More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_6353 on replicon NC_008544
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010557  BamMC406_5606  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  90.98 
 
 
370 aa  655    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.614361  normal  0.874995 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7019  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  98.92 
 
 
370 aa  736    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.266435  normal  0.0759654 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6353  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  100 
 
 
370 aa  744    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.217265  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1475  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  100 
 
 
370 aa  744    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0181393  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5823  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  90.98 
 
 
370 aa  659    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4953  NADH-flavin oxidoreductase/NADH oxidase  83.84 
 
 
372 aa  633  1e-180  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.880689  normal  0.66243 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4760  flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.24 
 
 
365 aa  305  6e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000142373  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1202  flavoprotein NADH-dependent oxidoreductase  47.79 
 
 
378 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.655444 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1258  NADH-flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.83 
 
 
371 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1046  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.11 
 
 
368 aa  301  2e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.758573  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1138  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.83 
 
 
368 aa  300  3e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0230317  normal  0.571173 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1865  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase family protein  46.96 
 
 
360 aa  296  3e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5219  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.55 
 
 
380 aa  295  6e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5123  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.18 
 
 
362 aa  295  1e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5363  N-ethylmaleimide reductase  46.39 
 
 
373 aa  294  2e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.444499  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2058  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.03 
 
 
363 aa  293  3e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0217  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.01 
 
 
358 aa  293  3e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5271  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.79 
 
 
360 aa  292  7e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26130  morphinone reductase  49.17 
 
 
369 aa  291  1e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.243745  normal  0.290118 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2006  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.69 
 
 
364 aa  290  2e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2616  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.66 
 
 
365 aa  290  2e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4736  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.51 
 
 
360 aa  288  7e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4062  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.32 
 
 
462 aa  288  1e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00355793  normal  0.310254 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0639  Oye family NADH-dependent flavin oxidoreductase  47.55 
 
 
372 aa  286  4e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0244  N-ethylmaleimide reductase  42.58 
 
 
367 aa  286  5e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1691  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.05 
 
 
365 aa  286  5e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.410088  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1673  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.05 
 
 
365 aa  285  5.999999999999999e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0161  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.01 
 
 
369 aa  286  5.999999999999999e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06498  NADH-flavin oxidoreductase  41.71 
 
 
363 aa  285  8e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2058  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.94 
 
 
358 aa  285  9e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.416223  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0353  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.62 
 
 
366 aa  285  9e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.798317 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0423  FMN oxidoreductase protein  45.15 
 
 
364 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05639  N-ethylmaleimide reductase  43.01 
 
 
366 aa  285  1.0000000000000001e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0527  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.65 
 
 
364 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000582324  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2173  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.6 
 
 
363 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.789599  hitchhiker  0.00631395 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2277  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.48 
 
 
363 aa  284  2.0000000000000002e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.178772 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000624  N-ethylmaleimide reductase  41.83 
 
 
374 aa  283  3.0000000000000004e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1327  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.86 
 
 
364 aa  283  4.0000000000000003e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0913  N-ethylmaleimide reductase  40.76 
 
 
365 aa  282  6.000000000000001e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1738  N-ethylmaleimide reductase  44.38 
 
 
365 aa  282  7.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.105113  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1907  N-ethylmaleimide reductase  44.38 
 
 
365 aa  282  8.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1546  N-ethylmaleimide reductase  44.38 
 
 
365 aa  281  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1830  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.43 
 
 
358 aa  281  1e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.028835  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1977  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.24 
 
 
373 aa  281  1e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0454  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.6 
 
 
378 aa  280  2e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4210  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.32 
 
 
372 aa  281  2e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1606  N-ethylmaleimide reductase  44.38 
 
 
365 aa  280  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1533  N-ethylmaleimide reductase  44.11 
 
 
365 aa  281  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.111843  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1871  N-ethylmaleimide reductase  42.82 
 
 
365 aa  280  3e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00554959  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4051  putative oxidoreductase  45.48 
 
 
370 aa  280  3e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1762  N-ethylmaleimide reductase  42.82 
 
 
365 aa  280  3e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000139789  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2565  N-ethylmaleimide reductase  42.82 
 
 
365 aa  280  3e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111821  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3021  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.92 
 
 
368 aa  280  3e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.347142  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20830  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase family protein  45.58 
 
 
379 aa  280  4e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0458981  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10483  flavoprotein NADH-dependent oxidoreductase  42.47 
 
 
379 aa  280  4e-74  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.614886  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6908  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.93 
 
 
369 aa  279  5e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2018  putative N-ethylmaleimide reductase  41.94 
 
 
353 aa  279  5e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.791001  normal  0.023954 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4063  N-ethylmaleimide reductase, putative  43.8 
 
 
367 aa  279  7e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0473  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.87 
 
 
378 aa  278  7e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3683  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.55 
 
 
368 aa  278  9e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2028  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.41 
 
 
373 aa  278  1e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1157  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.56 
 
 
362 aa  278  1e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.10298  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1796  N-ethylmaleimide reductase  43.37 
 
 
365 aa  277  2e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.287349  normal  0.0323819 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1808  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.13 
 
 
378 aa  277  2e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3337  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.53 
 
 
366 aa  277  2e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.853929  normal  0.657426 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4899  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.66 
 
 
369 aa  277  2e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3264  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.66 
 
 
369 aa  277  2e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.126582 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2479  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.26 
 
 
366 aa  277  3e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0473  NADH:flavin oxidoreductase  44.32 
 
 
368 aa  276  3e-73  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0508  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.03 
 
 
365 aa  276  3e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0593  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.62 
 
 
363 aa  276  3e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3289  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.99 
 
 
362 aa  276  4e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00196526  normal  0.178357 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5643  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.2 
 
 
379 aa  276  4e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000261  N-ethylmaleimide reductase  41.92 
 
 
366 aa  276  4e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1368  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  40.71 
 
 
367 aa  276  4e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.523786  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4436  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.27 
 
 
369 aa  276  4e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47000  putative oxidoreductase  44.75 
 
 
370 aa  276  4e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.246244  normal  0.208347 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001682  NADH:flavin oxidoreductases Old Yellow Enzyme family  44.01 
 
 
358 aa  275  6e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2805  putative NADH-flavin oxidoreductase  47.29 
 
 
362 aa  276  6e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1120  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.09 
 
 
349 aa  276  6e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.395455 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2240  N-ethylmaleimide reductase, FMN-linked  42.43 
 
 
365 aa  275  9e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2454  oxidoreductase, FMN-binding  42.9 
 
 
365 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1356  N-ethylmaleimide reductase  43.61 
 
 
353 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2474  N-ethylmaleimide reductase  43.61 
 
 
353 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.22498  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5805  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  40.97 
 
 
353 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.452386 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1283  N-ethylmaleimide reductase  43.61 
 
 
353 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.105035  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0951  N-ethylmaleimide reductase  43.61 
 
 
353 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3425  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.66 
 
 
368 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0619  N-ethylmaleimide reductase  43.61 
 
 
353 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.727216  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2202  N-ethylmaleimide reductase  42.31 
 
 
365 aa  275  1.0000000000000001e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.209286  hitchhiker  0.0000409278 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0104  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.62 
 
 
369 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0340  N-ethylmaleimide reductase  43.61 
 
 
353 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2094  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.23 
 
 
368 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5128  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.32 
 
 
371 aa  275  1.0000000000000001e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2005  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.88 
 
 
359 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.036883  normal  0.0112821 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1494  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.29 
 
 
362 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0995744  normal  0.674714 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0239  NADH-flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.74 
 
 
371 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0113  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.03 
 
 
364 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.15352  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3350  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.71 
 
 
371 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.70851  normal  0.0716807 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3698  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.47 
 
 
364 aa  273  3e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.014573 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>