More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3644 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009831  Ssed_3644  putative NADH-dependent flavin oxidoreductase  100 
 
 
350 aa  717    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.055572 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4055  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  85.71 
 
 
350 aa  635    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3098  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  76.29 
 
 
346 aa  551  1e-156  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.450355  normal  0.838165 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1397  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  76.07 
 
 
351 aa  549  1e-155  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.3301  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3392  oxidoreductase, FMN-binding  76.72 
 
 
355 aa  548  1e-155  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2720  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  76.72 
 
 
355 aa  548  1e-155  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.100198  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1158  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  76.37 
 
 
355 aa  541  1e-153  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.704558  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1229  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  76.37 
 
 
355 aa  541  1e-153  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3061  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  75.5 
 
 
355 aa  538  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000791225 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1159  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  76.08 
 
 
355 aa  538  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1230  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  78.57 
 
 
347 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1293  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  75.22 
 
 
355 aa  535  1e-151  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1249  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  75.5 
 
 
355 aa  536  1e-151  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1327  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  75.5 
 
 
355 aa  536  1e-151  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0135519 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1089  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  76.57 
 
 
347 aa  536  1e-151  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0240  Oye family NADH-dependent flavin oxidoreductase  71.63 
 
 
347 aa  514  1e-144  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2407  Oye family NADH-dependent flavin oxidoreductase  70.77 
 
 
347 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2779  hypothetical protein  49.43 
 
 
351 aa  358  5e-98  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2058  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.35 
 
 
363 aa  292  5e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6347  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.75 
 
 
363 aa  288  9e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1865  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase family protein  45.27 
 
 
360 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1721  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.63 
 
 
363 aa  286  4e-76  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1327  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.94 
 
 
364 aa  285  9e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4103  N-ethylmaleimide reductase  44.64 
 
 
369 aa  283  2.0000000000000002e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2173  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.38 
 
 
363 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.789599  hitchhiker  0.00631395 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2277  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.48 
 
 
363 aa  277  2e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.178772 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4210  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.19 
 
 
372 aa  276  5e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2479  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.83 
 
 
366 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1258  NADH-flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.21 
 
 
371 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1368  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.97 
 
 
367 aa  272  5.000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.523786  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3683  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.84 
 
 
368 aa  271  1e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4760  flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.95 
 
 
365 aa  270  2e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000142373  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2240  N-ethylmaleimide reductase, FMN-linked  43.77 
 
 
365 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0113  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.77 
 
 
364 aa  268  1e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.15352  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5271  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.41 
 
 
360 aa  268  1e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4736  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.41 
 
 
360 aa  268  1e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3698  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.75 
 
 
364 aa  266  5e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.014573 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2006  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.77 
 
 
364 aa  265  8.999999999999999e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3133  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.15 
 
 
375 aa  265  1e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.656366  normal  0.303319 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1242  NADH-flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.1 
 
 
371 aa  264  2e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.102798  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2094  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.98 
 
 
368 aa  263  4e-69  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1830  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.54 
 
 
358 aa  263  4e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.028835  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1172  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.34 
 
 
359 aa  262  6e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.210538 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000261  N-ethylmaleimide reductase  41.57 
 
 
366 aa  262  6e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56660  xenobiotic reductase  43.75 
 
 
350 aa  262  8e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01763  GTN Reductase  46.06 
 
 
372 aa  261  1e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.553032  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4888  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.13 
 
 
366 aa  261  1e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4063  N-ethylmaleimide reductase, putative  42.74 
 
 
367 aa  260  2e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0986  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.24 
 
 
349 aa  260  2e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000257245 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4767  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44 
 
 
371 aa  260  2e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.323845  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5133  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.67 
 
 
374 aa  260  3e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.249326  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4062  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.35 
 
 
462 aa  260  3e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00355793  normal  0.310254 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0423  FMN oxidoreductase protein  42.18 
 
 
364 aa  259  4e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4927  xenobiotic reductase  43.75 
 
 
350 aa  259  4e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0920  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.68 
 
 
349 aa  259  6e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2082  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.51 
 
 
358 aa  259  6e-68  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2984  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.97 
 
 
361 aa  258  7e-68  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.167784  normal  0.0406088 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4468  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.38 
 
 
349 aa  258  1e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.101693 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0959  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.44 
 
 
349 aa  256  3e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.224706 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0639  Oye family NADH-dependent flavin oxidoreductase  42.25 
 
 
372 aa  256  3e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5550  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.77 
 
 
358 aa  256  4e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.088188  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1120  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.73 
 
 
349 aa  256  4e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.395455 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37800  NADH:flavin xenobiotic reductase  42.2 
 
 
349 aa  256  5e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1282  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.02 
 
 
349 aa  256  5e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0961  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.6 
 
 
351 aa  255  8e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.943991  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3689  GTN reductase  43.66 
 
 
360 aa  255  9e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1643  putative NADH-dependent flavin oxidoreductase  41.08 
 
 
387 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05639  N-ethylmaleimide reductase  41.4 
 
 
366 aa  254  1.0000000000000001e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1138  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.44 
 
 
368 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0230317  normal  0.571173 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2454  oxidoreductase, FMN-binding  42.53 
 
 
365 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0473  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.57 
 
 
378 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0104  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.53 
 
 
369 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2616  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  41.84 
 
 
365 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0507  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.45 
 
 
363 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4808  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.77 
 
 
353 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.147658 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0593  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  41.03 
 
 
363 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06498  NADH-flavin oxidoreductase  41.97 
 
 
363 aa  253  2.0000000000000002e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0481  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.99 
 
 
369 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.239535 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26130  morphinone reductase  43.14 
 
 
369 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.243745  normal  0.290118 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3143  oxidoreductase  40.68 
 
 
371 aa  253  4.0000000000000004e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.683924  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0473  NADH:flavin oxidoreductase  45.45 
 
 
368 aa  253  5.000000000000001e-66  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1202  flavoprotein NADH-dependent oxidoreductase  43.59 
 
 
378 aa  252  6e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.655444 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3889  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.64 
 
 
366 aa  252  6e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.212192  normal  0.106591 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3333  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  41.23 
 
 
375 aa  252  6e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.736898  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0619  N-ethylmaleimide reductase  43.07 
 
 
353 aa  252  7e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.727216  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0340  N-ethylmaleimide reductase  43.07 
 
 
353 aa  252  7e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1356  N-ethylmaleimide reductase  43.07 
 
 
353 aa  252  7e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2474  N-ethylmaleimide reductase  43.07 
 
 
353 aa  252  7e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.22498  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0951  N-ethylmaleimide reductase  43.07 
 
 
353 aa  252  7e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0101  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.24 
 
 
369 aa  252  7e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.70129 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1283  N-ethylmaleimide reductase  43.07 
 
 
353 aa  252  7e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.105035  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0454  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.98 
 
 
378 aa  252  7e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2710  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  41.29 
 
 
366 aa  251  1e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1561  NADH-dependent flavin oxidoreductase, Oye family  40.79 
 
 
375 aa  251  1e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.342223 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5805  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.86 
 
 
353 aa  250  2e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.452386 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1046  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.87 
 
 
368 aa  251  2e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.758573  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1210  N-ethylmaleimide reductase  42.77 
 
 
353 aa  250  2e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1813  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.4 
 
 
362 aa  251  2e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0244  N-ethylmaleimide reductase  42.09 
 
 
367 aa  250  2e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0951  NADH-flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.86 
 
 
353 aa  249  3e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>