit SecY  39.91 
 
 		 433 aa  300  6e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0066731  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0130  preprotein translocase subunit SecY  39.91 
 
 		 433 aa  300  6e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00164171  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0126  preprotein translocase subunit SecY  39.91 
 
 		 433 aa  300  6e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0265701  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0124  preprotein translocase subunit SecY  39.91 
 
 		 433 aa  300  6e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.64549  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0130  preprotein translocase subunit SecY  39.91 
 
 		 433 aa  300  6e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00952483  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0161  preprotein translocase subunit SecY  39.91 
 
 		 433 aa  300  6e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000198533  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2469  preprotein translocase subunit SecY  37.67 
 
 		 434 aa  293  3e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0545369  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0127  preprotein translocase subunit SecY  39.09 
 
 		 430 aa  294  3e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2766  preprotein translocase subunit SecY  37.62 
 
 		 434 aa  291  1e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00224272  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0078  preprotein translocase subunit SecY  38.14 
 
 		 434 aa  291  2e-77  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0917629  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2503  preprotein translocase subunit SecY  38.26 
 
 		 434 aa  291  2e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000332806  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2412  preprotein translocase subunit SecY  38.03 
 
 		 434 aa  291  2e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00625491  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2742  preprotein translocase subunit SecY  38.26 
 
 		 434 aa  290  3e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.53667e-23 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2545  preprotein translocase subunit SecY  38.26 
 
 		 434 aa  290  4e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000778926 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1463  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  38.02 
 
 		 438 aa  290  4e-77  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000110167  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0131  preprotein translocase subunit SecY  39.35 
 
 		 430 aa  290  4e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.129381  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0310  preprotein translocase subunit SecY  38.86 
 
 		 431 aa  290  4e-77  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  8.823840000000001e-28 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2747  preprotein translocase subunit SecY  38.03 
 
 		 434 aa  289  8e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.787541  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0124  preprotein translocase subunit SecY  39.53 
 
 		 433 aa  288  1e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000327784  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2547  preprotein translocase subunit SecY  37.62 
 
 		 434 aa  287  4e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0673869  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2734  preprotein translocase subunit SecY  37.62 
 
 		 434 aa  287  4e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.356112  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2298  preprotein translocase subunit SecY  38.43 
 
 		 430 aa  286  5e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2257  preprotein translocase subunit SecY  38.43 
 
 		 430 aa  286  5e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0110363  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1887  preprotein translocase subunit SecY  38.9 
 
 		 431 aa  286  5e-76  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.729916  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0614  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  39.4 
 
 		 448 aa  284  2.0000000000000002e-75  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00397866  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2790  preprotein translocase subunit SecY  37.62 
 
 		 434 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000168645  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1811  preprotein translocase subunit SecY  38.66 
 
 		 430 aa  276  5e-73  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.741103  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1843  preprotein translocase subunit SecY  36.51 
 
 		 434 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.019643  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf420  preprotein translocase subunit SecY  35.59 
 
 		 490 aa  274  3e-72  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0215  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  36.16 
 
 		 444 aa  268  1e-70  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1374  preprotein translocase subunit SecY  36.4 
 
 		 431 aa  265  1e-69  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0289241  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0979  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  35.63 
 
 		 447 aa  262  8e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000479753  hitchhiker  0.00549319 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1726  preprotein translocase, SecY subunit  34.65 
 
 		 435 aa  258  2e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000716119  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0560  preprotein translocase, SecY subunit  37.1 
 
 		 442 aa  257  4e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1312  preprotein translocase subunit SecY  36.4 
 
 		 431 aa  256  7e-67  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000457849  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0973  preprotein translocase subunit SecY  36.61 
 
 		 428 aa  256  8e-67  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1165  preprotein translocase, SecY subunit  36.23 
 
 		 450 aa  254  2.0000000000000002e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000330141  normal  0.11389 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1006  preprotein translocase subunit SecY  35.84 
 
 		 446 aa  253  5.000000000000001e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.38875  hitchhiker  0.00669682 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4006  preprotein translocase, SecY subunit  36.23 
 
 		 450 aa  253  5.000000000000001e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000605815  hitchhiker  0.000026914 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2440  preprotein translocase subunit SecY  34.01 
 
 		 420 aa  252  9.000000000000001e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0305  preprotein translocase subunit SecY  37.61 
 
 		 453 aa  252  9.000000000000001e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.398461 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1374  preprotein translocase, SecY subunit  35.86 
 
 		 444 aa  252  1e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.285774  normal  0.105212 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0333  preprotein translocase, SecY subunit  34.6 
 
 		 445 aa  251  2e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.110878  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0442  preprotein translocase subunit SecY  36.87 
 
 		 429 aa  251  2e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0245  preprotein translocase subunit SecY  34.34 
 
 		 424 aa  251  3e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.101058  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1928  preprotein translocase, SecY subunit  35.39 
 
 		 445 aa  251  3e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0780  preprotein translocase subunit SecY  36.04 
 
 		 457 aa  248  1e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2214  preprotein translocase subunit SecY  33.98 
 
 		 439 aa  248  2e-64  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.180024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2313  preprotein translocase subunit SecY  34.91 
 
 		 421 aa  248  2e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0367996  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2181  preprotein translocase, SecY subunit  32.75 
 
 		 447 aa  246  6e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.318083 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2459  preprotein translocase, SecY subunit  32.75 
 
 		 447 aa  246  6e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04180  preprotein translocase subunit SecY  34.91 
 
 		 435 aa  246  6e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.132635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2756  preprotein translocase, SecY subunit  35.03 
 
 		 443 aa  246  6.999999999999999e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.373135  normal  0.477854 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2144  preprotein translocase, SecY subunit  32.39 
 
 		 447 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1450  preprotein translocase subunit SecY  35.4 
 
 		 446 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.337945  normal  0.16685 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2198  preprotein translocase, SecY subunit  33.04 
 
 		 448 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0470035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1118  preprotein translocase subunit SecY  36.43 
 
 		 428 aa  244  1.9999999999999999e-63  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.348488  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0234  preprotein translocase subunit SecY  34.86 
 
 		 438 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0231  preprotein translocase subunit SecY  34.86 
 
 		 438 aa  244  3e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.832784  normal  0.264762 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0235  preprotein translocase subunit SecY  34.99 
 
 		 419 aa  244  3e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00849669  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1831  preprotein translocase subunit SecY  33.18 
 
 		 443 aa  243  3.9999999999999997e-63  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.321149  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1504  preprotein translocase subunit SecY  36.19 
 
 		 419 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0607  preprotein translocase, SecY subunit  34.4 
 
 		 429 aa  244  3.9999999999999997e-63  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0598508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0509  preprotein translocase subunit SecY  33.48 
 
 		 443 aa  243  7e-63  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0470282  hitchhiker  0.00397274 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1847  preprotein translocase subunit SecY  35.18 
 
 		 441 aa  243  7.999999999999999e-63  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.838745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1074  preprotein translocase subunit SecY  34.3 
 
 		 441 aa  242  1e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10746  preprotein translocase subunit SecY  33.91 
 
 		 441 aa  242  1e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.329828 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0886  preprotein translocase subunit SecY  35.96 
 
 		 418 aa  242  1e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.609907  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4363  preprotein translocase subunit SecY  35.42 
 
 		 437 aa  242  1e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0120386  normal  0.169527 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1046  preprotein translocase subunit SecY  34.3 
 
 		 441 aa  242  1e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.303562  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1062  preprotein translocase subunit SecY  34.3 
 
 		 441 aa  242  1e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.160681  normal  0.323313 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1333  preprotein translocase subunit SecY  34.42 
 
 		 455 aa  241  2e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.158258 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1931  preprotein translocase subunit SecY  34.39 
 
 		 445 aa  241  2e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.776856  normal  0.537809 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0778  preprotein translocase, SecY subunit  37.29 
 
 		 430 aa  241  2e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000100686  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0504  preprotein translocase subunit SecY  32.59 
 
 		 443 aa  241  2e-62  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00015304  normal  0.032999 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0446  preprotein translocase subunit SecY  32.83 
 
 		 443 aa  241  2e-62  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000813945  hitchhiker  0.000170824 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0309  preprotein translocase subunit SecY  33.03 
 
 		 443 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0197098  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2694  preprotein translocase subunit SecY  35.39 
 
 		 425 aa  241  2.9999999999999997e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2379  preprotein translocase subunit SecY  35.24 
 
 		 425 aa  241  2.9999999999999997e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0207  preprotein translocase, SecY subunit  32.47 
 
 		 500 aa  241  2.9999999999999997e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1635  preprotein translocase subunit SecY  34.32 
 
 		 447 aa  240  4e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2209  preprotein translocase subunit SecY  33.64 
 
 		 443 aa  240  4e-62  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000211329  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4934  preprotein translocase, SecY subunit  34.64 
 
 		 439 aa  240  5e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000290796  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1863  preprotein translocase subunit SecY  34.44 
 
 		 446 aa  239  5e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.271597  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4778  preprotein translocase subunit SecY  34.47 
 
 		 444 aa  239  5.999999999999999e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000420552 
 
 
-
 
NC_004310  BR1213  preprotein translocase subunit SecY  34 
 
 		 446 aa  239  5.999999999999999e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05820  preprotein translocase SecY  33.11 
 
 		 447 aa  239  5.999999999999999e-62  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1976  preprotein translocase subunit SecY  33.33 
 
 		 446 aa  239  5.999999999999999e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.923807  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3985  preprotein translocase, SecY subunit  35.41 
 
 		 448 aa  239  6.999999999999999e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00342615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0306  preprotein translocase subunit SecY  34.39 
 
 		 421 aa  238  1e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0894763  normal  0.194972 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1399  preprotein translocase, SecY subunit  34.91 
 
 		 446 aa  238  1e-61  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2986  preprotein translocase subunit SecY  33.92 
 
 		 448 aa  239  1e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.135734  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>