More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_2099 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009831  Ssed_2710  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  83.29 
 
 
366 aa  640    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05639  N-ethylmaleimide reductase  83.47 
 
 
366 aa  640    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2099  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  100 
 
 
366 aa  753    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.732064  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000261  N-ethylmaleimide reductase  83.2 
 
 
366 aa  633  1e-180  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2454  oxidoreductase, FMN-binding  79.89 
 
 
365 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5363  N-ethylmaleimide reductase  62.6 
 
 
373 aa  474  1e-133  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.444499  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3350  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  62.81 
 
 
371 aa  464  9.999999999999999e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.70851  normal  0.0716807 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0239  NADH-flavin oxidoreductase/NADH oxidase  61.98 
 
 
371 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2152  oxidoreductase, FMN-binding  61.16 
 
 
371 aa  461  1e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4856  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  61.71 
 
 
371 aa  456  1e-127  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.166947  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5413  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  61.43 
 
 
371 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00342687 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5449  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  61.43 
 
 
371 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4754  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  61.88 
 
 
371 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.750935 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5299  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  61.33 
 
 
371 aa  448  1e-125  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.246787 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0423  NADH:flavin oxidoreductase  60.5 
 
 
371 aa  448  1e-125  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.798102  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4051  putative oxidoreductase  59.78 
 
 
370 aa  438  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47000  putative oxidoreductase  59.5 
 
 
370 aa  431  1e-120  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.246244  normal  0.208347 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5219  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  58.54 
 
 
380 aa  422  1e-117  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2486  Oye family NADH-dependent flavin oxidoreductase  51.48 
 
 
374 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0454136  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1093  NADH-dependent flavin oxidoreductase, NADH oxidase  54.62 
 
 
375 aa  417  9.999999999999999e-116  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0396563 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20830  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase family protein  60.06 
 
 
379 aa  417  9.999999999999999e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0458981  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5643  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  52.16 
 
 
379 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1477  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  52.03 
 
 
371 aa  414  1e-114  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2424  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  60.88 
 
 
371 aa  408  1e-113  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.397481  normal  0.0764227 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3110  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  52.45 
 
 
374 aa  406  1.0000000000000001e-112  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2229  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  52.72 
 
 
374 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18430  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase family  51.34 
 
 
379 aa  407  1.0000000000000001e-112  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0593  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  52.76 
 
 
363 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0454  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  51.93 
 
 
378 aa  396  1e-109  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0473  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  51.93 
 
 
378 aa  395  1e-109  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0244  N-ethylmaleimide reductase  51.12 
 
 
367 aa  392  1e-108  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000624  N-ethylmaleimide reductase  51.25 
 
 
374 aa  394  1e-108  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4063  N-ethylmaleimide reductase, putative  52.37 
 
 
367 aa  394  1e-108  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06498  NADH-flavin oxidoreductase  50.56 
 
 
363 aa  389  1e-107  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0507  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  51.68 
 
 
363 aa  383  1e-105  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1326  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  53.26 
 
 
414 aa  381  1e-104  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0306285  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1778  N-ethylmaleimide reductase  51.5 
 
 
385 aa  376  1e-103  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4153  N-ethylmaleimide reductase, putative  50.97 
 
 
378 aa  371  1e-102  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0913  N-ethylmaleimide reductase  48.47 
 
 
365 aa  374  1e-102  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3021  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  51.82 
 
 
368 aa  365  1e-100  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.347142  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3337  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  51.1 
 
 
366 aa  361  1e-98  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.853929  normal  0.657426 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1046  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  48.9 
 
 
368 aa  355  5e-97  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.758573  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1202  flavoprotein NADH-dependent oxidoreductase  48.9 
 
 
378 aa  353  2.9999999999999997e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.655444 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1138  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  48.34 
 
 
368 aa  351  1e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0230317  normal  0.571173 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2094  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.4 
 
 
368 aa  347  2e-94  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26130  morphinone reductase  49.05 
 
 
369 aa  346  3e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.243745  normal  0.290118 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2906  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  48.11 
 
 
369 aa  345  1e-93  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2819  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  48.11 
 
 
369 aa  345  1e-93  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.726773  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5271  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  50.96 
 
 
360 aa  345  1e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4736  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  50.96 
 
 
360 aa  344  1e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0639  Oye family NADH-dependent flavin oxidoreductase  47.99 
 
 
372 aa  341  1e-92  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3087  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.36 
 
 
370 aa  339  5e-92  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.138011 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2445  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.89 
 
 
371 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1865  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase family protein  48.9 
 
 
360 aa  333  2e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2277  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  49.04 
 
 
363 aa  331  1e-89  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.178772 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2240  N-ethylmaleimide reductase, FMN-linked  49.18 
 
 
365 aa  329  4e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5123  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.43 
 
 
362 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2006  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  49.45 
 
 
364 aa  327  2.0000000000000001e-88  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0161  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.03 
 
 
369 aa  327  3e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4062  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  48.75 
 
 
462 aa  324  2e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00355793  normal  0.310254 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2805  putative NADH-flavin oxidoreductase  45.5 
 
 
362 aa  323  3e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1494  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.5 
 
 
362 aa  323  3e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0995744  normal  0.674714 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0104  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.88 
 
 
369 aa  323  4e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2058  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  48.63 
 
 
363 aa  322  6e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2479  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  48.23 
 
 
366 aa  322  6e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5482  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.11 
 
 
404 aa  322  7e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.62329  normal  0.848973 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6900  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.38 
 
 
404 aa  322  9.000000000000001e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2682  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.36 
 
 
372 aa  321  9.999999999999999e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0101  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.6 
 
 
369 aa  321  1.9999999999999998e-86  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.70129 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0473  NADH:flavin oxidoreductase  45.43 
 
 
368 aa  320  1.9999999999999998e-86  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3689  GTN reductase  48.48 
 
 
360 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1258  NADH-flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.4 
 
 
371 aa  320  3e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4760  flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.67 
 
 
365 aa  319  5e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000142373  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2173  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.37 
 
 
363 aa  318  7.999999999999999e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.789599  hitchhiker  0.00631395 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1242  NADH-flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.82 
 
 
371 aa  318  1e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.102798  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2202  N-ethylmaleimide reductase  44.9 
 
 
365 aa  317  2e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.209286  hitchhiker  0.0000409278 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0527  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.45 
 
 
364 aa  317  2e-85  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000582324  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0113  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  48.75 
 
 
364 aa  317  2e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.15352  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1374  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.82 
 
 
366 aa  317  2e-85  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1643  putative NADH-dependent flavin oxidoreductase  44.41 
 
 
387 aa  315  9.999999999999999e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1157  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.41 
 
 
362 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.10298  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1172  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.51 
 
 
359 aa  313  2.9999999999999996e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.210538 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1721  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.28 
 
 
363 aa  312  4.999999999999999e-84  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01763  GTN Reductase  47.11 
 
 
372 aa  311  1e-83  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.553032  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2453  N-ethylmaleimide reductase, putative  44.63 
 
 
362 aa  311  1e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4103  N-ethylmaleimide reductase  45.11 
 
 
369 aa  311  1e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4790  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.36 
 
 
367 aa  310  2e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.674778  normal  0.678422 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1327  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.56 
 
 
364 aa  311  2e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4210  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.96 
 
 
372 aa  309  5.9999999999999995e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1813  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.24 
 
 
362 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1830  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.86 
 
 
358 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.028835  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1539  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.15 
 
 
358 aa  307  2.0000000000000002e-82  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.31269  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2028  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.99 
 
 
373 aa  306  3e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1808  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.92 
 
 
378 aa  306  3e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1762  N-ethylmaleimide reductase  44.04 
 
 
365 aa  306  5.0000000000000004e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000139789  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2565  N-ethylmaleimide reductase  44.04 
 
 
365 aa  306  5.0000000000000004e-82  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111821  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1871  N-ethylmaleimide reductase  44.04 
 
 
365 aa  306  5.0000000000000004e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00554959  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5779  morphinone reductase  45.88 
 
 
364 aa  305  6e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.240978  normal  0.391278 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3077  NADH:flavin oxidoreductase / NADH oxidase family protein  46.26 
 
 
367 aa  305  7e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1796  N-ethylmaleimide reductase  42.27 
 
 
365 aa  305  8.000000000000001e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.287349  normal  0.0323819 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>