More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2707 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_2707  putative oxidoreductase  100 
 
 
372 aa  755    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.151955  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1190  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  75.2 
 
 
368 aa  552  1e-156  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.162966  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2294  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  70.19 
 
 
370 aa  535  1e-151  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3000  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  68.92 
 
 
378 aa  520  1e-146  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0783017  normal  0.378795 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2194  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  69.97 
 
 
370 aa  515  1.0000000000000001e-145  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3385  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  61.35 
 
 
368 aa  453  1.0000000000000001e-126  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.334271  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3439  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  59.25 
 
 
366 aa  444  1e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0406349  normal  0.0698654 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3391  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  61.26 
 
 
363 aa  431  1e-120  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.161917 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1461  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  57.84 
 
 
366 aa  427  1e-118  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.548376 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1928  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  58.08 
 
 
367 aa  422  1e-117  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3822  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  55.65 
 
 
370 aa  414  1e-114  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.271539  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1135  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  56.25 
 
 
366 aa  400  9.999999999999999e-111  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0661889 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3097  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  56.32 
 
 
367 aa  398  1e-109  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.432151  normal  0.23226 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02130  NADH-dependent flavin oxidoreductase, Oye family protein  55.41 
 
 
365 aa  389  1e-107  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.361518  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1173  oxidoreductase, FAD/FMN-binding protein  55.5 
 
 
367 aa  390  1e-107  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2070  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  53.58 
 
 
374 aa  390  1e-107  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4412  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  54.84 
 
 
367 aa  378  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.590199  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1011  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  54.42 
 
 
367 aa  381  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2959  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  56.11 
 
 
374 aa  379  1e-104  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0436384  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0884  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  54.16 
 
 
367 aa  381  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.393971  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0972  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  55.56 
 
 
369 aa  377  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.277341 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53400  oxidoreductase  55.11 
 
 
370 aa  373  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0497722 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4680  oxidoreductase  54.84 
 
 
370 aa  370  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2007  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  52.2 
 
 
372 aa  358  8e-98  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.582883  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1572  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  49.86 
 
 
363 aa  344  1e-93  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.37113  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1951  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  50.68 
 
 
367 aa  340  2.9999999999999998e-92  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.67535  normal  0.0297494 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4277  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  49.33 
 
 
385 aa  329  5.0000000000000004e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.91364  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5385  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  48.04 
 
 
363 aa  318  1e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5296  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  48.04 
 
 
363 aa  318  1e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.339898  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5675  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  48.04 
 
 
363 aa  317  2e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1268  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  50.82 
 
 
371 aa  317  3e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0160368 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3323  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.28 
 
 
384 aa  283  4.0000000000000003e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.105187  hitchhiker  0.000875801 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0291  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.9 
 
 
380 aa  276  4e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6910  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  41.46 
 
 
358 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1521  putative NADH-dependent flavin oxidoreductase  32.88 
 
 
363 aa  193  5e-48  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0991622 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3333  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  34.38 
 
 
375 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.736898  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1561  NADH-dependent flavin oxidoreductase, Oye family  34.39 
 
 
375 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.342223 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3755  NADH-dependent flavin oxidoreductase, Oye family  34.11 
 
 
375 aa  179  7e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3675  Oye family NADH-dependent flavin oxidoreductase  34.64 
 
 
375 aa  178  1e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3657  NADH-dependent flavin oxidoreductase, Oye family  34.57 
 
 
375 aa  177  3e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3349  Oye family NADH-dependent flavin oxidoreductase  33.86 
 
 
375 aa  177  4e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3680  NADH-dependent flavin oxidoreductase, Oye family  33.33 
 
 
375 aa  176  5e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.204517  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3437  Oye family NADH-dependent flavin oxidoreductase  34.31 
 
 
375 aa  175  9e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.283437  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3398  Oye family NADH-dependent flavin oxidoreductase  34.31 
 
 
375 aa  175  9e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3707  Oye family NADH-dependent flavin oxidoreductase  34.31 
 
 
375 aa  175  9e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.488381  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3392  oxidoreductase, FMN-binding  34.47 
 
 
355 aa  170  4e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0868  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  33.71 
 
 
335 aa  166  4e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.730901  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4055  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  33.42 
 
 
350 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0240  Oye family NADH-dependent flavin oxidoreductase  34.39 
 
 
347 aa  166  8e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1229  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  35.12 
 
 
355 aa  166  8e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1158  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  35.14 
 
 
355 aa  164  3e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.704558  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1159  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  35.79 
 
 
355 aa  163  6e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0870  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  32.16 
 
 
340 aa  162  1e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0902  oxidoreductase, FMN-binding  42.73 
 
 
371 aa  161  2e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0845  oxidoreductase, FMN-binding  42.73 
 
 
371 aa  161  2e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3080  NADH:flavin oxidoreductase / NADH oxidase family  36.01 
 
 
365 aa  161  2e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3698  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  33.97 
 
 
364 aa  160  3e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.014573 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1293  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  34.64 
 
 
355 aa  160  3e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5123  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.75 
 
 
362 aa  160  3e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1468  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.17 
 
 
371 aa  160  3e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3061  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  34.64 
 
 
355 aa  160  4e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000791225 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1249  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  34.64 
 
 
355 aa  160  5e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2720  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  35.38 
 
 
355 aa  159  7e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.100198  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2175  NADH oxidase  32.88 
 
 
685 aa  159  7e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1157  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  39.79 
 
 
362 aa  159  7e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.10298  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1327  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  34.64 
 
 
355 aa  158  1e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0135519 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4103  N-ethylmaleimide reductase  43.48 
 
 
369 aa  158  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26130  morphinone reductase  39.19 
 
 
369 aa  158  1e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.243745  normal  0.290118 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4063  N-ethylmaleimide reductase, putative  33.59 
 
 
367 aa  157  2e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1242  NADH-flavin oxidoreductase/NADH oxidase  32.11 
 
 
371 aa  157  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.102798  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3683  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.41 
 
 
368 aa  157  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2805  putative NADH-flavin oxidoreductase  40.29 
 
 
362 aa  157  4e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1245  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  41.15 
 
 
373 aa  155  8e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.939474  normal  0.298722 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1494  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  40.29 
 
 
362 aa  155  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0995744  normal  0.674714 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2193  NADH oxidase  32.24 
 
 
637 aa  155  1e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0104  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.33 
 
 
369 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1230  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  34.84 
 
 
347 aa  155  1e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2058  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.05 
 
 
358 aa  154  2e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.416223  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1089  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  35.08 
 
 
347 aa  154  2e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2094  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  40.49 
 
 
368 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2986  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  38.84 
 
 
374 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0351108 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3077  NADH:flavin oxidoreductase / NADH oxidase family protein  32.35 
 
 
367 aa  153  4e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0473  NADH:flavin oxidoreductase  41.1 
 
 
368 aa  153  4e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0101  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  41.86 
 
 
369 aa  153  5e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.70129 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0754  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  33.61 
 
 
685 aa  153  5e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0264452  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3098  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.83 
 
 
346 aa  153  5.9999999999999996e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.450355  normal  0.838165 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56660  xenobiotic reductase  35.1 
 
 
350 aa  152  7e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0415  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  32.96 
 
 
556 aa  152  7e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.291611  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1374  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.94 
 
 
366 aa  152  7e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3644  putative NADH-dependent flavin oxidoreductase  35.25 
 
 
350 aa  152  8e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.055572 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2453  N-ethylmaleimide reductase, putative  36.16 
 
 
362 aa  152  8.999999999999999e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0537  2,4-dienoyl-CoA reductase (NADPH)  33.79 
 
 
684 aa  151  1e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.45506  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2243  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  32.28 
 
 
354 aa  152  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2479  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.25 
 
 
366 aa  152  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4953  NADH-flavin oxidoreductase/NADH oxidase  34.5 
 
 
372 aa  151  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.880689  normal  0.66243 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4927  xenobiotic reductase  44.19 
 
 
350 aa  152  1e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2082  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  34.6 
 
 
358 aa  152  1e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0920  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.26 
 
 
349 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0475  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.32 
 
 
365 aa  151  2e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.261593  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5133  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  40.43 
 
 
374 aa  151  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.249326  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>