More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MARTH_orf420 on replicon NC_011025
Organism: Mycoplasma arthritidis 158L3-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011025  MARTH_orf420  preprotein translocase subunit SecY  100 
 
 
490 aa  980    Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0677  preprotein translocase subunit SecY  35.59 
 
 
482 aa  257  3e-67  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl142  preprotein translocase subunit SecY  31.5 
 
 
486 aa  233  5e-60  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.779959  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0245  preprotein translocase subunit SecY  31.25 
 
 
471 aa  220  3e-56  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0078  preprotein translocase subunit SecY  32.18 
 
 
434 aa  207  5e-52  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0917629  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2381  preprotein translocase subunit SecY  29.03 
 
 
439 aa  200  6e-50  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00042664  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0125  preprotein translocase subunit SecY  31.29 
 
 
433 aa  196  1e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00395698  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0614  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  30.63 
 
 
448 aa  194  2e-48  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00397866  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5175  preprotein translocase subunit SecY  31.29 
 
 
433 aa  194  3e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000485174  unclonable  4.1263e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0151  preprotein translocase subunit SecY  31.29 
 
 
433 aa  193  8e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0158065  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1811  preprotein translocase subunit SecY  31.9 
 
 
430 aa  191  2e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.741103  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0130  preprotein translocase subunit SecY  31.07 
 
 
433 aa  192  2e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0066731  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0130  preprotein translocase subunit SecY  31.07 
 
 
433 aa  192  2e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00164171  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0126  preprotein translocase subunit SecY  31.07 
 
 
433 aa  192  2e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0265701  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0124  preprotein translocase subunit SecY  31.07 
 
 
433 aa  192  2e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.64549  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0130  preprotein translocase subunit SecY  31.07 
 
 
433 aa  192  2e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00952483  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0161  preprotein translocase subunit SecY  31.07 
 
 
433 aa  192  2e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000198533  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1887  preprotein translocase subunit SecY  31.8 
 
 
431 aa  191  2e-47  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.729916  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1463  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  29.49 
 
 
438 aa  191  4e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000110167  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0131  preprotein translocase subunit SecY  31.14 
 
 
430 aa  190  4e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.129381  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0127  preprotein translocase subunit SecY  31.24 
 
 
430 aa  189  9e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2503  preprotein translocase subunit SecY  31.67 
 
 
434 aa  187  3e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000332806  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2742  preprotein translocase subunit SecY  31.75 
 
 
434 aa  187  3e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.53667e-23 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2469  preprotein translocase subunit SecY  30.89 
 
 
434 aa  186  8e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0545369  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2545  preprotein translocase subunit SecY  31.44 
 
 
434 aa  186  8e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000778926 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2766  preprotein translocase subunit SecY  31.44 
 
 
434 aa  186  9e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00224272  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2747  preprotein translocase subunit SecY  31.44 
 
 
434 aa  186  9e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.787541  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2547  preprotein translocase subunit SecY  31.52 
 
 
434 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0673869  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2734  preprotein translocase subunit SecY  31.52 
 
 
434 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.356112  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0215  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  28.44 
 
 
444 aa  184  2.0000000000000003e-45  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1843  preprotein translocase subunit SecY  30.39 
 
 
434 aa  184  3e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.019643  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2412  preprotein translocase subunit SecY  31.21 
 
 
434 aa  183  6e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00625491  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2257  preprotein translocase subunit SecY  31 
 
 
430 aa  183  7e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0110363  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2298  preprotein translocase subunit SecY  31 
 
 
430 aa  183  7e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2790  preprotein translocase subunit SecY  31.12 
 
 
434 aa  182  2e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000168645  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0124  preprotein translocase subunit SecY  32.43 
 
 
433 aa  182  2e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000327784  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2691  preprotein translocase, SecY subunit  29.74 
 
 
430 aa  180  7e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.803147  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1726  preprotein translocase, SecY subunit  30.34 
 
 
435 aa  179  8e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000716119  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4934  preprotein translocase, SecY subunit  32.72 
 
 
439 aa  179  9e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000290796  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0951  preprotein translocase, SecY subunit  32.68 
 
 
448 aa  178  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.830582  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0377  preprotein translocase subunit SecY  31.13 
 
 
448 aa  178  2e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0381  preprotein translocase subunit SecY  31.95 
 
 
452 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1931  preprotein translocase subunit SecY  32.48 
 
 
445 aa  175  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.776856  normal  0.537809 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2694  preprotein translocase subunit SecY  30.27 
 
 
425 aa  176  9.999999999999999e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0310  preprotein translocase subunit SecY  28.7 
 
 
431 aa  176  9.999999999999999e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  unclonable  8.823840000000001e-28 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1735  preprotein translocase subunit SecY  32.17 
 
 
452 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2379  preprotein translocase subunit SecY  30.04 
 
 
425 aa  174  2.9999999999999996e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1246  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  30.04 
 
 
463 aa  174  3.9999999999999995e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.031052  hitchhiker  0.00314824 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20670  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  30.47 
 
 
439 aa  174  3.9999999999999995e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0780  preprotein translocase subunit SecY  32.3 
 
 
457 aa  174  3.9999999999999995e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0886  preprotein translocase subunit SecY  29.52 
 
 
418 aa  173  6.999999999999999e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.609907  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0305  preprotein translocase subunit SecY  31.19 
 
 
453 aa  173  7.999999999999999e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.398461 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1847  preprotein translocase subunit SecY  30.43 
 
 
441 aa  172  9e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.838745  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3308  preprotein translocase subunit SecY  31.18 
 
 
435 aa  171  2e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000602472 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0607  preprotein translocase, SecY subunit  30.05 
 
 
429 aa  171  3e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0598508  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2440  preprotein translocase subunit SecY  29.84 
 
 
420 aa  171  4e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0275  preprotein translocase subunit SecY  31.32 
 
 
454 aa  170  4e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0794912  normal  0.75706 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05820  preprotein translocase SecY  32.89 
 
 
447 aa  170  5e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0979  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  30.54 
 
 
447 aa  170  5e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000479753  hitchhiker  0.00549319 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1086  preprotein translocase subunit SecY  32.06 
 
 
435 aa  170  5e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.135642  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6594  preprotein translocase subunit SecY  32.42 
 
 
436 aa  170  6e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1167  preprotein translocase subunit SecY  30.38 
 
 
447 aa  169  7e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.221673  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1918  preprotein translocase subunit SecY  29.75 
 
 
446 aa  169  1e-40  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3686  preprotein translocase, SecY subunit  30.6 
 
 
441 aa  169  2e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.000792509  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0735  preprotein translocase, SecY subunit  31.31 
 
 
433 aa  168  2e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0953  preprotein translocase subunit SecY  30.96 
 
 
435 aa  167  4e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0415377  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3985  preprotein translocase, SecY subunit  32.12 
 
 
448 aa  167  4e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00342615  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1053  preprotein translocase, SecY subunit  30.85 
 
 
449 aa  167  5e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.112551  normal  0.615544 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4363  preprotein translocase subunit SecY  30.57 
 
 
437 aa  167  5e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0120386  normal  0.169527 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1727  preprotein translocase subunit SecY  29.2 
 
 
445 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.0000416171  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0646  preprotein translocase subunit SecY  30.21 
 
 
435 aa  166  9e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00379524  hitchhiker  0.000000811889 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2514  preprotein translocase subunit SecY  31.07 
 
 
452 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2837  preprotein translocase subunit SecY  29.84 
 
 
435 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1000  preprotein translocase, SecY subunit  31.66 
 
 
419 aa  165  2.0000000000000002e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00382146  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1366  preprotein translocase subunit SecY  30.18 
 
 
437 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000833152  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0622  preprotein translocase, SecY subunit  29.61 
 
 
444 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.925436 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1976  preprotein translocase subunit SecY  31.48 
 
 
446 aa  165  2.0000000000000002e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.923807  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0441  preprotein translocase subunit SecY  30.59 
 
 
443 aa  165  2.0000000000000002e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5144  preprotein translocase, SecY subunit  31.52 
 
 
437 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.552257 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0718  preprotein translocase subunit SecY  30.93 
 
 
448 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.214912  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0442  preprotein translocase subunit SecY  30.37 
 
 
429 aa  164  3e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4487  preprotein translocase, SecY subunit  30.67 
 
 
436 aa  164  3e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0509  preprotein translocase subunit SecY  30 
 
 
443 aa  164  4.0000000000000004e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0470282  hitchhiker  0.00397274 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0446  preprotein translocase subunit SecY  29.76 
 
 
443 aa  164  4.0000000000000004e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000813945  hitchhiker  0.000170824 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1926  preprotein translocase, SecY subunit  30.32 
 
 
449 aa  164  4.0000000000000004e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.796685  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2756  preprotein translocase, SecY subunit  30.67 
 
 
443 aa  164  5.0000000000000005e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.373135  normal  0.477854 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2986  preprotein translocase subunit SecY  30.11 
 
 
448 aa  164  5.0000000000000005e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.135734  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0708  preprotein translocase, SecY subunit  29.85 
 
 
438 aa  163  5.0000000000000005e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.274333 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0235  preprotein translocase subunit SecY  29.16 
 
 
419 aa  163  5.0000000000000005e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00849669  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04180  preprotein translocase subunit SecY  30.92 
 
 
435 aa  163  7e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.132635  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1863  preprotein translocase subunit SecY  30.41 
 
 
446 aa  163  7e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.271597  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5050  preprotein translocase subunit SecY  29.37 
 
 
444 aa  163  8.000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.478224  normal  0.981585 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0973  preprotein translocase subunit SecY  29.1 
 
 
428 aa  163  8.000000000000001e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0245  preprotein translocase subunit SecY  30.24 
 
 
424 aa  163  8.000000000000001e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.101058  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1213  preprotein translocase subunit SecY  31.48 
 
 
446 aa  162  1e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0504  preprotein translocase subunit SecY  29.93 
 
 
443 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000390206  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0778  preprotein translocase, SecY subunit  30.43 
 
 
430 aa  162  1e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000100686  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1176  preprotein translocase subunit SecY  31.48 
 
 
446 aa  162  1e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0379017  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0507  preprotein translocase subunit SecY  30.32 
 
 
443 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0640452  normal  0.0135524 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4729  preprotein translocase subunit SecY  30.32 
 
 
443 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0376135  normal  0.430849 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>