More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1110 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_1110  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  100 
 
 
366 aa  739    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1253  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  97.54 
 
 
366 aa  705    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2937  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  61.92 
 
 
365 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3080  NADH:flavin oxidoreductase / NADH oxidase family  61.1 
 
 
365 aa  457  1e-127  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6294  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  58.74 
 
 
373 aa  442  1e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.181632 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3367  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  54.79 
 
 
369 aa  384  1e-105  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1521  putative NADH-dependent flavin oxidoreductase  50.56 
 
 
363 aa  376  1e-103  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0991622 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1289  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.37 
 
 
377 aa  283  2.0000000000000002e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.306648  normal  0.411333 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2700  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.57 
 
 
390 aa  281  1e-74  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.484664  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3645  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.38 
 
 
377 aa  253  3e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.168223  normal  0.516752 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3822  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  34.86 
 
 
370 aa  201  9.999999999999999e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.271539  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3333  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  34.01 
 
 
375 aa  192  1e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.736898  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3349  Oye family NADH-dependent flavin oxidoreductase  33.8 
 
 
375 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1928  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  35.56 
 
 
367 aa  189  5e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1813  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  37.36 
 
 
362 aa  189  7e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3657  NADH-dependent flavin oxidoreductase, Oye family  34.2 
 
 
375 aa  189  9e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3398  Oye family NADH-dependent flavin oxidoreductase  34.2 
 
 
375 aa  188  1e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3437  Oye family NADH-dependent flavin oxidoreductase  33.91 
 
 
375 aa  187  2e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.283437  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3755  NADH-dependent flavin oxidoreductase, Oye family  34.49 
 
 
375 aa  187  2e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3707  Oye family NADH-dependent flavin oxidoreductase  33.91 
 
 
375 aa  187  2e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.488381  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6347  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  34.56 
 
 
363 aa  187  2e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1561  NADH-dependent flavin oxidoreductase, Oye family  34.78 
 
 
375 aa  186  4e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.342223 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3680  NADH-dependent flavin oxidoreductase, Oye family  33.91 
 
 
375 aa  186  4e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.204517  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4277  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  36.91 
 
 
385 aa  186  5e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.91364  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3675  Oye family NADH-dependent flavin oxidoreductase  34.78 
 
 
375 aa  186  7e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1415  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  38.35 
 
 
375 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.193692  hitchhiker  0.0000159573 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1149  oxidoreductase  39.18 
 
 
355 aa  185  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2082  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  38.1 
 
 
358 aa  184  3e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3384  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  38.87 
 
 
363 aa  183  5.0000000000000004e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000502558 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0152  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  36.26 
 
 
359 aa  182  5.0000000000000004e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.5134  normal  0.162192 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5552  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  35.53 
 
 
358 aa  182  1e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.730756  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2348  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  37.71 
 
 
358 aa  181  1e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.492677  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4760  flavin oxidoreductase/NADH oxidase  37.05 
 
 
365 aa  181  2e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000142373  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1002  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  37.78 
 
 
357 aa  181  2e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0473  NADH:flavin oxidoreductase  35.33 
 
 
368 aa  180  4e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2459  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  38.26 
 
 
361 aa  179  5.999999999999999e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0507  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  36.57 
 
 
363 aa  179  7e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3021  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  37.33 
 
 
368 aa  177  2e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.347142  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2616  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  33.43 
 
 
365 aa  177  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1883  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  35.8 
 
 
359 aa  177  3e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1258  NADH-flavin oxidoreductase/NADH oxidase  37.28 
 
 
371 aa  177  3e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1240  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  38.29 
 
 
373 aa  177  3e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7019  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  39.03 
 
 
370 aa  177  3e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.266435  normal  0.0759654 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0759  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  38.29 
 
 
373 aa  177  3e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.882539  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6353  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  38.75 
 
 
370 aa  176  5e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.217265  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1475  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  38.75 
 
 
370 aa  176  5e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0181393  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5123  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  38.46 
 
 
362 aa  176  6e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5779  morphinone reductase  39.49 
 
 
364 aa  175  9e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.240978  normal  0.391278 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3337  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  34.1 
 
 
355 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4063  N-ethylmaleimide reductase, putative  34.54 
 
 
367 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4953  NADH-flavin oxidoreductase/NADH oxidase  35.24 
 
 
372 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.880689  normal  0.66243 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5550  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  36.86 
 
 
358 aa  174  1.9999999999999998e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.088188  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0972  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  33.88 
 
 
369 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.277341 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0473  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  34.92 
 
 
378 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0563  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  38.86 
 
 
357 aa  173  5e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000270418 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0454  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  34.92 
 
 
378 aa  173  5e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0423  FMN oxidoreductase protein  36.29 
 
 
364 aa  173  5e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2070  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  30.91 
 
 
374 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02130  NADH-dependent flavin oxidoreductase, Oye family protein  33.15 
 
 
365 aa  172  1e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.361518  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0475  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  38.81 
 
 
365 aa  171  1e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.261593  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3487  NADH:flavin oxidoreductase family protein  32.85 
 
 
362 aa  172  1e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.587837 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1213  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  38.57 
 
 
373 aa  172  1e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1135  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  33.52 
 
 
366 aa  172  1e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0661889 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26130  morphinone reductase  38.7 
 
 
369 aa  171  1e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.243745  normal  0.290118 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5643  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  34.07 
 
 
379 aa  171  2e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0593  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  35.49 
 
 
363 aa  171  2e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4722  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  35.17 
 
 
356 aa  171  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5823  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  36.96 
 
 
370 aa  171  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00904  NADH-dependent flavin oxidoreductase protein  36.28 
 
 
359 aa  170  3e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.890942 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1539  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  36.36 
 
 
358 aa  171  3e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.31269  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0306  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  36.39 
 
 
358 aa  171  3e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.126794  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5128  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  36.16 
 
 
371 aa  169  5e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2682  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  35.57 
 
 
372 aa  169  5e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000624  N-ethylmaleimide reductase  34.51 
 
 
374 aa  169  6e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0920  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  35.56 
 
 
349 aa  169  7e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0986  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  35.47 
 
 
349 aa  169  8e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000257245 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0959  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  35.71 
 
 
349 aa  169  8e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.224706 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3087  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  35.85 
 
 
370 aa  169  8e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.138011 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4347  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  33.91 
 
 
355 aa  169  8e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0189212 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2058  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  35.49 
 
 
358 aa  168  1e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.416223  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01614  xenobiotic reductase B  32.18 
 
 
373 aa  168  1e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0101  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  33.05 
 
 
369 aa  168  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.70129 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3098  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  34.47 
 
 
346 aa  169  1e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.450355  normal  0.838165 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0291  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  34.68 
 
 
380 aa  167  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4153  N-ethylmaleimide reductase, putative  35.2 
 
 
378 aa  167  2e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34840  NADH:flavin oxidoreductase  35.31 
 
 
359 aa  167  2e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5606  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  36.89 
 
 
370 aa  167  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.614361  normal  0.874995 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0104  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  33.05 
 
 
369 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2959  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  36.77 
 
 
374 aa  167  2.9999999999999998e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0436384  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4103  N-ethylmaleimide reductase  33.99 
 
 
369 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0913  N-ethylmaleimide reductase  33.15 
 
 
365 aa  167  2.9999999999999998e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2779  hypothetical protein  33.24 
 
 
351 aa  166  4e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3337  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  36.16 
 
 
366 aa  167  4e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.853929  normal  0.657426 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3385  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.28 
 
 
368 aa  166  5e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.334271  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2906  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  34.45 
 
 
369 aa  166  5e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2819  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  34.45 
 
 
369 aa  166  5e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.726773  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0244  N-ethylmaleimide reductase  33.89 
 
 
367 aa  166  5.9999999999999996e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3683  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  33.24 
 
 
368 aa  166  5.9999999999999996e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2132  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  33.33 
 
 
367 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2486  Oye family NADH-dependent flavin oxidoreductase  33.42 
 
 
374 aa  165  9e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0454136  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>