More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS00904 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003296  RS00904  NADH-dependent flavin oxidoreductase protein  100 
 
 
359 aa  727    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.890942 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6328  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  83.48 
 
 
363 aa  603  1.0000000000000001e-171  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0492  NADH-flavin oxidoreductase/NADH oxidase  78.99 
 
 
357 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3869  putative oxidoreductase  81.07 
 
 
359 aa  568  1e-161  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0709  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  78.06 
 
 
359 aa  556  1e-157  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.361607  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0476  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  75.28 
 
 
354 aa  549  1e-155  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4722  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  74.93 
 
 
356 aa  548  1e-155  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36990  NADH:flavin oxidoreductase  60 
 
 
357 aa  393  1e-108  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.610852 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4896  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  60.52 
 
 
357 aa  367  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2058  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  50.84 
 
 
363 aa  345  8e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0563  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  55.17 
 
 
357 aa  337  1.9999999999999998e-91  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000270418 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4210  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  50.96 
 
 
372 aa  335  5e-91  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1149  oxidoreductase  54.44 
 
 
355 aa  331  1e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0113  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  51.66 
 
 
364 aa  330  2e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.15352  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2277  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  50.83 
 
 
363 aa  331  2e-89  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.178772 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1327  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  50 
 
 
364 aa  325  5e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2240  N-ethylmaleimide reductase, FMN-linked  50.7 
 
 
365 aa  324  1e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3384  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  49.44 
 
 
363 aa  322  7e-87  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000502558 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3689  GTN reductase  50.28 
 
 
360 aa  321  9.999999999999999e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4888  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  49.86 
 
 
366 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2173  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  48.18 
 
 
363 aa  319  5e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.789599  hitchhiker  0.00631395 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4062  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  49.72 
 
 
462 aa  318  9e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00355793  normal  0.310254 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2006  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  49.86 
 
 
364 aa  318  1e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1368  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.67 
 
 
367 aa  316  3e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.523786  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2479  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  48.75 
 
 
366 aa  316  5e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5779  morphinone reductase  49.3 
 
 
364 aa  312  5.999999999999999e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.240978  normal  0.391278 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1865  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase family protein  48.45 
 
 
360 aa  311  1e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6347  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.77 
 
 
363 aa  311  1e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1830  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  48.87 
 
 
358 aa  310  4e-83  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.028835  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01763  GTN Reductase  48.6 
 
 
372 aa  308  1.0000000000000001e-82  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.553032  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1172  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.48 
 
 
359 aa  306  3e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.210538 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1002  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  50.99 
 
 
357 aa  305  7e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1258  NADH-flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.08 
 
 
371 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0152  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  50 
 
 
359 aa  304  2.0000000000000002e-81  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.5134  normal  0.162192 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1242  NADH-flavin oxidoreductase/NADH oxidase  49.47 
 
 
371 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.102798  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5271  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  49.58 
 
 
360 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4736  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  49.58 
 
 
360 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4103  N-ethylmaleimide reductase  45.96 
 
 
369 aa  303  4.0000000000000003e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1046  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  50.14 
 
 
368 aa  301  1e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.758573  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1778  N-ethylmaleimide reductase  46.51 
 
 
385 aa  299  5e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1138  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  50.54 
 
 
368 aa  298  8e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0230317  normal  0.571173 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1813  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.62 
 
 
362 aa  298  1e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2805  putative NADH-flavin oxidoreductase  47.75 
 
 
362 aa  297  2e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000624  N-ethylmaleimide reductase  45.21 
 
 
374 aa  297  2e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0104  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.2 
 
 
369 aa  296  4e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5123  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.24 
 
 
362 aa  296  5e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4877  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.89 
 
 
368 aa  296  5e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0637583 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1494  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.75 
 
 
362 aa  295  6e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0995744  normal  0.674714 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0423  FMN oxidoreductase protein  48.04 
 
 
364 aa  294  2e-78  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1438  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.25 
 
 
361 aa  294  2e-78  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0101  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.92 
 
 
369 aa  294  2e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.70129 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0593  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.23 
 
 
363 aa  292  5e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1202  flavoprotein NADH-dependent oxidoreductase  49.59 
 
 
378 aa  292  6e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.655444 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26130  morphinone reductase  47.72 
 
 
369 aa  291  9e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.243745  normal  0.290118 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1762  N-ethylmaleimide reductase  45.33 
 
 
365 aa  291  1e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000139789  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3143  oxidoreductase  44.41 
 
 
371 aa  291  1e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.683924  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1871  N-ethylmaleimide reductase  45.33 
 
 
365 aa  291  1e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00554959  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2565  N-ethylmaleimide reductase  45.33 
 
 
365 aa  291  1e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111821  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3698  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.13 
 
 
364 aa  291  1e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.014573 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4760  flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.22 
 
 
365 aa  291  2e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000142373  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1099  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.26 
 
 
360 aa  290  3e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.106909  normal  0.659732 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1539  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.28 
 
 
358 aa  290  3e-77  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.31269  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0639  Oye family NADH-dependent flavin oxidoreductase  45.95 
 
 
372 aa  288  1e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0473  NADH:flavin oxidoreductase  46.13 
 
 
368 aa  288  1e-76  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0627  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.01 
 
 
369 aa  287  2e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05639  N-ethylmaleimide reductase  44.35 
 
 
366 aa  286  4e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2459  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.97 
 
 
361 aa  286  5e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3487  NADH:flavin oxidoreductase family protein  41.83 
 
 
362 aa  285  8e-76  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.587837 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0217  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.79 
 
 
358 aa  284  1.0000000000000001e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06498  NADH-flavin oxidoreductase  43.09 
 
 
363 aa  284  1.0000000000000001e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0244  N-ethylmaleimide reductase  44.09 
 
 
367 aa  284  2.0000000000000002e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5550  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.62 
 
 
358 aa  284  2.0000000000000002e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.088188  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0988  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.46 
 
 
359 aa  284  2.0000000000000002e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000470926 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3683  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.5 
 
 
368 aa  283  3.0000000000000004e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2082  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.73 
 
 
358 aa  283  3.0000000000000004e-75  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1157  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.49 
 
 
362 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.10298  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5128  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.69 
 
 
371 aa  283  5.000000000000001e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1738  N-ethylmaleimide reductase  45.48 
 
 
365 aa  282  7.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.105113  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0527  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.57 
 
 
364 aa  282  7.000000000000001e-75  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000582324  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0503  NADH-flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.22 
 
 
373 aa  281  1e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1533  N-ethylmaleimide reductase  45.21 
 
 
365 aa  280  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.111843  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3889  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.93 
 
 
366 aa  280  2e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.212192  normal  0.106591 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0481  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.15 
 
 
369 aa  280  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.239535 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1649  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.35 
 
 
354 aa  281  2e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0323163  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10483  flavoprotein NADH-dependent oxidoreductase  42.58 
 
 
379 aa  280  3e-74  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.614886  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2202  N-ethylmaleimide reductase  44.14 
 
 
365 aa  280  3e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.209286  hitchhiker  0.0000409278 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0157  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.5 
 
 
361 aa  280  3e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.613115  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0473  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.69 
 
 
378 aa  280  3e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1689  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.67 
 
 
368 aa  280  4e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2934  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.13 
 
 
367 aa  279  4e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.522129  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2710  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.32 
 
 
366 aa  279  4e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5847  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  48.03 
 
 
425 aa  280  4e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.682082 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0353  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.44 
 
 
366 aa  279  6e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.798317 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1546  N-ethylmaleimide reductase  45.21 
 
 
365 aa  278  9e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0454  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.29 
 
 
378 aa  278  9e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5552  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.51 
 
 
358 aa  278  9e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.730756  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1606  N-ethylmaleimide reductase  45.21 
 
 
365 aa  278  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0239  NADH-flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.3 
 
 
371 aa  278  1e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0507  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.3 
 
 
363 aa  278  1e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000261  N-ethylmaleimide reductase  43.65 
 
 
366 aa  278  1e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>