More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_0959 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010322  PputGB1_4468  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  96.85 
 
 
349 aa  689    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.101693 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0920  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  99.43 
 
 
349 aa  707    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0986  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  93.98 
 
 
349 aa  677    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000257245 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0959  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  100 
 
 
349 aa  711    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.224706 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1282  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  87.68 
 
 
349 aa  630  1e-179  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1120  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  82.81 
 
 
349 aa  601  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.395455 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4358  oxidoreductase, FAD/FMN-binding protein  80.8 
 
 
349 aa  594  1e-169  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4053  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  81.09 
 
 
349 aa  595  1e-169  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.477429  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4927  xenobiotic reductase  81.66 
 
 
350 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37800  NADH:flavin xenobiotic reductase  81.38 
 
 
349 aa  583  1.0000000000000001e-165  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56660  xenobiotic reductase  81.66 
 
 
350 aa  580  1e-164  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4064  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  74.29 
 
 
376 aa  523  1e-147  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0961  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  71.63 
 
 
351 aa  513  1e-144  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.943991  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2018  putative N-ethylmaleimide reductase  71.63 
 
 
353 aa  511  1e-144  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.791001  normal  0.023954 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4764  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  71.92 
 
 
353 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.211845 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5805  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  71.06 
 
 
353 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.452386 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0951  NADH-flavin oxidoreductase/NADH oxidase  72.21 
 
 
353 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3603  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  71.92 
 
 
353 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.682555  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5519  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  71.92 
 
 
353 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.824672 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4675  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  72.21 
 
 
353 aa  503  1e-141  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.650243 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4150  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  72.21 
 
 
353 aa  503  1e-141  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3892  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  71.35 
 
 
353 aa  498  1e-140  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4808  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  69.34 
 
 
353 aa  496  1e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.147658 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1106  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  70.86 
 
 
354 aa  492  9.999999999999999e-139  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000558272  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0340  N-ethylmaleimide reductase  69.91 
 
 
353 aa  488  1e-137  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1356  N-ethylmaleimide reductase  69.91 
 
 
353 aa  488  1e-137  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2474  N-ethylmaleimide reductase  69.91 
 
 
353 aa  488  1e-137  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.22498  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1523  N-ethylmaleimide reductase  69.34 
 
 
353 aa  488  1e-137  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.512635  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1283  N-ethylmaleimide reductase  69.91 
 
 
353 aa  488  1e-137  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.105035  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1210  N-ethylmaleimide reductase  69.91 
 
 
353 aa  488  1e-137  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0619  N-ethylmaleimide reductase  69.91 
 
 
353 aa  488  1e-137  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.727216  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0951  N-ethylmaleimide reductase  69.91 
 
 
353 aa  488  1e-137  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2300  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  69.05 
 
 
354 aa  483  1e-135  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0996208 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2058  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  67.05 
 
 
358 aa  473  1e-132  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.416223  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1733  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  67.44 
 
 
355 aa  451  1e-125  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.502414  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1313  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  58.29 
 
 
352 aa  418  1e-116  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4760  flavin oxidoreductase/NADH oxidase  58.76 
 
 
365 aa  391  1e-107  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000142373  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0423  FMN oxidoreductase protein  54.78 
 
 
364 aa  386  1e-106  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1258  NADH-flavin oxidoreductase/NADH oxidase  56.27 
 
 
371 aa  387  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0101  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  52.82 
 
 
369 aa  375  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.70129 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0104  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  53.11 
 
 
369 aa  377  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1539  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  54.06 
 
 
358 aa  365  1e-100  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.31269  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1830  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  56.25 
 
 
358 aa  364  1e-99  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.028835  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3087  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  54.04 
 
 
370 aa  362  5.0000000000000005e-99  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.138011 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0481  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  54.97 
 
 
369 aa  362  5.0000000000000005e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.239535 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0639  Oye family NADH-dependent flavin oxidoreductase  55.62 
 
 
372 aa  356  2.9999999999999997e-97  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1327  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  53.65 
 
 
364 aa  356  3.9999999999999996e-97  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0353  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  50.7 
 
 
366 aa  352  7e-96  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.798317 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2447  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  54.73 
 
 
351 aa  352  8e-96  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.537273  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0473  NADH:flavin oxidoreductase  54.9 
 
 
368 aa  348  1e-94  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3689  GTN reductase  53.78 
 
 
360 aa  347  2e-94  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2984  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  52.39 
 
 
361 aa  345  5e-94  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.167784  normal  0.0406088 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1721  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  52.39 
 
 
363 aa  345  8e-94  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2048  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  49.58 
 
 
420 aa  344  1e-93  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.786135 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5123  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  50.56 
 
 
362 aa  344  1e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3683  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  49.72 
 
 
368 aa  344  2e-93  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2323  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  49.3 
 
 
362 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.945849  normal  0.709974 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2094  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  53.2 
 
 
368 aa  342  4e-93  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3133  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  50.28 
 
 
375 aa  342  4e-93  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.656366  normal  0.303319 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2009  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  49.86 
 
 
362 aa  342  7e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.443363  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2277  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  51.84 
 
 
363 aa  341  1e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.178772 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2240  N-ethylmaleimide reductase, FMN-linked  51.83 
 
 
365 aa  340  2e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0091  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  48.31 
 
 
367 aa  340  2.9999999999999998e-92  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2058  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  51.4 
 
 
363 aa  339  4e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3698  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  51.97 
 
 
364 aa  338  5.9999999999999996e-92  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.014573 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2479  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  52.26 
 
 
366 aa  335  5.999999999999999e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0475  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  53.54 
 
 
365 aa  335  7e-91  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.261593  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1865  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase family protein  50.56 
 
 
360 aa  335  1e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0113  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  52.82 
 
 
364 aa  334  1e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.15352  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2934  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  51.12 
 
 
367 aa  333  2e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.522129  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1415  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  49.86 
 
 
375 aa  334  2e-90  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.193692  hitchhiker  0.0000159573 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5482  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  50.54 
 
 
404 aa  334  2e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.62329  normal  0.848973 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1368  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  50.42 
 
 
367 aa  332  4e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.523786  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3143  oxidoreductase  50 
 
 
371 aa  332  6e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.683924  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1046  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  52.5 
 
 
368 aa  332  7.000000000000001e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.758573  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5363  N-ethylmaleimide reductase  51.94 
 
 
373 aa  331  1e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.444499  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4740  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  50.14 
 
 
361 aa  331  1e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.952226 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1202  flavoprotein NADH-dependent oxidoreductase  52.22 
 
 
378 aa  330  2e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.655444 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3077  NADH:flavin oxidoreductase / NADH oxidase family protein  50.56 
 
 
367 aa  330  2e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1138  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  52.22 
 
 
368 aa  330  3e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0230317  normal  0.571173 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4888  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  51.4 
 
 
366 aa  329  4e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0161  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  52.2 
 
 
369 aa  329  5.0000000000000004e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2173  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  50.14 
 
 
363 aa  328  6e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.789599  hitchhiker  0.00631395 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2006  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  50.7 
 
 
364 aa  328  7e-89  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1374  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  49.03 
 
 
366 aa  328  9e-89  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5271  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  50.85 
 
 
360 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4210  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  50 
 
 
372 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4062  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  50.28 
 
 
462 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00355793  normal  0.310254 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4736  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  50.56 
 
 
360 aa  326  3e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0627  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  49.3 
 
 
369 aa  326  4.0000000000000003e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0063  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  50.54 
 
 
366 aa  326  5e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001682  NADH:flavin oxidoreductases Old Yellow Enzyme family  48.86 
 
 
358 aa  325  7e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21900  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  51.56 
 
 
356 aa  325  7e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05639  N-ethylmaleimide reductase  47.49 
 
 
366 aa  325  9e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0217  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  48.02 
 
 
358 aa  325  9e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3337  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  50.97 
 
 
366 aa  324  1e-87  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.853929  normal  0.657426 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0759  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  52.25 
 
 
373 aa  324  1e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.882539  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1240  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  52.25 
 
 
373 aa  324  1e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3021  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  50.28 
 
 
368 aa  324  2e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.347142  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0039  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  49.18 
 
 
367 aa  323  2e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>