More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4277 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_4277  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  100 
 
 
385 aa  758    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.91364  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2959  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  60.42 
 
 
374 aa  414  1e-114  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0436384  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1928  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  52.97 
 
 
367 aa  384  1e-105  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0972  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  54.59 
 
 
369 aa  372  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.277341 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02130  NADH-dependent flavin oxidoreductase, Oye family protein  52.02 
 
 
365 aa  370  1e-101  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.361518  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0884  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  52.97 
 
 
367 aa  363  2e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.393971  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4412  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  55.01 
 
 
367 aa  363  2e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.590199  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1011  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  53.1 
 
 
367 aa  362  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1173  oxidoreductase, FAD/FMN-binding protein  53.1 
 
 
367 aa  362  6e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1268  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  57.95 
 
 
371 aa  357  9.999999999999999e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0160368 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3822  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  50.54 
 
 
370 aa  357  1.9999999999999998e-97  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.271539  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3097  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  52.14 
 
 
367 aa  357  2.9999999999999997e-97  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.432151  normal  0.23226 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1135  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  51.6 
 
 
366 aa  354  2e-96  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0661889 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1951  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  50.67 
 
 
367 aa  347  2e-94  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.67535  normal  0.0297494 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53400  oxidoreductase  52.15 
 
 
370 aa  347  3e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0497722 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4680  oxidoreductase  52.15 
 
 
370 aa  346  5e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2070  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.21 
 
 
374 aa  345  5e-94  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3391  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  52.96 
 
 
363 aa  341  2e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.161917 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2007  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  52.33 
 
 
372 aa  339  5e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.582883  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1572  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  53.15 
 
 
363 aa  332  6e-90  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.37113  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2294  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  48.28 
 
 
370 aa  331  1e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2194  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  50.79 
 
 
370 aa  329  5.0000000000000004e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2707  putative oxidoreductase  49.33 
 
 
372 aa  328  8e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.151955  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5385  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  53.15 
 
 
363 aa  327  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5296  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  53.15 
 
 
363 aa  327  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.339898  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3439  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  48.12 
 
 
366 aa  327  2.0000000000000001e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0406349  normal  0.0698654 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5675  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  53.15 
 
 
363 aa  326  4.0000000000000003e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1461  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  49.06 
 
 
366 aa  325  7e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.548376 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3385  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.28 
 
 
368 aa  320  1.9999999999999998e-86  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.334271  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3000  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  49.23 
 
 
378 aa  318  1e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0783017  normal  0.378795 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1190  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  50.53 
 
 
368 aa  313  4.999999999999999e-84  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.162966  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6910  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.85 
 
 
358 aa  290  3e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0291  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.98 
 
 
380 aa  278  8e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3323  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.51 
 
 
384 aa  277  2e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.105187  hitchhiker  0.000875801 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1521  putative NADH-dependent flavin oxidoreductase  33.7 
 
 
363 aa  200  3.9999999999999996e-50  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0991622 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1253  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  36.81 
 
 
366 aa  187  2e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1110  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  36.81 
 
 
366 aa  186  6e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3367  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  36.24 
 
 
369 aa  183  4.0000000000000006e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3333  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  33.6 
 
 
375 aa  181  1e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.736898  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1289  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  34.76 
 
 
377 aa  181  2.9999999999999997e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.306648  normal  0.411333 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3675  Oye family NADH-dependent flavin oxidoreductase  33.88 
 
 
375 aa  179  1e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1561  NADH-dependent flavin oxidoreductase, Oye family  33.33 
 
 
375 aa  177  4e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.342223 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3680  NADH-dependent flavin oxidoreductase, Oye family  33.6 
 
 
375 aa  176  5e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.204517  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3755  NADH-dependent flavin oxidoreductase, Oye family  33.06 
 
 
375 aa  176  9e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3349  Oye family NADH-dependent flavin oxidoreductase  32.79 
 
 
375 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2937  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  35.75 
 
 
365 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3657  NADH-dependent flavin oxidoreductase, Oye family  33.06 
 
 
375 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3398  Oye family NADH-dependent flavin oxidoreductase  32.79 
 
 
375 aa  172  9e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3080  NADH:flavin oxidoreductase / NADH oxidase family  34.75 
 
 
365 aa  172  1e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3437  Oye family NADH-dependent flavin oxidoreductase  32.79 
 
 
375 aa  172  1e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.283437  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3707  Oye family NADH-dependent flavin oxidoreductase  32.79 
 
 
375 aa  172  1e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.488381  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3889  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  36.93 
 
 
366 aa  172  1e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.212192  normal  0.106591 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0845  oxidoreductase, FMN-binding  37.47 
 
 
371 aa  171  2e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0902  oxidoreductase, FMN-binding  37.47 
 
 
371 aa  171  2e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6294  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  33.61 
 
 
373 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.181632 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1468  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.33 
 
 
371 aa  166  5.9999999999999996e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2094  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  34.78 
 
 
368 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1258  NADH-flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.3 
 
 
371 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2700  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  34.66 
 
 
390 aa  162  1e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.484664  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2243  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  36.71 
 
 
354 aa  161  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2934  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  34.51 
 
 
367 aa  160  4e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.522129  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3698  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  33.33 
 
 
364 aa  160  5e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.014573 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0039  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  35.48 
 
 
367 aa  159  5e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3021  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.58 
 
 
368 aa  159  7e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.347142  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0593  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  34.87 
 
 
363 aa  159  1e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4063  N-ethylmaleimide reductase, putative  33.94 
 
 
367 aa  159  1e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3645  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  33.42 
 
 
377 aa  157  2e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.168223  normal  0.516752 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0146  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  30.91 
 
 
654 aa  157  2e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1245  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44 
 
 
373 aa  157  3e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.939474  normal  0.298722 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5133  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  40.84 
 
 
374 aa  157  3e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.249326  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3077  NADH:flavin oxidoreductase / NADH oxidase family protein  33.96 
 
 
367 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3337  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  30.94 
 
 
355 aa  155  9e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4103  N-ethylmaleimide reductase  33.42 
 
 
369 aa  155  9e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3392  oxidoreductase, FMN-binding  33.42 
 
 
355 aa  155  1e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2193  NADH oxidase  31.82 
 
 
637 aa  155  1e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2424  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47 
 
 
371 aa  154  2.9999999999999998e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.397481  normal  0.0764227 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0868  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  29.59 
 
 
335 aa  153  4e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.730901  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0475  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.44 
 
 
365 aa  153  4e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.261593  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05639  N-ethylmaleimide reductase  30.91 
 
 
366 aa  153  5e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2175  NADH oxidase  32.33 
 
 
685 aa  152  7e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0771  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.84 
 
 
330 aa  152  7e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0157719 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1778  N-ethylmaleimide reductase  33.25 
 
 
385 aa  152  8e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2805  putative NADH-flavin oxidoreductase  41.64 
 
 
362 aa  152  8e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0759  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.18 
 
 
373 aa  152  8e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.882539  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1240  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.18 
 
 
373 aa  152  8e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3616  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.71 
 
 
711 aa  152  8.999999999999999e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.667421  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000624  N-ethylmaleimide reductase  41.23 
 
 
374 aa  152  1e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4760  flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.24 
 
 
365 aa  151  2e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000142373  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0507  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  34.02 
 
 
363 aa  151  2e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1327  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.69 
 
 
364 aa  151  2e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0968  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  32.39 
 
 
644 aa  151  2e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.132179  normal  0.162387 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1494  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  41.64 
 
 
362 aa  151  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0995744  normal  0.674714 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3337  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  35.42 
 
 
366 aa  151  2e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.853929  normal  0.657426 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1293  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  33.76 
 
 
355 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2720  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  34.1 
 
 
355 aa  151  2e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.100198  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0473  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  33.5 
 
 
378 aa  151  2e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0244  N-ethylmaleimide reductase  41.99 
 
 
367 aa  150  3e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0503  NADH-flavin oxidoreductase/NADH oxidase  36.09 
 
 
373 aa  150  3e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0217  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.58 
 
 
358 aa  150  3e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1229  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  32.88 
 
 
355 aa  150  3e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>