More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1374 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1374  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  100 
 
 
366 aa  751    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0578  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  85.02 
 
 
324 aa  476  1e-133  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0473  NADH:flavin oxidoreductase  57.45 
 
 
368 aa  412  1e-114  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1830  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  56.11 
 
 
358 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.028835  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0481  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  53.31 
 
 
369 aa  389  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.239535 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1242  NADH-flavin oxidoreductase/NADH oxidase  53.57 
 
 
371 aa  386  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.102798  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0639  Oye family NADH-dependent flavin oxidoreductase  53.83 
 
 
372 aa  380  1e-104  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01763  GTN Reductase  52.19 
 
 
372 aa  379  1e-104  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.553032  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2240  N-ethylmaleimide reductase, FMN-linked  53.61 
 
 
365 aa  378  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1258  NADH-flavin oxidoreductase/NADH oxidase  54.17 
 
 
371 aa  379  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4760  flavin oxidoreductase/NADH oxidase  53.01 
 
 
365 aa  378  1e-103  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000142373  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5123  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  53.07 
 
 
362 aa  374  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1643  putative NADH-dependent flavin oxidoreductase  52.16 
 
 
387 aa  372  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3698  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  53.04 
 
 
364 aa  372  1e-102  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.014573 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5482  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  50.96 
 
 
404 aa  371  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.62329  normal  0.848973 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4062  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  53.46 
 
 
462 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00355793  normal  0.310254 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3133  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  51.93 
 
 
375 aa  370  1e-101  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.656366  normal  0.303319 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1721  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  51.51 
 
 
363 aa  366  1e-100  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1368  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  51.09 
 
 
367 aa  366  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.523786  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3683  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  50.81 
 
 
368 aa  366  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3689  GTN reductase  52.35 
 
 
360 aa  364  1e-99  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0104  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  50.56 
 
 
369 aa  363  2e-99  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4767  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  50.55 
 
 
371 aa  363  3e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.323845  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5133  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  53.33 
 
 
374 aa  362  7.0000000000000005e-99  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.249326  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0101  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  50.28 
 
 
369 aa  361  8e-99  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.70129 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0353  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  51.39 
 
 
366 aa  360  2e-98  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.798317 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4210  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  50.97 
 
 
372 aa  360  3e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6900  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  49.32 
 
 
404 aa  359  4e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2006  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  51.39 
 
 
364 aa  358  6e-98  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0475  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  53.19 
 
 
365 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.261593  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4888  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  51.52 
 
 
366 aa  355  5e-97  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1327  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  50.14 
 
 
364 aa  352  8e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2058  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  50.28 
 
 
363 aa  349  4e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3143  oxidoreductase  48.65 
 
 
371 aa  348  7e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.683924  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1539  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  48.61 
 
 
358 aa  347  1e-94  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.31269  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2277  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  49.59 
 
 
363 aa  346  4e-94  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.178772 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0627  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  48.49 
 
 
369 aa  345  5e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2173  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  50.28 
 
 
363 aa  345  5e-94  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.789599  hitchhiker  0.00631395 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1468  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  48.79 
 
 
371 aa  344  1e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3087  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.81 
 
 
370 aa  344  1e-93  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.138011 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1494  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  52.05 
 
 
362 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0995744  normal  0.674714 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2094  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.12 
 
 
368 aa  343  2.9999999999999997e-93  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2805  putative NADH-flavin oxidoreductase  52.05 
 
 
362 aa  343  4e-93  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5128  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  50.14 
 
 
371 aa  342  5e-93  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1865  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase family protein  48.76 
 
 
360 aa  342  8e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4257  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  50.55 
 
 
371 aa  341  1e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0902  oxidoreductase, FMN-binding  50 
 
 
371 aa  340  2e-92  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0039  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  49.32 
 
 
367 aa  340  2e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0845  oxidoreductase, FMN-binding  50 
 
 
371 aa  340  2e-92  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26130  morphinone reductase  48.91 
 
 
369 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.243745  normal  0.290118 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4736  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  50.14 
 
 
360 aa  339  4e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2479  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  49.59 
 
 
366 aa  339  5.9999999999999996e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0022  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.98 
 
 
374 aa  338  5.9999999999999996e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.788307 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1157  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  52.05 
 
 
362 aa  338  7e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.10298  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0040  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.98 
 
 
374 aa  338  8e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.177424  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5271  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  49.86 
 
 
360 aa  336  2.9999999999999997e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21900  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  49.03 
 
 
356 aa  337  2.9999999999999997e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0423  FMN oxidoreductase protein  48.06 
 
 
364 aa  335  9e-91  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0113  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  50 
 
 
364 aa  333  2e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.15352  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4103  N-ethylmaleimide reductase  46.98 
 
 
369 aa  334  2e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1871  N-ethylmaleimide reductase  47.31 
 
 
365 aa  333  3e-90  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00554959  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2565  N-ethylmaleimide reductase  47.31 
 
 
365 aa  333  3e-90  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111821  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1762  N-ethylmaleimide reductase  47.31 
 
 
365 aa  333  3e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000139789  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2934  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  49.17 
 
 
367 aa  333  4e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.522129  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0037  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.15 
 
 
372 aa  332  4e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1240  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.43 
 
 
373 aa  332  5e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0759  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.43 
 
 
373 aa  332  5e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.882539  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1313  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.78 
 
 
352 aa  332  7.000000000000001e-90  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4095  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  48.35 
 
 
369 aa  332  8e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1099  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.5 
 
 
360 aa  331  1e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.106909  normal  0.659732 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1210  N-ethylmaleimide reductase  48.33 
 
 
353 aa  330  2e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1245  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  48.11 
 
 
373 aa  330  3e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.939474  normal  0.298722 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1796  N-ethylmaleimide reductase  47.03 
 
 
365 aa  329  4e-89  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.287349  normal  0.0323819 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2202  N-ethylmaleimide reductase  47.03 
 
 
365 aa  329  4e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.209286  hitchhiker  0.0000409278 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0920  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  49.03 
 
 
349 aa  329  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0503  NADH-flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.81 
 
 
373 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2243  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  48.46 
 
 
354 aa  329  6e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4051  putative oxidoreductase  46.13 
 
 
370 aa  328  7e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0063  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  48.11 
 
 
366 aa  328  8e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1356  N-ethylmaleimide reductase  48.06 
 
 
353 aa  328  9e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0340  N-ethylmaleimide reductase  48.06 
 
 
353 aa  328  9e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0619  N-ethylmaleimide reductase  48.06 
 
 
353 aa  328  9e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.727216  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2474  N-ethylmaleimide reductase  48.06 
 
 
353 aa  328  9e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.22498  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1283  N-ethylmaleimide reductase  48.06 
 
 
353 aa  328  9e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.105035  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0951  N-ethylmaleimide reductase  48.06 
 
 
353 aa  328  9e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1778  N-ethylmaleimide reductase  46.88 
 
 
385 aa  328  1.0000000000000001e-88  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0404  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  48.24 
 
 
373 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0959  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  49.03 
 
 
349 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.224706 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1213  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.68 
 
 
373 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1202  flavoprotein NADH-dependent oxidoreductase  48.26 
 
 
378 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.655444 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2616  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.94 
 
 
365 aa  327  2.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3077  NADH:flavin oxidoreductase / NADH oxidase family protein  46.99 
 
 
367 aa  326  3e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1738  N-ethylmaleimide reductase  47.55 
 
 
365 aa  327  3e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.105113  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1245  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  50.27 
 
 
367 aa  327  3e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0291096 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47000  putative oxidoreductase  44.8 
 
 
370 aa  326  3e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.246244  normal  0.208347 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4468  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  48.48 
 
 
349 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.101693 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1046  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  48.78 
 
 
368 aa  326  4.0000000000000003e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.758573  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1138  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  48.78 
 
 
368 aa  325  5e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0230317  normal  0.571173 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1907  N-ethylmaleimide reductase  47.01 
 
 
365 aa  325  6e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1533  N-ethylmaleimide reductase  47.28 
 
 
365 aa  325  9e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.111843  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>