More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_2453 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_2453  N-ethylmaleimide reductase, putative  100 
 
 
362 aa  750    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0454  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  48.77 
 
 
378 aa  351  1e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0473  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  48.65 
 
 
378 aa  350  2e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000624  N-ethylmaleimide reductase  47.4 
 
 
374 aa  350  3e-95  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0244  N-ethylmaleimide reductase  48.34 
 
 
367 aa  350  3e-95  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06498  NADH-flavin oxidoreductase  47.11 
 
 
363 aa  348  7e-95  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4063  N-ethylmaleimide reductase, putative  49.45 
 
 
367 aa  342  5e-93  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0593  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  48.5 
 
 
363 aa  342  7e-93  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0507  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.97 
 
 
363 aa  341  1e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0913  N-ethylmaleimide reductase  45.98 
 
 
365 aa  337  9.999999999999999e-92  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000261  N-ethylmaleimide reductase  46.51 
 
 
366 aa  331  1e-89  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4153  N-ethylmaleimide reductase, putative  46.36 
 
 
378 aa  329  4e-89  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1778  N-ethylmaleimide reductase  47.53 
 
 
385 aa  328  8e-89  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05639  N-ethylmaleimide reductase  45.7 
 
 
366 aa  320  1.9999999999999998e-86  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2906  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.17 
 
 
369 aa  320  3e-86  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2819  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  46.17 
 
 
369 aa  320  3e-86  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.726773  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3021  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.81 
 
 
368 aa  318  7.999999999999999e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.347142  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2454  oxidoreductase, FMN-binding  46.24 
 
 
365 aa  318  1e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5363  N-ethylmaleimide reductase  47.66 
 
 
373 aa  314  1.9999999999999998e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.444499  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2099  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.63 
 
 
366 aa  311  1e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.732064  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5643  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  41.44 
 
 
379 aa  309  4e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2486  Oye family NADH-dependent flavin oxidoreductase  40.91 
 
 
374 aa  308  6.999999999999999e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0454136  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2682  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.86 
 
 
372 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0473  NADH:flavin oxidoreductase  45.86 
 
 
368 aa  303  2.0000000000000002e-81  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3337  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.56 
 
 
366 aa  303  2.0000000000000002e-81  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.853929  normal  0.657426 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18430  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase family  41.83 
 
 
379 aa  302  6.000000000000001e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4051  putative oxidoreductase  44.57 
 
 
370 aa  302  7.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1093  NADH-dependent flavin oxidoreductase, NADH oxidase  41.87 
 
 
375 aa  300  3e-80  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0396563 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2028  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.74 
 
 
373 aa  300  4e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2710  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.66 
 
 
366 aa  298  1e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1808  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.99 
 
 
378 aa  298  1e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3143  oxidoreductase  43.24 
 
 
371 aa  297  1e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.683924  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1202  flavoprotein NADH-dependent oxidoreductase  45.74 
 
 
378 aa  296  5e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.655444 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2229  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.33 
 
 
374 aa  295  6e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5219  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.27 
 
 
380 aa  295  6e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3391  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.5 
 
 
367 aa  295  1e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.457574  normal  0.31305 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6908  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.32 
 
 
369 aa  294  2e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4436  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.05 
 
 
369 aa  293  3e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3425  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.32 
 
 
368 aa  293  3e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1258  NADH-flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.9 
 
 
371 aa  293  4e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1871  N-ethylmaleimide reductase  44.63 
 
 
365 aa  292  5e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00554959  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0161  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.56 
 
 
369 aa  293  5e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2565  N-ethylmaleimide reductase  44.63 
 
 
365 aa  292  5e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111821  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1477  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  41.94 
 
 
371 aa  293  5e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1977  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.2 
 
 
373 aa  292  5e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1762  N-ethylmaleimide reductase  44.63 
 
 
365 aa  292  5e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000139789  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4899  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.05 
 
 
369 aa  292  6e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3264  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.05 
 
 
369 aa  292  6e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.126582 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5112  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.72 
 
 
372 aa  290  2e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26130  morphinone reductase  46.46 
 
 
369 aa  290  3e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.243745  normal  0.290118 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4256  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase family protein  43.01 
 
 
368 aa  290  4e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10483  flavoprotein NADH-dependent oxidoreductase  44.01 
 
 
379 aa  290  4e-77  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.614886  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0902  oxidoreductase, FMN-binding  43.09 
 
 
371 aa  289  5.0000000000000004e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1557  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.71 
 
 
373 aa  289  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.267241  hitchhiker  0.000500156 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0845  oxidoreductase, FMN-binding  43.09 
 
 
371 aa  289  5.0000000000000004e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1643  putative NADH-dependent flavin oxidoreductase  44.17 
 
 
387 aa  288  1e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1138  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.75 
 
 
368 aa  287  2e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0230317  normal  0.571173 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1374  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.93 
 
 
366 aa  287  2e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6853  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.24 
 
 
367 aa  287  2e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.401791  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2058  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.03 
 
 
363 aa  287  2e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1907  N-ethylmaleimide reductase  42.82 
 
 
365 aa  286  2.9999999999999996e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3110  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  40.75 
 
 
374 aa  286  2.9999999999999996e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3350  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.23 
 
 
371 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.70851  normal  0.0716807 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1546  N-ethylmaleimide reductase  43.09 
 
 
365 aa  286  2.9999999999999996e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2362  N-ethylmaleimide reductase  43.09 
 
 
365 aa  286  4e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.003891  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1046  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.47 
 
 
368 aa  286  4e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.758573  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1548  N-ethylmaleimide reductase  43.09 
 
 
365 aa  286  4e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.284503  normal  0.889457 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1990  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.09 
 
 
365 aa  285  5.999999999999999e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000017212  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1727  N-ethylmaleimide reductase  43.09 
 
 
365 aa  285  5.999999999999999e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1979  N-ethylmaleimide reductase  43.09 
 
 
365 aa  285  5.999999999999999e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0402402  hitchhiker  0.00127595 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1861  N-ethylmaleimide reductase  43.09 
 
 
365 aa  285  5.999999999999999e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.105495  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01620  N-ethylmaleimide reductase, FMN-linked  43.37 
 
 
365 aa  285  9e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00072509  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01610  hypothetical protein  43.37 
 
 
365 aa  285  9e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00066304  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1606  N-ethylmaleimide reductase  42.82 
 
 
365 aa  285  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1842  N-ethylmaleimide reductase  43.37 
 
 
365 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.234054  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2202  N-ethylmaleimide reductase  43.8 
 
 
365 aa  285  1.0000000000000001e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.209286  hitchhiker  0.0000409278 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2094  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  41.22 
 
 
368 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20830  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase family protein  43.21 
 
 
379 aa  283  2.0000000000000002e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0458981  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3173  N-ethylmaleimide reductase  44.63 
 
 
365 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47000  putative oxidoreductase  42.01 
 
 
370 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.246244  normal  0.208347 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1738  N-ethylmaleimide reductase  42.82 
 
 
365 aa  283  4.0000000000000003e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.105113  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1468  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.98 
 
 
371 aa  283  4.0000000000000003e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5271  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.99 
 
 
360 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1240  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.9 
 
 
373 aa  282  7.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0239  NADH-flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.82 
 
 
371 aa  282  7.000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0759  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.9 
 
 
373 aa  282  7.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.882539  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1796  N-ethylmaleimide reductase  42.15 
 
 
365 aa  282  8.000000000000001e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.287349  normal  0.0323819 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1326  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.09 
 
 
414 aa  282  8.000000000000001e-75  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0306285  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5299  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.09 
 
 
371 aa  281  1e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.246787 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1533  N-ethylmaleimide reductase  42.54 
 
 
365 aa  281  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.111843  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1830  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.68 
 
 
358 aa  281  1e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.028835  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4754  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.09 
 
 
371 aa  281  1e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.750935 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4103  N-ethylmaleimide reductase  43.56 
 
 
369 aa  280  2e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4856  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.41 
 
 
371 aa  280  3e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.166947  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2543  N-ethylmaleimide reductase  44.07 
 
 
365 aa  280  3e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.543152  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5449  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.41 
 
 
371 aa  280  3e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5413  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.41 
 
 
371 aa  280  3e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00342687 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4736  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.92 
 
 
360 aa  280  3e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2152  oxidoreductase, FMN-binding  42.28 
 
 
371 aa  279  5e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1327  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.13 
 
 
364 aa  279  7e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>