More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4150 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B0951  NADH-flavin oxidoreductase/NADH oxidase  95.75 
 
 
353 aa  685    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3892  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  93.77 
 
 
353 aa  672    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4764  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  94.62 
 
 
353 aa  676    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.211845 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3603  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  94.62 
 
 
353 aa  676    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.682555  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4675  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  98.87 
 
 
353 aa  707    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.650243 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4150  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  100 
 
 
353 aa  712    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5519  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  94.62 
 
 
353 aa  676    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.824672 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1523  N-ethylmaleimide reductase  82.44 
 
 
353 aa  599  1e-170  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.512635  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0619  N-ethylmaleimide reductase  81.87 
 
 
353 aa  596  1e-169  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.727216  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1356  N-ethylmaleimide reductase  81.87 
 
 
353 aa  596  1e-169  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2474  N-ethylmaleimide reductase  81.87 
 
 
353 aa  596  1e-169  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.22498  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0340  N-ethylmaleimide reductase  81.87 
 
 
353 aa  596  1e-169  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0951  N-ethylmaleimide reductase  81.87 
 
 
353 aa  596  1e-169  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1210  N-ethylmaleimide reductase  81.87 
 
 
353 aa  595  1e-169  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1283  N-ethylmaleimide reductase  81.87 
 
 
353 aa  596  1e-169  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.105035  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4808  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  80.52 
 
 
353 aa  580  1e-164  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.147658 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2018  putative N-ethylmaleimide reductase  80 
 
 
353 aa  579  1e-164  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.791001  normal  0.023954 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5805  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  78.57 
 
 
353 aa  569  1e-161  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.452386 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4064  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  77.43 
 
 
376 aa  557  1e-157  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0961  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  75.14 
 
 
351 aa  538  9.999999999999999e-153  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.943991  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2300  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  73.3 
 
 
354 aa  524  1e-147  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0996208 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37800  NADH:flavin xenobiotic reductase  73.93 
 
 
349 aa  521  1e-147  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1120  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  72.21 
 
 
349 aa  514  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.395455 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56660  xenobiotic reductase  73.71 
 
 
350 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4927  xenobiotic reductase  73.35 
 
 
350 aa  513  1e-144  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0920  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  72.49 
 
 
349 aa  504  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0986  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  72.21 
 
 
349 aa  504  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000257245 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0959  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  72.21 
 
 
349 aa  503  1e-141  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.224706 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1282  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  71.92 
 
 
349 aa  501  1e-141  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4468  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  71.92 
 
 
349 aa  501  1e-141  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.101693 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4358  oxidoreductase, FAD/FMN-binding protein  68.77 
 
 
349 aa  482  1e-135  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4053  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  69.05 
 
 
349 aa  484  1e-135  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.477429  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1733  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  70.32 
 
 
355 aa  479  1e-134  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.502414  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1106  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  68.84 
 
 
354 aa  478  1e-133  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000558272  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2058  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  67.43 
 
 
358 aa  471  1e-132  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.416223  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1313  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  60.23 
 
 
352 aa  447  1e-125  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4760  flavin oxidoreductase/NADH oxidase  58.5 
 
 
365 aa  399  9.999999999999999e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000142373  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1327  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  55.83 
 
 
364 aa  380  1e-104  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0639  Oye family NADH-dependent flavin oxidoreductase  56.52 
 
 
372 aa  375  1e-103  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1258  NADH-flavin oxidoreductase/NADH oxidase  55.96 
 
 
371 aa  375  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0423  FMN oxidoreductase protein  53.39 
 
 
364 aa  372  1e-102  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0104  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  51.12 
 
 
369 aa  370  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1539  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  53.5 
 
 
358 aa  371  1e-101  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.31269  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0101  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  50.84 
 
 
369 aa  368  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.70129 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0353  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  51.25 
 
 
366 aa  364  1e-99  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.798317 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3698  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  55.43 
 
 
364 aa  363  2e-99  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.014573 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1721  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  53.93 
 
 
363 aa  360  1e-98  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2094  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  54.02 
 
 
368 aa  359  4e-98  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0481  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  54.64 
 
 
369 aa  356  2.9999999999999997e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.239535 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1830  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  54.62 
 
 
358 aa  355  5e-97  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.028835  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0627  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  52.96 
 
 
369 aa  355  5e-97  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0091  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  51.4 
 
 
367 aa  355  5.999999999999999e-97  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2984  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  53.07 
 
 
361 aa  354  1e-96  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.167784  normal  0.0406088 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3689  GTN reductase  54.02 
 
 
360 aa  354  1e-96  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2048  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  50.42 
 
 
420 aa  352  5e-96  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.786135 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0473  NADH:flavin oxidoreductase  53.74 
 
 
368 aa  352  7e-96  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1046  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  53.02 
 
 
368 aa  350  2e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.758573  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2323  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  50.14 
 
 
362 aa  350  2e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.945849  normal  0.709974 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3087  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  51.94 
 
 
370 aa  350  3e-95  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.138011 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3133  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  49.86 
 
 
375 aa  349  4e-95  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.656366  normal  0.303319 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2934  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  52.68 
 
 
367 aa  348  9e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.522129  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1368  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  52.68 
 
 
367 aa  347  1e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.523786  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3683  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  49.3 
 
 
368 aa  347  2e-94  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2009  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  50.42 
 
 
362 aa  347  2e-94  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.443363  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1138  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  52.75 
 
 
368 aa  347  2e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0230317  normal  0.571173 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5482  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  52.02 
 
 
404 aa  346  3e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.62329  normal  0.848973 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3077  NADH:flavin oxidoreductase / NADH oxidase family protein  52.68 
 
 
367 aa  345  7e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001682  NADH:flavin oxidoreductases Old Yellow Enzyme family  49.58 
 
 
358 aa  344  1e-93  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2058  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  50.84 
 
 
363 aa  343  2e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1202  flavoprotein NADH-dependent oxidoreductase  52.2 
 
 
378 aa  342  4e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.655444 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1865  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase family protein  52.09 
 
 
360 aa  343  4e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2243  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  53.43 
 
 
354 aa  342  8e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0217  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.73 
 
 
358 aa  342  8e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2479  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  51.8 
 
 
366 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0527  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  50.82 
 
 
364 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000582324  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4736  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  52.37 
 
 
360 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2277  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  51.38 
 
 
363 aa  339  4e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.178772 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4062  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  51.97 
 
 
462 aa  338  9e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00355793  normal  0.310254 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2447  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  52.57 
 
 
351 aa  337  1.9999999999999998e-91  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.537273  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4210  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  52.09 
 
 
372 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1468  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  51.61 
 
 
371 aa  337  2.9999999999999997e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2240  N-ethylmaleimide reductase, FMN-linked  52.53 
 
 
365 aa  336  2.9999999999999997e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2616  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  48.18 
 
 
365 aa  336  3.9999999999999995e-91  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3889  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  53.67 
 
 
366 aa  335  5e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.212192  normal  0.106591 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2173  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  50.84 
 
 
363 aa  335  5.999999999999999e-91  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.789599  hitchhiker  0.00631395 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0113  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  52.65 
 
 
364 aa  335  7e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.15352  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5271  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  51.81 
 
 
360 aa  334  1e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0905  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  50.42 
 
 
365 aa  335  1e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.26638  normal  0.722397 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5285  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  51.81 
 
 
370 aa  334  1e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2006  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  51.11 
 
 
364 aa  334  2e-90  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6900  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  50 
 
 
404 aa  332  5e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0774  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  50 
 
 
357 aa  332  8e-90  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000183199  normal  0.232924 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2445  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  51.09 
 
 
371 aa  332  9e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21900  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  52.41 
 
 
356 aa  331  1e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0902  oxidoreductase, FMN-binding  50.54 
 
 
371 aa  330  2e-89  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0404  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  52.85 
 
 
373 aa  330  2e-89  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0063  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  51.36 
 
 
366 aa  330  2e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0845  oxidoreductase, FMN-binding  50.54 
 
 
371 aa  330  2e-89  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0039  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  50.82 
 
 
367 aa  330  2e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4740  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  48.33 
 
 
361 aa  329  4e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.952226 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>