More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_3087 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_3087  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  100 
 
 
370 aa  767    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.138011 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2094  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  70.6 
 
 
368 aa  551  1e-156  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0639  Oye family NADH-dependent flavin oxidoreductase  59.56 
 
 
372 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4760  flavin oxidoreductase/NADH oxidase  57.06 
 
 
365 aa  418  1e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000142373  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5482  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  53.95 
 
 
404 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.62329  normal  0.848973 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1258  NADH-flavin oxidoreductase/NADH oxidase  53.85 
 
 
371 aa  395  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0423  FMN oxidoreductase protein  54.42 
 
 
364 aa  392  1e-108  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6900  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  52.32 
 
 
404 aa  394  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2058  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  54.44 
 
 
363 aa  388  1e-107  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3698  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  54.85 
 
 
364 aa  384  1e-105  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.014573 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0473  NADH:flavin oxidoreductase  53.44 
 
 
368 aa  379  1e-104  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0475  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  54.72 
 
 
365 aa  379  1e-104  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.261593  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2173  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  53.3 
 
 
363 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.789599  hitchhiker  0.00631395 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1830  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  53.61 
 
 
358 aa  377  1e-103  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.028835  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4062  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  53.2 
 
 
462 aa  375  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00355793  normal  0.310254 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1046  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  53.15 
 
 
368 aa  373  1e-102  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.758573  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2202  N-ethylmaleimide reductase  53.83 
 
 
365 aa  374  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.209286  hitchhiker  0.0000409278 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1282  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  55.71 
 
 
349 aa  374  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1871  N-ethylmaleimide reductase  53.3 
 
 
365 aa  371  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00554959  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1762  N-ethylmaleimide reductase  53.3 
 
 
365 aa  371  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000139789  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5363  N-ethylmaleimide reductase  51.52 
 
 
373 aa  374  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.444499  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1138  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  53.15 
 
 
368 aa  373  1e-102  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0230317  normal  0.571173 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2565  N-ethylmaleimide reductase  53.3 
 
 
365 aa  371  1e-102  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111821  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1202  flavoprotein NADH-dependent oxidoreductase  53.55 
 
 
378 aa  370  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.655444 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5271  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  53.13 
 
 
360 aa  369  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1865  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase family protein  52.59 
 
 
360 aa  369  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0627  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  51.21 
 
 
369 aa  369  1e-101  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1477  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  48.23 
 
 
371 aa  368  1e-101  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2240  N-ethylmaleimide reductase, FMN-linked  53.72 
 
 
365 aa  370  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5123  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  50.28 
 
 
362 aa  366  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2243  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  53.2 
 
 
354 aa  365  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4210  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  52.34 
 
 
372 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1327  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  51.8 
 
 
364 aa  367  1e-100  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1368  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  52.91 
 
 
367 aa  368  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.523786  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05639  N-ethylmaleimide reductase  47.8 
 
 
366 aa  367  1e-100  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3889  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  52.3 
 
 
366 aa  367  1e-100  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.212192  normal  0.106591 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3133  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  50.68 
 
 
375 aa  365  1e-100  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.656366  normal  0.303319 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2006  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  51.92 
 
 
364 aa  366  1e-100  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4736  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  53.13 
 
 
360 aa  366  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0161  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  52.72 
 
 
369 aa  367  1e-100  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2934  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  52.76 
 
 
367 aa  365  1e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.522129  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2445  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  51.23 
 
 
371 aa  364  1e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2479  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  52.59 
 
 
366 aa  365  1e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4064  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  53.87 
 
 
376 aa  364  2e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0961  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  53.61 
 
 
351 aa  363  2e-99  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.943991  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0481  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  52.78 
 
 
369 aa  363  2e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.239535 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0920  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  54.04 
 
 
349 aa  363  3e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4888  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  52.69 
 
 
366 aa  362  4e-99  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2277  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  50.94 
 
 
363 aa  362  5.0000000000000005e-99  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.178772 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0959  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  54.04 
 
 
349 aa  362  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.224706 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2362  N-ethylmaleimide reductase  52.8 
 
 
365 aa  362  8e-99  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.003891  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000261  N-ethylmaleimide reductase  47.51 
 
 
366 aa  362  8e-99  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37800  NADH:flavin xenobiotic reductase  52.92 
 
 
349 aa  361  9e-99  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0113  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  53.02 
 
 
364 aa  361  9e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.15352  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0353  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  49.86 
 
 
366 aa  361  1e-98  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.798317 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56660  xenobiotic reductase  53.89 
 
 
350 aa  361  1e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3143  oxidoreductase  51.08 
 
 
371 aa  360  2e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.683924  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1548  N-ethylmaleimide reductase  52.53 
 
 
365 aa  360  2e-98  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.284503  normal  0.889457 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1990  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  52.53 
 
 
365 aa  360  3e-98  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000017212  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1861  N-ethylmaleimide reductase  52.53 
 
 
365 aa  360  3e-98  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.105495  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4053  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  53.2 
 
 
349 aa  360  3e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.477429  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1979  N-ethylmaleimide reductase  52.53 
 
 
365 aa  360  3e-98  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0402402  hitchhiker  0.00127595 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4927  xenobiotic reductase  53.76 
 
 
350 aa  360  3e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1727  N-ethylmaleimide reductase  52.53 
 
 
365 aa  360  3e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0759  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  53.42 
 
 
373 aa  359  4e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.882539  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4754  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  51.5 
 
 
371 aa  359  4e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.750935 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1240  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  53.42 
 
 
373 aa  359  4e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4358  oxidoreductase, FAD/FMN-binding protein  53.2 
 
 
349 aa  359  5e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4856  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  51.36 
 
 
371 aa  359  5e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.166947  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3350  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  50.82 
 
 
371 aa  359  5e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.70851  normal  0.0716807 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5299  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  51.23 
 
 
371 aa  358  6e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.246787 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5413  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  51.09 
 
 
371 aa  358  7e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00342687 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5449  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  51.09 
 
 
371 aa  358  7e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01620  N-ethylmaleimide reductase, FMN-linked  52.27 
 
 
365 aa  358  8e-98  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00072509  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01610  hypothetical protein  52.27 
 
 
365 aa  358  8e-98  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00066304  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0503  NADH-flavin oxidoreductase/NADH oxidase  52.34 
 
 
373 aa  358  9e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1210  N-ethylmaleimide reductase  52.08 
 
 
353 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5643  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.61 
 
 
379 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1356  N-ethylmaleimide reductase  52.08 
 
 
353 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1539  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  52.5 
 
 
358 aa  357  1.9999999999999998e-97  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.31269  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2474  N-ethylmaleimide reductase  52.08 
 
 
353 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.22498  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0619  N-ethylmaleimide reductase  52.08 
 
 
353 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.727216  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0951  N-ethylmaleimide reductase  52.08 
 
 
353 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1283  N-ethylmaleimide reductase  52.08 
 
 
353 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.105035  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0340  N-ethylmaleimide reductase  52.08 
 
 
353 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1120  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  52.65 
 
 
349 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.395455 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0239  NADH-flavin oxidoreductase/NADH oxidase  49.73 
 
 
371 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1842  N-ethylmaleimide reductase  52 
 
 
365 aa  356  5e-97  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.234054  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1213  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  53.42 
 
 
373 aa  355  5.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5805  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  52.21 
 
 
353 aa  354  1e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.452386 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0104  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  50.14 
 
 
369 aa  354  1e-96  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3892  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  53.04 
 
 
353 aa  353  2e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1907  N-ethylmaleimide reductase  52.46 
 
 
365 aa  354  2e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1738  N-ethylmaleimide reductase  52.46 
 
 
365 aa  353  2e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.105113  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1523  N-ethylmaleimide reductase  52.37 
 
 
353 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.512635  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1546  N-ethylmaleimide reductase  52.46 
 
 
365 aa  353  2.9999999999999997e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3077  NADH:flavin oxidoreductase / NADH oxidase family protein  49.87 
 
 
367 aa  353  4e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0951  NADH-flavin oxidoreductase/NADH oxidase  52.22 
 
 
353 aa  352  4e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0527  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  50.14 
 
 
364 aa  352  4e-96  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000582324  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2725  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  50.54 
 
 
374 aa  353  4e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.245117  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>