More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3021 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_3021  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  100 
 
 
368 aa  748    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.347142  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1778  N-ethylmaleimide reductase  62.64 
 
 
385 aa  483  1e-135  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3337  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  64.19 
 
 
366 aa  468  1.0000000000000001e-131  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.853929  normal  0.657426 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4063  N-ethylmaleimide reductase, putative  61.9 
 
 
367 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0507  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  62.67 
 
 
363 aa  464  1e-129  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0593  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  61.34 
 
 
363 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4153  N-ethylmaleimide reductase, putative  59.23 
 
 
378 aa  454  1e-127  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0473  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  59.1 
 
 
378 aa  457  1e-127  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0454  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  58.82 
 
 
378 aa  456  1e-127  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000624  N-ethylmaleimide reductase  59.84 
 
 
374 aa  456  1e-127  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0244  N-ethylmaleimide reductase  60.11 
 
 
367 aa  454  1.0000000000000001e-126  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06498  NADH-flavin oxidoreductase  59 
 
 
363 aa  447  1.0000000000000001e-124  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0913  N-ethylmaleimide reductase  56.7 
 
 
365 aa  428  1e-119  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5363  N-ethylmaleimide reductase  58.15 
 
 
373 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.444499  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000261  N-ethylmaleimide reductase  53.2 
 
 
366 aa  399  9.999999999999999e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05639  N-ethylmaleimide reductase  52.1 
 
 
366 aa  389  1e-107  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5643  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  50.27 
 
 
379 aa  383  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26130  morphinone reductase  56.63 
 
 
369 aa  382  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.243745  normal  0.290118 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2099  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  51.82 
 
 
366 aa  379  1e-104  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.732064  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2486  Oye family NADH-dependent flavin oxidoreductase  49.18 
 
 
374 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0454136  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2454  oxidoreductase, FMN-binding  52.66 
 
 
365 aa  377  1e-103  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4051  putative oxidoreductase  54.89 
 
 
370 aa  375  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2152  oxidoreductase, FMN-binding  54.27 
 
 
371 aa  377  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3350  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  54.79 
 
 
371 aa  375  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.70851  normal  0.0716807 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1477  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  49.46 
 
 
371 aa  375  1e-103  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1138  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  52.34 
 
 
368 aa  373  1e-102  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0230317  normal  0.571173 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2710  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  50.42 
 
 
366 aa  371  1e-102  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1046  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  52.34 
 
 
368 aa  372  1e-102  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.758573  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0239  NADH-flavin oxidoreductase/NADH oxidase  52.6 
 
 
371 aa  368  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0423  NADH:flavin oxidoreductase  55.1 
 
 
371 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.798102  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5219  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  52.32 
 
 
380 aa  371  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1202  flavoprotein NADH-dependent oxidoreductase  51.79 
 
 
378 aa  366  1e-100  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.655444 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4856  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  54.25 
 
 
371 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.166947  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47000  putative oxidoreductase  53.78 
 
 
370 aa  366  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.246244  normal  0.208347 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0639  Oye family NADH-dependent flavin oxidoreductase  51.75 
 
 
372 aa  365  1e-99  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4754  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  53.15 
 
 
371 aa  363  2e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.750935 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5413  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  53.7 
 
 
371 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00342687 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5449  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  53.7 
 
 
371 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1093  NADH-dependent flavin oxidoreductase, NADH oxidase  47.71 
 
 
375 aa  360  2e-98  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0396563 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5299  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  52.6 
 
 
371 aa  359  3e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.246787 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18430  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase family  48.08 
 
 
379 aa  357  9.999999999999999e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0527  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  48.18 
 
 
364 aa  356  3.9999999999999996e-97  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000582324  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0161  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  50.14 
 
 
369 aa  356  3.9999999999999996e-97  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3110  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  47.3 
 
 
374 aa  356  5e-97  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2229  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  48.63 
 
 
374 aa  355  5e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20830  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase family protein  54.12 
 
 
379 aa  354  1e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0458981  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3087  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  50.69 
 
 
370 aa  353  4e-96  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.138011 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2445  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  52.04 
 
 
371 aa  353  4e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2094  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  50 
 
 
368 aa  350  3e-95  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5482  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  48.65 
 
 
404 aa  348  7e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.62329  normal  0.848973 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0113  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  52.47 
 
 
364 aa  348  9e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.15352  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2479  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  51.79 
 
 
366 aa  345  6e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2058  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  49.59 
 
 
363 aa  344  1e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2277  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  50 
 
 
363 aa  344  1e-93  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.178772 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4210  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  48.36 
 
 
372 aa  344  2e-93  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2173  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  48.9 
 
 
363 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.789599  hitchhiker  0.00631395 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1326  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  48.77 
 
 
414 aa  341  1e-92  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0306285  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1539  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  50.28 
 
 
358 aa  341  1e-92  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.31269  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1871  N-ethylmaleimide reductase  46.32 
 
 
365 aa  339  5e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00554959  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2424  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  53.68 
 
 
371 aa  339  5e-92  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.397481  normal  0.0764227 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1762  N-ethylmaleimide reductase  46.32 
 
 
365 aa  339  5e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000139789  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2565  N-ethylmaleimide reductase  46.32 
 
 
365 aa  339  5e-92  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111821  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2006  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  50.83 
 
 
364 aa  338  7e-92  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1327  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  49.59 
 
 
364 aa  338  8e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1606  N-ethylmaleimide reductase  47.25 
 
 
365 aa  337  1.9999999999999998e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1258  NADH-flavin oxidoreductase/NADH oxidase  49.44 
 
 
371 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1738  N-ethylmaleimide reductase  46.98 
 
 
365 aa  336  3.9999999999999995e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.105113  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4888  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  48.77 
 
 
366 aa  335  9e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1533  N-ethylmaleimide reductase  46.7 
 
 
365 aa  335  1e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.111843  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4790  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  48.18 
 
 
367 aa  335  1e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.674778  normal  0.678422 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1907  N-ethylmaleimide reductase  46.7 
 
 
365 aa  334  1e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0920  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  50.28 
 
 
349 aa  334  2e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1546  N-ethylmaleimide reductase  46.7 
 
 
365 aa  333  2e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0959  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  50.28 
 
 
349 aa  333  4e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.224706 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2240  N-ethylmaleimide reductase, FMN-linked  47.8 
 
 
365 aa  332  5e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1368  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.51 
 
 
367 aa  331  9e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.523786  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4760  flavin oxidoreductase/NADH oxidase  48.38 
 
 
365 aa  330  2e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000142373  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2362  N-ethylmaleimide reductase  46.7 
 
 
365 aa  330  3e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.003891  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1979  N-ethylmaleimide reductase  46.7 
 
 
365 aa  329  5.0000000000000004e-89  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0402402  hitchhiker  0.00127595 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1990  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.7 
 
 
365 aa  329  5.0000000000000004e-89  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000017212  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1861  N-ethylmaleimide reductase  46.7 
 
 
365 aa  329  5.0000000000000004e-89  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.105495  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1727  N-ethylmaleimide reductase  46.7 
 
 
365 aa  329  5.0000000000000004e-89  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2819  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  48.75 
 
 
369 aa  329  6e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.726773  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2906  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  48.75 
 
 
369 aa  329  6e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01620  N-ethylmaleimide reductase, FMN-linked  46.7 
 
 
365 aa  328  7e-89  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00072509  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01610  hypothetical protein  46.7 
 
 
365 aa  328  7e-89  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00066304  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1548  N-ethylmaleimide reductase  46.43 
 
 
365 aa  328  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.284503  normal  0.889457 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6900  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.99 
 
 
404 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2682  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  49.3 
 
 
372 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0902  oxidoreductase, FMN-binding  48.65 
 
 
371 aa  327  2.0000000000000001e-88  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2805  putative NADH-flavin oxidoreductase  50.41 
 
 
362 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0845  oxidoreductase, FMN-binding  48.65 
 
 
371 aa  327  2.0000000000000001e-88  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1172  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.3 
 
 
359 aa  326  4.0000000000000003e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.210538 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1842  N-ethylmaleimide reductase  46.15 
 
 
365 aa  326  4.0000000000000003e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.234054  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0986  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  49.17 
 
 
349 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000257245 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2453  N-ethylmaleimide reductase, putative  46.81 
 
 
362 aa  326  5e-88  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4062  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.77 
 
 
462 aa  325  5e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00355793  normal  0.310254 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4468  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  49.44 
 
 
349 aa  325  1e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.101693 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1494  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  50.14 
 
 
362 aa  324  1e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0995744  normal  0.674714 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0473  NADH:flavin oxidoreductase  47.84 
 
 
368 aa  324  2e-87  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>