More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_4358 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_4358  oxidoreductase, FAD/FMN-binding protein  100 
 
 
349 aa  717    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4053  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  95.7 
 
 
349 aa  694    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.477429  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1282  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  82.81 
 
 
349 aa  613  9.999999999999999e-175  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0920  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  81.38 
 
 
349 aa  599  1e-170  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0986  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  81.66 
 
 
349 aa  599  1e-170  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000257245 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0959  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  80.8 
 
 
349 aa  594  1e-169  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.224706 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1120  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  80.23 
 
 
349 aa  591  1e-168  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.395455 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4468  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  80.23 
 
 
349 aa  591  1e-168  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.101693 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37800  NADH:flavin xenobiotic reductase  75.64 
 
 
349 aa  558  1e-158  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4927  xenobiotic reductase  76.5 
 
 
350 aa  551  1e-156  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56660  xenobiotic reductase  76.79 
 
 
350 aa  550  1e-155  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0961  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  69.91 
 
 
351 aa  497  1e-139  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.943991  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4064  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  70.57 
 
 
376 aa  497  1e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5519  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  70.49 
 
 
353 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.824672 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4764  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  70.49 
 
 
353 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.211845 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2018  putative N-ethylmaleimide reductase  69.34 
 
 
353 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.791001  normal  0.023954 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3603  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  70.49 
 
 
353 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.682555  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0951  NADH-flavin oxidoreductase/NADH oxidase  69.91 
 
 
353 aa  490  1e-137  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3892  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  69.34 
 
 
353 aa  489  1e-137  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5805  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  68.48 
 
 
353 aa  488  1e-137  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.452386 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4808  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  68.48 
 
 
353 aa  490  1e-137  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.147658 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4675  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  69.05 
 
 
353 aa  484  1e-136  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.650243 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4150  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  68.77 
 
 
353 aa  482  1e-135  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1106  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  65.14 
 
 
354 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000558272  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1523  N-ethylmaleimide reductase  66.48 
 
 
353 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.512635  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1210  N-ethylmaleimide reductase  66.19 
 
 
353 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0340  N-ethylmaleimide reductase  65.9 
 
 
353 aa  463  1e-129  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1356  N-ethylmaleimide reductase  65.9 
 
 
353 aa  463  1e-129  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2474  N-ethylmaleimide reductase  65.9 
 
 
353 aa  463  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.22498  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2058  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  64.76 
 
 
358 aa  463  1e-129  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.416223  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0619  N-ethylmaleimide reductase  65.9 
 
 
353 aa  463  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.727216  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1283  N-ethylmaleimide reductase  65.9 
 
 
353 aa  463  1e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.105035  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0951  N-ethylmaleimide reductase  65.9 
 
 
353 aa  463  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2300  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  65.62 
 
 
354 aa  464  1e-129  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0996208 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1733  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  64.84 
 
 
355 aa  438  9.999999999999999e-123  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.502414  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1313  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  59.71 
 
 
352 aa  426  1e-118  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0423  FMN oxidoreductase protein  54.78 
 
 
364 aa  384  1e-105  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4760  flavin oxidoreductase/NADH oxidase  55.65 
 
 
365 aa  372  1e-102  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000142373  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1258  NADH-flavin oxidoreductase/NADH oxidase  54.49 
 
 
371 aa  372  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0104  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  51.41 
 
 
369 aa  368  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0101  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  51.13 
 
 
369 aa  366  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.70129 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1539  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  51.55 
 
 
358 aa  362  8e-99  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.31269  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3087  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  53.2 
 
 
370 aa  359  4e-98  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.138011 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2058  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  52.96 
 
 
363 aa  350  2e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1721  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  53.24 
 
 
363 aa  349  4e-95  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1327  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  52.39 
 
 
364 aa  347  1e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3698  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  51.55 
 
 
364 aa  347  1e-94  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.014573 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3683  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  51.1 
 
 
368 aa  348  1e-94  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2277  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  52.12 
 
 
363 aa  345  8e-94  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.178772 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0481  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  54.04 
 
 
369 aa  345  8.999999999999999e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.239535 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3689  GTN reductase  52.94 
 
 
360 aa  344  1e-93  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0353  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  49.58 
 
 
366 aa  343  2e-93  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.798317 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1830  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  52.56 
 
 
358 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.028835  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2006  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  51.55 
 
 
364 aa  340  2.9999999999999998e-92  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2173  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  52.41 
 
 
363 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.789599  hitchhiker  0.00631395 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2240  N-ethylmaleimide reductase, FMN-linked  50.7 
 
 
365 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2048  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.62 
 
 
420 aa  333  2e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.786135 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2094  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  50.42 
 
 
368 aa  333  2e-90  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4736  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  51.13 
 
 
360 aa  333  2e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5271  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  51.13 
 
 
360 aa  333  4e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0113  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  51.13 
 
 
364 aa  332  5e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.15352  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2323  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.34 
 
 
362 aa  332  5e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.945849  normal  0.709974 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3133  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  48.89 
 
 
375 aa  332  5e-90  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.656366  normal  0.303319 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0902  oxidoreductase, FMN-binding  49.87 
 
 
371 aa  331  9e-90  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0845  oxidoreductase, FMN-binding  49.87 
 
 
371 aa  331  9e-90  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2009  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.61 
 
 
362 aa  331  1e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.443363  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2479  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  51.41 
 
 
366 aa  331  1e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4062  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  50.28 
 
 
462 aa  330  3e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00355793  normal  0.310254 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2984  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  49.58 
 
 
361 aa  330  3e-89  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.167784  normal  0.0406088 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21900  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  51.14 
 
 
356 aa  329  4e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001682  NADH:flavin oxidoreductases Old Yellow Enzyme family  48.58 
 
 
358 aa  329  5.0000000000000004e-89  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1865  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase family protein  49.15 
 
 
360 aa  327  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5482  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  48.64 
 
 
404 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.62329  normal  0.848973 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0473  NADH:flavin oxidoreductase  53.22 
 
 
368 aa  328  1.0000000000000001e-88  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2934  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  50 
 
 
367 aa  326  3e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.522129  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1099  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  48.88 
 
 
360 aa  323  2e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.106909  normal  0.659732 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4210  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  50 
 
 
372 aa  323  2e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2447  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  49.86 
 
 
351 aa  323  2e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.537273  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0161  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  50.27 
 
 
369 aa  324  2e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1468  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.17 
 
 
371 aa  323  3e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5123  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.19 
 
 
362 aa  323  4e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0475  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  50.99 
 
 
365 aa  322  6e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.261593  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0508  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  48.61 
 
 
365 aa  322  7e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1368  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  49.58 
 
 
367 aa  322  8e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.523786  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4888  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  50.56 
 
 
366 aa  322  8e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0639  Oye family NADH-dependent flavin oxidoreductase  50.41 
 
 
372 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0905  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.73 
 
 
365 aa  320  1.9999999999999998e-86  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.26638  normal  0.722397 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5363  N-ethylmaleimide reductase  49.44 
 
 
373 aa  320  1.9999999999999998e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.444499  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1046  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  49.17 
 
 
368 aa  320  3e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.758573  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1138  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  49.17 
 
 
368 aa  319  3.9999999999999996e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0230317  normal  0.571173 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0091  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.63 
 
 
367 aa  319  3.9999999999999996e-86  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3143  oxidoreductase  47.3 
 
 
371 aa  319  5e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.683924  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0063  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  49.46 
 
 
366 aa  319  5e-86  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0217  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.14 
 
 
358 aa  319  5e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0627  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.34 
 
 
369 aa  318  7.999999999999999e-86  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01763  GTN Reductase  49.15 
 
 
372 aa  318  9e-86  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.553032  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1172  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  49.29 
 
 
359 aa  318  1e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.210538 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1202  flavoprotein NADH-dependent oxidoreductase  49.17 
 
 
378 aa  317  2e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.655444 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5285  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  50 
 
 
370 aa  317  2e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0031  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.71 
 
 
371 aa  317  3e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.371979 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>