More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_2070 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008345  Sfri_2070  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  100 
 
 
374 aa  769    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3822  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  61.68 
 
 
370 aa  483  1e-135  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.271539  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1011  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  62.3 
 
 
367 aa  464  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53400  oxidoreductase  61.96 
 
 
370 aa  463  1e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0497722 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1173  oxidoreductase, FAD/FMN-binding protein  62.71 
 
 
367 aa  458  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4680  oxidoreductase  61.41 
 
 
370 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0884  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  60.82 
 
 
367 aa  457  1e-127  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.393971  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0972  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  61.14 
 
 
369 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.277341 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1928  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  58.36 
 
 
367 aa  442  1e-123  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4412  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  58.04 
 
 
367 aa  437  1e-121  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.590199  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02130  NADH-dependent flavin oxidoreductase, Oye family protein  59.23 
 
 
365 aa  431  1e-120  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.361518  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3097  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  58.58 
 
 
367 aa  430  1e-119  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.432151  normal  0.23226 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1135  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  57.49 
 
 
366 aa  416  9.999999999999999e-116  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0661889 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3385  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  55.59 
 
 
368 aa  412  1e-114  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.334271  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1461  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  54.5 
 
 
366 aa  404  1e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.548376 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2294  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  52.29 
 
 
370 aa  397  1e-109  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2959  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  54.82 
 
 
374 aa  393  1e-108  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0436384  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3000  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  52.52 
 
 
378 aa  394  1e-108  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0783017  normal  0.378795 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3391  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  56.45 
 
 
363 aa  389  1e-107  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.161917 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2007  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  53.57 
 
 
372 aa  375  1e-103  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.582883  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2194  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  52.55 
 
 
370 aa  373  1e-102  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2707  putative oxidoreductase  53.58 
 
 
372 aa  373  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.151955  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3439  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  51.1 
 
 
366 aa  371  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0406349  normal  0.0698654 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1951  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  53.24 
 
 
367 aa  371  1e-101  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.67535  normal  0.0297494 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1190  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  51.08 
 
 
368 aa  368  1e-100  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.162966  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1572  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  51.91 
 
 
363 aa  365  1e-100  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.37113  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1268  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  54.39 
 
 
371 aa  341  9e-93  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0160368 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4277  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.21 
 
 
385 aa  337  1.9999999999999998e-91  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.91364  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5385  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  50.14 
 
 
363 aa  328  7e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5296  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  50.14 
 
 
363 aa  328  7e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.339898  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5675  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  50.14 
 
 
363 aa  328  8e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6910  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.06 
 
 
358 aa  310  2e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0291  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.83 
 
 
380 aa  302  7.000000000000001e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3323  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.74 
 
 
384 aa  276  4e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.105187  hitchhiker  0.000875801 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1561  NADH-dependent flavin oxidoreductase, Oye family  36.26 
 
 
375 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.342223 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3680  NADH-dependent flavin oxidoreductase, Oye family  36.26 
 
 
375 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.204517  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1521  putative NADH-dependent flavin oxidoreductase  33.05 
 
 
363 aa  197  2.0000000000000003e-49  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0991622 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3333  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  35.46 
 
 
375 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.736898  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3657  NADH-dependent flavin oxidoreductase, Oye family  36.36 
 
 
375 aa  196  6e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3437  Oye family NADH-dependent flavin oxidoreductase  36.09 
 
 
375 aa  194  2e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.283437  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3398  Oye family NADH-dependent flavin oxidoreductase  36.09 
 
 
375 aa  194  2e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3755  NADH-dependent flavin oxidoreductase, Oye family  34.44 
 
 
375 aa  194  2e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3707  Oye family NADH-dependent flavin oxidoreductase  36.09 
 
 
375 aa  194  2e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.488381  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3349  Oye family NADH-dependent flavin oxidoreductase  35.77 
 
 
375 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3675  Oye family NADH-dependent flavin oxidoreductase  35.44 
 
 
375 aa  188  1e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2986  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.97 
 
 
374 aa  182  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0351108 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2725  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.04 
 
 
374 aa  179  9e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.245117  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0063  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.53 
 
 
366 aa  178  2e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3087  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  33.97 
 
 
370 aa  177  3e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.138011 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0037  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  33.97 
 
 
372 aa  177  3e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3392  oxidoreductase, FMN-binding  31.79 
 
 
355 aa  177  3e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0473  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.09 
 
 
378 aa  176  5e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26130  morphinone reductase  43.46 
 
 
369 aa  176  7e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.243745  normal  0.290118 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0454  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.58 
 
 
378 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0902  oxidoreductase, FMN-binding  44.64 
 
 
371 aa  174  1.9999999999999998e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0845  oxidoreductase, FMN-binding  44.64 
 
 
371 aa  174  1.9999999999999998e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1519  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  35.43 
 
 
369 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3683  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.41 
 
 
368 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1468  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.5 
 
 
371 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000624  N-ethylmaleimide reductase  34.71 
 
 
374 aa  173  3.9999999999999995e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4063  N-ethylmaleimide reductase, putative  43.48 
 
 
367 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2934  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  34.04 
 
 
367 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.522129  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0104  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.05 
 
 
369 aa  172  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0031  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.1 
 
 
371 aa  171  2e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.371979 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2453  N-ethylmaleimide reductase, putative  44.39 
 
 
362 aa  171  2e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0240  Oye family NADH-dependent flavin oxidoreductase  32.57 
 
 
347 aa  171  2e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1245  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  41.26 
 
 
373 aa  170  3e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.939474  normal  0.298722 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2173  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.48 
 
 
363 aa  170  3e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.789599  hitchhiker  0.00631395 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2058  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.56 
 
 
363 aa  171  3e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0404  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  41.85 
 
 
373 aa  170  4e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0039  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.36 
 
 
367 aa  169  5e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0101  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.6 
 
 
369 aa  169  5e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.70129 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3698  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.1 
 
 
364 aa  170  5e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.014573 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4103  N-ethylmaleimide reductase  42.04 
 
 
369 aa  170  5e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1229  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  32.11 
 
 
355 aa  170  5e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1159  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  32.11 
 
 
355 aa  169  6e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1158  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  32.11 
 
 
355 aa  169  6e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.704558  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0217  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  30.52 
 
 
358 aa  169  7e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3061  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.35 
 
 
355 aa  169  7e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000791225 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1249  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.43 
 
 
355 aa  169  9e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2720  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  30.47 
 
 
355 aa  168  1e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.100198  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1327  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.35 
 
 
355 aa  168  1e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0135519 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2779  hypothetical protein  32.51 
 
 
351 aa  168  1e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1110  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  30.91 
 
 
366 aa  168  1e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1293  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  32.27 
 
 
355 aa  168  1e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2240  N-ethylmaleimide reductase, FMN-linked  33.86 
 
 
365 aa  168  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0507  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  34.77 
 
 
363 aa  167  2e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0244  N-ethylmaleimide reductase  44.59 
 
 
367 aa  168  2e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1327  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  41.23 
 
 
364 aa  167  2.9999999999999998e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3337  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  28.69 
 
 
355 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3077  NADH:flavin oxidoreductase / NADH oxidase family protein  34.14 
 
 
367 aa  167  4e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6294  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.62 
 
 
373 aa  166  4e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.181632 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0423  FMN oxidoreductase protein  33.89 
 
 
364 aa  166  5e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4055  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  29.87 
 
 
350 aa  166  6.9999999999999995e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1253  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.04 
 
 
366 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0473  NADH:flavin oxidoreductase  33.42 
 
 
368 aa  165  9e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05639  N-ethylmaleimide reductase  40.15 
 
 
366 aa  165  1.0000000000000001e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1093  NADH-dependent flavin oxidoreductase, NADH oxidase  40.3 
 
 
375 aa  165  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0396563 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1368  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  40.97 
 
 
367 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.523786  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2616  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.34 
 
 
365 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>