More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0639 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA0639  Oye family NADH-dependent flavin oxidoreductase  100 
 
 
372 aa  756    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5482  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  66.3 
 
 
404 aa  498  1e-140  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.62329  normal  0.848973 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6900  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  65.75 
 
 
404 aa  483  1e-135  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2094  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  62.87 
 
 
368 aa  460  9.999999999999999e-129  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2445  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  61.31 
 
 
371 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3087  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  59.56 
 
 
370 aa  446  1.0000000000000001e-124  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.138011 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4760  flavin oxidoreductase/NADH oxidase  61.92 
 
 
365 aa  433  1e-120  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000142373  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1830  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  60 
 
 
358 aa  423  1e-117  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.028835  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0473  NADH:flavin oxidoreductase  59.78 
 
 
368 aa  417  9.999999999999999e-116  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1258  NADH-flavin oxidoreductase/NADH oxidase  58.36 
 
 
371 aa  408  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0161  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  56.49 
 
 
369 aa  398  9.999999999999999e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1202  flavoprotein NADH-dependent oxidoreductase  54.69 
 
 
378 aa  395  1e-109  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.655444 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1242  NADH-flavin oxidoreductase/NADH oxidase  56.72 
 
 
371 aa  396  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.102798  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3133  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  54.64 
 
 
375 aa  395  1e-109  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.656366  normal  0.303319 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0481  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  57.18 
 
 
369 aa  394  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.239535 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3698  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  55.5 
 
 
364 aa  394  1e-108  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.014573 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1138  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  54.42 
 
 
368 aa  392  1e-108  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0230317  normal  0.571173 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1046  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  54.96 
 
 
368 aa  394  1e-108  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.758573  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1356  N-ethylmaleimide reductase  58.42 
 
 
353 aa  390  1e-107  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0951  N-ethylmaleimide reductase  58.42 
 
 
353 aa  390  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1283  N-ethylmaleimide reductase  58.42 
 
 
353 aa  390  1e-107  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.105035  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2474  N-ethylmaleimide reductase  58.42 
 
 
353 aa  390  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.22498  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0619  N-ethylmaleimide reductase  58.42 
 
 
353 aa  390  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.727216  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2240  N-ethylmaleimide reductase, FMN-linked  55.41 
 
 
365 aa  390  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0340  N-ethylmaleimide reductase  58.42 
 
 
353 aa  390  1e-107  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1210  N-ethylmaleimide reductase  58.42 
 
 
353 aa  390  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0353  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  55.86 
 
 
366 aa  389  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.798317 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4767  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  55.73 
 
 
371 aa  387  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.323845  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1368  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  53.6 
 
 
367 aa  386  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.523786  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4062  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  55.11 
 
 
462 aa  385  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00355793  normal  0.310254 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26130  morphinone reductase  56.37 
 
 
369 aa  386  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.243745  normal  0.290118 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1865  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase family protein  55.86 
 
 
360 aa  384  1e-105  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1523  N-ethylmaleimide reductase  57.61 
 
 
353 aa  382  1e-105  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.512635  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2006  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  54.84 
 
 
364 aa  380  1e-104  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0527  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  54.5 
 
 
364 aa  381  1e-104  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000582324  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1721  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  57.02 
 
 
363 aa  380  1e-104  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1539  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  55.34 
 
 
358 aa  378  1e-104  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.31269  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2058  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  53.93 
 
 
363 aa  379  1e-104  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4051  putative oxidoreductase  55.5 
 
 
370 aa  380  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5363  N-ethylmaleimide reductase  54.86 
 
 
373 aa  379  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.444499  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1374  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  53.83 
 
 
366 aa  380  1e-104  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1907  N-ethylmaleimide reductase  53.55 
 
 
365 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0951  NADH-flavin oxidoreductase/NADH oxidase  56.52 
 
 
353 aa  376  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1172  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  53.37 
 
 
359 aa  377  1e-103  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.210538 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4210  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  53.07 
 
 
372 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1327  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  55.16 
 
 
364 aa  377  1e-103  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1546  N-ethylmaleimide reductase  53.55 
 
 
365 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1606  N-ethylmaleimide reductase  53.28 
 
 
365 aa  375  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4150  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  56.52 
 
 
353 aa  375  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01620  N-ethylmaleimide reductase, FMN-linked  52.3 
 
 
365 aa  373  1e-102  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00072509  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1990  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  52.3 
 
 
365 aa  373  1e-102  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000017212  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1861  N-ethylmaleimide reductase  52.3 
 
 
365 aa  373  1e-102  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.105495  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4764  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  56.25 
 
 
353 aa  373  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.211845 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1245  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  53.78 
 
 
373 aa  373  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.939474  normal  0.298722 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4675  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  56.52 
 
 
353 aa  375  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.650243 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1738  N-ethylmaleimide reductase  53.28 
 
 
365 aa  374  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.105113  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1727  N-ethylmaleimide reductase  52.3 
 
 
365 aa  373  1e-102  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2362  N-ethylmaleimide reductase  52.03 
 
 
365 aa  372  1e-102  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.003891  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4808  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  56.28 
 
 
353 aa  372  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.147658 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0627  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  53.53 
 
 
369 aa  371  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5519  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  56.25 
 
 
353 aa  373  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.824672 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1979  N-ethylmaleimide reductase  52.3 
 
 
365 aa  373  1e-102  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0402402  hitchhiker  0.00127595 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1548  N-ethylmaleimide reductase  52.3 
 
 
365 aa  374  1e-102  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.284503  normal  0.889457 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3603  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  56.25 
 
 
353 aa  373  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.682555  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1533  N-ethylmaleimide reductase  53.01 
 
 
365 aa  373  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.111843  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3689  GTN reductase  55.43 
 
 
360 aa  373  1e-102  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01610  hypothetical protein  52.3 
 
 
365 aa  373  1e-102  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00066304  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2277  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  54.28 
 
 
363 aa  374  1e-102  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.178772 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47000  putative oxidoreductase  54.81 
 
 
370 aa  371  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.246244  normal  0.208347 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3683  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  52.69 
 
 
368 aa  371  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0423  FMN oxidoreductase protein  54.64 
 
 
364 aa  370  1e-101  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2479  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  54.86 
 
 
366 aa  371  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0113  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  55.91 
 
 
364 aa  371  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.15352  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1842  N-ethylmaleimide reductase  51.49 
 
 
365 aa  369  1e-101  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.234054  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4888  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  53.87 
 
 
366 aa  368  1e-101  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2173  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  52.7 
 
 
363 aa  369  1e-101  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.789599  hitchhiker  0.00631395 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3892  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  55.71 
 
 
353 aa  368  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5271  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  54.89 
 
 
360 aa  368  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1477  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  51.34 
 
 
371 aa  367  1e-100  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0104  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  52.57 
 
 
369 aa  366  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0902  oxidoreductase, FMN-binding  53.39 
 
 
371 aa  367  1e-100  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1871  N-ethylmaleimide reductase  50.81 
 
 
365 aa  367  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00554959  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0475  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  55.08 
 
 
365 aa  367  1e-100  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.261593  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0404  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  54.64 
 
 
373 aa  365  1e-100  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1762  N-ethylmaleimide reductase  50.81 
 
 
365 aa  367  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000139789  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0845  oxidoreductase, FMN-binding  53.39 
 
 
371 aa  367  1e-100  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1468  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  51.76 
 
 
371 aa  365  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2565  N-ethylmaleimide reductase  50.81 
 
 
365 aa  367  1e-100  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111821  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4736  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  54.89 
 
 
360 aa  366  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0101  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  52.3 
 
 
369 aa  364  1e-99  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.70129 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5123  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  53.3 
 
 
362 aa  363  3e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1643  putative NADH-dependent flavin oxidoreductase  52.45 
 
 
387 aa  363  3e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5805  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  55.07 
 
 
353 aa  362  4e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.452386 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1796  N-ethylmaleimide reductase  50.82 
 
 
365 aa  362  4e-99  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.287349  normal  0.0323819 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0593  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  50.82 
 
 
363 aa  362  5.0000000000000005e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2202  N-ethylmaleimide reductase  50 
 
 
365 aa  361  9e-99  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.209286  hitchhiker  0.0000409278 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2018  putative N-ethylmaleimide reductase  55.34 
 
 
353 aa  361  9e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.791001  normal  0.023954 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3143  oxidoreductase  49.2 
 
 
371 aa  360  3e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.683924  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5128  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  52.03 
 
 
371 aa  359  4e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4064  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  55.46 
 
 
376 aa  358  6e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>