More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2005 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009439  Pmen_2005  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  100 
 
 
359 aa  729    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.036883  normal  0.0112821 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0104  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  51.25 
 
 
369 aa  335  5e-91  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0101  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  50.97 
 
 
369 aa  333  3e-90  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.70129 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3683  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  49.72 
 
 
368 aa  332  7.000000000000001e-90  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1830  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  48.61 
 
 
358 aa  331  1e-89  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.028835  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0353  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.54 
 
 
366 aa  323  3e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.798317 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1258  NADH-flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.65 
 
 
371 aa  323  4e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0423  FMN oxidoreductase protein  49.16 
 
 
364 aa  322  6e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3077  NADH:flavin oxidoreductase / NADH oxidase family protein  48.18 
 
 
367 aa  322  7e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3889  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  49.86 
 
 
366 aa  322  8e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.212192  normal  0.106591 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2094  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.8 
 
 
368 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001682  NADH:flavin oxidoreductases Old Yellow Enzyme family  46.93 
 
 
358 aa  320  1.9999999999999998e-86  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0481  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  49.72 
 
 
369 aa  318  1e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.239535 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4736  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  50.28 
 
 
360 aa  318  1e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0475  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  51.4 
 
 
365 aa  317  2e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.261593  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5123  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.5 
 
 
362 aa  315  9e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1539  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  48.18 
 
 
358 aa  315  9e-85  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.31269  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2240  N-ethylmaleimide reductase, FMN-linked  48.21 
 
 
365 aa  314  9.999999999999999e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3087  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.96 
 
 
370 aa  314  9.999999999999999e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.138011 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5271  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  50 
 
 
360 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1327  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.77 
 
 
364 aa  313  3.9999999999999997e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1865  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase family protein  48.88 
 
 
360 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26130  morphinone reductase  48.91 
 
 
369 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.243745  normal  0.290118 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0639  Oye family NADH-dependent flavin oxidoreductase  48.65 
 
 
372 aa  312  4.999999999999999e-84  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0920  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  48.33 
 
 
349 aa  311  7.999999999999999e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000261  N-ethylmaleimide reductase  46.43 
 
 
366 aa  311  1e-83  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2277  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  49.04 
 
 
363 aa  311  1e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.178772 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2934  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.94 
 
 
367 aa  310  2e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.522129  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2058  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  48.32 
 
 
363 aa  310  2.9999999999999997e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4760  flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.65 
 
 
365 aa  309  4e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000142373  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5363  N-ethylmaleimide reductase  49.86 
 
 
373 aa  309  5e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.444499  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0473  NADH:flavin oxidoreductase  48.47 
 
 
368 aa  309  5.9999999999999995e-83  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0959  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  48.06 
 
 
349 aa  309  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.224706 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4468  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  48.88 
 
 
349 aa  308  8e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.101693 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4103  N-ethylmaleimide reductase  47.4 
 
 
369 aa  308  8e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5128  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.83 
 
 
371 aa  308  1.0000000000000001e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0627  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.37 
 
 
369 aa  306  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2173  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.12 
 
 
363 aa  306  3e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.789599  hitchhiker  0.00631395 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3698  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  48.25 
 
 
364 aa  306  3e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.014573 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1374  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.16 
 
 
366 aa  306  5.0000000000000004e-82  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2243  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  48.14 
 
 
354 aa  305  7e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3133  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.98 
 
 
375 aa  305  7e-82  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.656366  normal  0.303319 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1313  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.63 
 
 
352 aa  305  9.000000000000001e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3689  GTN reductase  47.09 
 
 
360 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1368  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.96 
 
 
367 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.523786  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4062  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.24 
 
 
462 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00355793  normal  0.310254 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1721  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.47 
 
 
363 aa  303  3.0000000000000004e-81  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2479  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  48.49 
 
 
366 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0759  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  49.17 
 
 
373 aa  301  9e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.882539  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1240  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  49.17 
 
 
373 aa  301  9e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5112  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.98 
 
 
372 aa  301  1e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0503  NADH-flavin oxidoreductase/NADH oxidase  49.3 
 
 
373 aa  301  1e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0986  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.65 
 
 
349 aa  301  1e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000257245 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05639  N-ethylmaleimide reductase  45.05 
 
 
366 aa  301  2e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0951  NADH-flavin oxidoreductase/NADH oxidase  48.31 
 
 
353 aa  300  2e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2454  oxidoreductase, FMN-binding  46.15 
 
 
365 aa  300  3e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4064  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  49.3 
 
 
376 aa  300  3e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4210  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.05 
 
 
372 aa  300  3e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5519  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  48.17 
 
 
353 aa  299  4e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.824672 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01614  xenobiotic reductase B  45.53 
 
 
373 aa  299  4e-80  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3603  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  48.17 
 
 
353 aa  299  4e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.682555  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4764  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  48.17 
 
 
353 aa  299  4e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.211845 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4150  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  48.6 
 
 
353 aa  299  5e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1415  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.96 
 
 
375 aa  299  6e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.193692  hitchhiker  0.0000159573 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5285  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.67 
 
 
370 aa  298  7e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0217  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.23 
 
 
358 aa  298  8e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0113  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.97 
 
 
364 aa  298  8e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.15352  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4888  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.88 
 
 
366 aa  298  8e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1643  putative NADH-dependent flavin oxidoreductase  47.3 
 
 
387 aa  298  8e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4675  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  48.31 
 
 
353 aa  298  9e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.650243 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2006  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.61 
 
 
364 aa  298  1e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4767  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.97 
 
 
371 aa  297  2e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.323845  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56660  xenobiotic reductase  47.63 
 
 
350 aa  296  3e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4063  N-ethylmaleimide reductase, putative  45.86 
 
 
367 aa  296  4e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2018  putative N-ethylmaleimide reductase  46.63 
 
 
353 aa  296  5e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.791001  normal  0.023954 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5805  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.92 
 
 
353 aa  295  6e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.452386 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4053  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.13 
 
 
349 aa  295  9e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.477429  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4358  oxidoreductase, FAD/FMN-binding protein  44.85 
 
 
349 aa  295  1e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1242  NADH-flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.15 
 
 
371 aa  294  1e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.102798  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3892  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.75 
 
 
353 aa  295  1e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1172  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.13 
 
 
359 aa  295  1e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.210538 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5779  morphinone reductase  47.65 
 
 
364 aa  293  2e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.240978  normal  0.391278 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6347  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.54 
 
 
363 aa  294  2e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1282  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.86 
 
 
349 aa  293  3e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2710  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.48 
 
 
366 aa  293  3e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0239  NADH-flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.38 
 
 
371 aa  293  3e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0340  N-ethylmaleimide reductase  47.47 
 
 
353 aa  293  4e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1356  N-ethylmaleimide reductase  47.47 
 
 
353 aa  293  4e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2474  N-ethylmaleimide reductase  47.47 
 
 
353 aa  293  4e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.22498  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1283  N-ethylmaleimide reductase  47.47 
 
 
353 aa  293  4e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.105035  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0619  N-ethylmaleimide reductase  47.47 
 
 
353 aa  293  4e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.727216  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4927  xenobiotic reductase  47.08 
 
 
350 aa  293  4e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0951  N-ethylmaleimide reductase  47.47 
 
 
353 aa  293  4e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1523  N-ethylmaleimide reductase  46.54 
 
 
353 aa  292  5e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.512635  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2152  oxidoreductase, FMN-binding  47.66 
 
 
371 aa  292  6e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0593  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.63 
 
 
363 aa  292  8e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01763  GTN Reductase  46.8 
 
 
372 aa  291  9e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.553032  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5133  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  48.47 
 
 
374 aa  291  1e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.249326  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1673  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.91 
 
 
365 aa  291  1e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1691  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.91 
 
 
365 aa  291  1e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.410088  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>