More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6900 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5482  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  90.1 
 
 
404 aa  766    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.62329  normal  0.848973 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6900  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  100 
 
 
404 aa  830    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0639  Oye family NADH-dependent flavin oxidoreductase  65.75 
 
 
372 aa  483  1e-135  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2445  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  57.45 
 
 
371 aa  431  1e-119  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4760  flavin oxidoreductase/NADH oxidase  57.38 
 
 
365 aa  410  1e-113  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000142373  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0473  NADH:flavin oxidoreductase  57.38 
 
 
368 aa  397  1e-109  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3087  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  52.32 
 
 
370 aa  394  1e-108  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.138011 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1258  NADH-flavin oxidoreductase/NADH oxidase  53.89 
 
 
371 aa  390  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2094  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  54.5 
 
 
368 aa  390  1e-107  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1830  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  53.7 
 
 
358 aa  381  1e-104  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.028835  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3133  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  50.95 
 
 
375 aa  375  1e-103  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.656366  normal  0.303319 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5123  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  49.18 
 
 
362 aa  368  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2240  N-ethylmaleimide reductase, FMN-linked  51.61 
 
 
365 aa  367  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1242  NADH-flavin oxidoreductase/NADH oxidase  52.41 
 
 
371 aa  366  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.102798  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4888  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  50.54 
 
 
366 aa  364  1e-99  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3698  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  51.23 
 
 
364 aa  364  2e-99  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.014573 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1368  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  48.51 
 
 
367 aa  362  5.0000000000000005e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.523786  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0353  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  50.94 
 
 
366 aa  361  1e-98  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.798317 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4210  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  49.33 
 
 
372 aa  360  2e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0481  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  52.86 
 
 
369 aa  360  2e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.239535 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0475  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  53.24 
 
 
365 aa  359  4e-98  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.261593  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1374  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  49.32 
 
 
366 aa  359  5e-98  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4062  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  49.18 
 
 
462 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00355793  normal  0.310254 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26130  morphinone reductase  52.04 
 
 
369 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.243745  normal  0.290118 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1762  N-ethylmaleimide reductase  48.64 
 
 
365 aa  356  2.9999999999999997e-97  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000139789  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2565  N-ethylmaleimide reductase  48.64 
 
 
365 aa  356  2.9999999999999997e-97  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111821  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1871  N-ethylmaleimide reductase  48.64 
 
 
365 aa  356  2.9999999999999997e-97  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00554959  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1245  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  50.27 
 
 
373 aa  356  5e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.939474  normal  0.298722 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0902  oxidoreductase, FMN-binding  50.53 
 
 
371 aa  355  1e-96  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0845  oxidoreductase, FMN-binding  50.53 
 
 
371 aa  355  1e-96  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1468  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  48.67 
 
 
371 aa  353  2.9999999999999997e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0104  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.62 
 
 
369 aa  351  1e-95  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1327  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  49.47 
 
 
364 aa  352  1e-95  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1202  flavoprotein NADH-dependent oxidoreductase  49.18 
 
 
378 aa  350  2e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.655444 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2986  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.58 
 
 
374 aa  350  2e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0351108 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0404  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  51.46 
 
 
373 aa  350  3e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0101  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.35 
 
 
369 aa  350  3e-95  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.70129 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1477  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  48.68 
 
 
371 aa  349  4e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2725  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.32 
 
 
374 aa  349  6e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.245117  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1643  putative NADH-dependent flavin oxidoreductase  50.95 
 
 
387 aa  349  6e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2202  N-ethylmaleimide reductase  46.51 
 
 
365 aa  348  7e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.209286  hitchhiker  0.0000409278 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1138  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  48.37 
 
 
368 aa  347  2e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0230317  normal  0.571173 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1046  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  48.91 
 
 
368 aa  347  3e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.758573  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3110  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  47.23 
 
 
374 aa  347  3e-94  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1172  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.55 
 
 
359 aa  346  5e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.210538 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0423  FMN oxidoreductase protein  49.05 
 
 
364 aa  344  1e-93  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2058  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  48.22 
 
 
363 aa  345  1e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4736  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  49.06 
 
 
360 aa  344  1e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0527  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  48.24 
 
 
364 aa  344  2e-93  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000582324  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0063  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  50 
 
 
366 aa  343  2e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5643  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.83 
 
 
379 aa  342  5e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5363  N-ethylmaleimide reductase  50.95 
 
 
373 aa  340  2e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.444499  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1539  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  49.05 
 
 
358 aa  340  2.9999999999999998e-92  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.31269  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2173  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.41 
 
 
363 aa  340  4e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.789599  hitchhiker  0.00631395 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1210  N-ethylmaleimide reductase  49.86 
 
 
353 aa  339  4e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2006  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  48.22 
 
 
364 aa  339  5e-92  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0031  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  49.73 
 
 
371 aa  338  7e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.371979 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2277  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.15 
 
 
363 aa  338  8e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.178772 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0340  N-ethylmaleimide reductase  49.86 
 
 
353 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1356  N-ethylmaleimide reductase  49.86 
 
 
353 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06498  NADH-flavin oxidoreductase  46.07 
 
 
363 aa  338  9.999999999999999e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2474  N-ethylmaleimide reductase  49.86 
 
 
353 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.22498  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1283  N-ethylmaleimide reductase  49.86 
 
 
353 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.105035  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0951  N-ethylmaleimide reductase  49.86 
 
 
353 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0619  N-ethylmaleimide reductase  49.86 
 
 
353 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.727216  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5271  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  49.06 
 
 
360 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4808  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  49.45 
 
 
353 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.147658 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4095  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  48.66 
 
 
369 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0039  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  48.14 
 
 
367 aa  337  2.9999999999999997e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3143  oxidoreductase  46.26 
 
 
371 aa  336  3.9999999999999995e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.683924  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0113  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  49.32 
 
 
364 aa  336  3.9999999999999995e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.15352  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2486  Oye family NADH-dependent flavin oxidoreductase  46.92 
 
 
374 aa  335  5.999999999999999e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0454136  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0161  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  48.65 
 
 
369 aa  335  7e-91  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1721  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  50.14 
 
 
363 aa  335  7.999999999999999e-91  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2479  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  48.92 
 
 
366 aa  335  7.999999999999999e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2454  oxidoreductase, FMN-binding  46.32 
 
 
365 aa  334  1e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1523  N-ethylmaleimide reductase  50.14 
 
 
353 aa  335  1e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.512635  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18430  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase family  47.31 
 
 
379 aa  334  2e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1425  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.56 
 
 
364 aa  333  2e-90  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3689  GTN reductase  50.68 
 
 
360 aa  333  4e-90  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3892  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  49.46 
 
 
353 aa  333  4e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0182  N-ethylmaleimide reductase  44.02 
 
 
367 aa  332  6e-90  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.172585 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4150  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  50 
 
 
353 aa  332  6e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0244  N-ethylmaleimide reductase  45.43 
 
 
367 aa  332  7.000000000000001e-90  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3683  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.11 
 
 
368 aa  332  9e-90  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4767  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  50 
 
 
371 aa  331  1e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.323845  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0961  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  50 
 
 
351 aa  332  1e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.943991  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4675  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  49.73 
 
 
353 aa  330  2e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.650243 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4764  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  49.73 
 
 
353 aa  330  2e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.211845 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5519  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  49.73 
 
 
353 aa  330  2e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.824672 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3603  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  49.73 
 
 
353 aa  330  2e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.682555  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1738  N-ethylmaleimide reductase  47.04 
 
 
365 aa  330  3e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.105113  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0037  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.47 
 
 
372 aa  329  4e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0951  NADH-flavin oxidoreductase/NADH oxidase  50 
 
 
353 aa  329  4e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1865  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase family protein  45.82 
 
 
360 aa  329  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000261  N-ethylmaleimide reductase  45.48 
 
 
366 aa  329  5.0000000000000004e-89  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1546  N-ethylmaleimide reductase  47.04 
 
 
365 aa  329  7e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1533  N-ethylmaleimide reductase  46.77 
 
 
365 aa  328  8e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.111843  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1548  N-ethylmaleimide reductase  46.77 
 
 
365 aa  328  8e-89  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.284503  normal  0.889457 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2362  N-ethylmaleimide reductase  46.77 
 
 
365 aa  328  8e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.003891  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>