More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5823 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008544  Bcen2424_6353  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  90.98 
 
 
370 aa  658    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.217265  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5606  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  97.84 
 
 
370 aa  712    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.614361  normal  0.874995 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1475  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  90.98 
 
 
370 aa  658    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0181393  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7019  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  90.98 
 
 
370 aa  658    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.266435  normal  0.0759654 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5823  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  100 
 
 
370 aa  747    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4953  NADH-flavin oxidoreductase/NADH oxidase  82.93 
 
 
372 aa  633  1e-180  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.880689  normal  0.66243 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5363  N-ethylmaleimide reductase  48.61 
 
 
373 aa  309  5.9999999999999995e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.444499  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5219  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.67 
 
 
380 aa  304  1.0000000000000001e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4760  flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.34 
 
 
365 aa  303  4.0000000000000003e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000142373  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2006  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.69 
 
 
364 aa  300  3e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5123  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.01 
 
 
362 aa  299  5e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2616  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.18 
 
 
365 aa  299  6e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0217  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.85 
 
 
358 aa  298  7e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1202  flavoprotein NADH-dependent oxidoreductase  46.61 
 
 
378 aa  298  1e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.655444 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1865  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase family protein  47.79 
 
 
360 aa  298  1e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06498  NADH-flavin oxidoreductase  43.37 
 
 
363 aa  298  1e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0244  N-ethylmaleimide reductase  43.68 
 
 
367 aa  297  2e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1046  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.49 
 
 
368 aa  297  2e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.758573  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4051  putative oxidoreductase  47.4 
 
 
370 aa  296  3e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26130  morphinone reductase  49.44 
 
 
369 aa  296  3e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.243745  normal  0.290118 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5643  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.89 
 
 
379 aa  294  1e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2277  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.58 
 
 
363 aa  294  2e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.178772 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2058  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.84 
 
 
358 aa  293  2e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.416223  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5271  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.51 
 
 
360 aa  294  2e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1691  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.58 
 
 
365 aa  293  3e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.410088  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1673  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.58 
 
 
365 aa  293  3e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000624  N-ethylmaleimide reductase  43.49 
 
 
374 aa  293  3e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18430  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase family  45.7 
 
 
379 aa  293  3e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1138  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.95 
 
 
368 aa  292  5e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0230317  normal  0.571173 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47000  putative oxidoreductase  46.69 
 
 
370 aa  293  5e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.246244  normal  0.208347 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20830  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase family protein  46.96 
 
 
379 aa  291  1e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0458981  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0508  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.39 
 
 
365 aa  290  2e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0913  N-ethylmaleimide reductase  40.98 
 
 
365 aa  290  3e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0353  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.56 
 
 
366 aa  290  3e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.798317 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1830  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.54 
 
 
358 aa  290  3e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.028835  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1313  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.93 
 
 
352 aa  290  3e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0454  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.96 
 
 
378 aa  290  3e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2058  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.48 
 
 
363 aa  290  4e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10483  flavoprotein NADH-dependent oxidoreductase  44.26 
 
 
379 aa  289  4e-77  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.614886  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1258  NADH-flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.14 
 
 
371 aa  289  4e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6908  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.3 
 
 
369 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05639  N-ethylmaleimide reductase  43.32 
 
 
366 aa  289  6e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1356  N-ethylmaleimide reductase  45.5 
 
 
353 aa  288  7e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2474  N-ethylmaleimide reductase  45.5 
 
 
353 aa  288  7e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.22498  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1283  N-ethylmaleimide reductase  45.5 
 
 
353 aa  288  7e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.105035  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0619  N-ethylmaleimide reductase  45.5 
 
 
353 aa  288  7e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.727216  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0340  N-ethylmaleimide reductase  45.5 
 
 
353 aa  288  7e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0951  N-ethylmaleimide reductase  45.5 
 
 
353 aa  288  7e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1327  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.68 
 
 
364 aa  288  1e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4062  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.25 
 
 
462 aa  288  1e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00355793  normal  0.310254 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0473  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.96 
 
 
378 aa  288  1e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3698  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.66 
 
 
364 aa  288  2e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.014573 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1523  N-ethylmaleimide reductase  45.5 
 
 
353 aa  287  2e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.512635  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4899  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.03 
 
 
369 aa  287  2e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1977  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.04 
 
 
373 aa  287  2e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3264  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.03 
 
 
369 aa  287  2e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.126582 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2486  Oye family NADH-dependent flavin oxidoreductase  44.56 
 
 
374 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0454136  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2028  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.38 
 
 
373 aa  287  2.9999999999999996e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1210  N-ethylmaleimide reductase  45.23 
 
 
353 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4736  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.69 
 
 
360 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0161  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.28 
 
 
369 aa  287  2.9999999999999996e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0951  NADH-flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.05 
 
 
353 aa  286  4e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3683  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.09 
 
 
368 aa  286  5.999999999999999e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3425  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.03 
 
 
368 aa  285  8e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2018  putative N-ethylmaleimide reductase  43.61 
 
 
353 aa  285  8e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.791001  normal  0.023954 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1120  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.75 
 
 
349 aa  285  9e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.395455 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0104  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.01 
 
 
369 aa  285  1.0000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4436  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.03 
 
 
369 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56660  xenobiotic reductase  45.56 
 
 
350 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0113  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.13 
 
 
364 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.15352  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5519  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.23 
 
 
353 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.824672 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3603  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.23 
 
 
353 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.682555  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4764  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.23 
 
 
353 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.211845 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0639  Oye family NADH-dependent flavin oxidoreductase  47.55 
 
 
372 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2565  N-ethylmaleimide reductase  42.82 
 
 
365 aa  283  4.0000000000000003e-75  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111821  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1871  N-ethylmaleimide reductase  42.82 
 
 
365 aa  283  4.0000000000000003e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00554959  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1762  N-ethylmaleimide reductase  42.82 
 
 
365 aa  283  4.0000000000000003e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000139789  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0101  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.73 
 
 
369 aa  282  5.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.70129 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0593  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.99 
 
 
363 aa  282  6.000000000000001e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1907  N-ethylmaleimide reductase  44.38 
 
 
365 aa  282  6.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0473  NADH:flavin oxidoreductase  45.63 
 
 
368 aa  282  6.000000000000001e-75  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0507  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.6 
 
 
363 aa  282  6.000000000000001e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5128  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.98 
 
 
371 aa  282  8.000000000000001e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1738  N-ethylmaleimide reductase  44.38 
 
 
365 aa  282  8.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.105113  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1533  N-ethylmaleimide reductase  44.11 
 
 
365 aa  280  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.111843  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2710  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.51 
 
 
366 aa  280  2e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1546  N-ethylmaleimide reductase  44.38 
 
 
365 aa  281  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1606  N-ethylmaleimide reductase  44.38 
 
 
365 aa  281  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5805  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.82 
 
 
353 aa  280  2e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.452386 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3021  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.65 
 
 
368 aa  280  3e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.347142  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0959  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.03 
 
 
349 aa  280  3e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.224706 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0423  FMN oxidoreductase protein  44.32 
 
 
364 aa  280  3e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3350  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.15 
 
 
371 aa  280  3e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.70851  normal  0.0716807 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0527  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.37 
 
 
364 aa  280  3e-74  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000582324  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0481  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.72 
 
 
369 aa  280  3e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.239535 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2173  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.92 
 
 
363 aa  280  3e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.789599  hitchhiker  0.00631395 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4063  N-ethylmaleimide reductase, putative  43.8 
 
 
367 aa  280  4e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2454  oxidoreductase, FMN-binding  44.02 
 
 
365 aa  280  4e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2005  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.58 
 
 
359 aa  280  4e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.036883  normal  0.0112821 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1368  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  41.26 
 
 
367 aa  279  4e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.523786  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>