More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_2407 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008700  Sama_2407  Oye family NADH-dependent flavin oxidoreductase  100 
 
 
347 aa  710    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0240  Oye family NADH-dependent flavin oxidoreductase  72.62 
 
 
347 aa  522  1e-147  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2720  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  73.39 
 
 
355 aa  520  1e-146  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.100198  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1158  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  73.98 
 
 
355 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.704558  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1229  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  73.98 
 
 
355 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4055  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  70.77 
 
 
350 aa  513  1e-144  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1327  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  72.81 
 
 
355 aa  513  1e-144  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0135519 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1159  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  73.39 
 
 
355 aa  513  1e-144  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3061  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  72.51 
 
 
355 aa  511  1e-144  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000791225 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1249  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  72.81 
 
 
355 aa  513  1e-144  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3392  oxidoreductase, FMN-binding  72.51 
 
 
355 aa  511  1e-143  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1293  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  72.22 
 
 
355 aa  508  1e-143  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3098  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  69.94 
 
 
346 aa  500  1e-140  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.450355  normal  0.838165 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1089  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  71.1 
 
 
347 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1397  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  68.86 
 
 
351 aa  488  1e-137  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.3301  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3644  putative NADH-dependent flavin oxidoreductase  70.77 
 
 
350 aa  485  1e-136  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.055572 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1230  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  70.23 
 
 
347 aa  481  1e-135  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2779  hypothetical protein  51.44 
 
 
351 aa  365  1e-100  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6347  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.87 
 
 
363 aa  279  6e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2277  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.57 
 
 
363 aa  275  1.0000000000000001e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.178772 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1721  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.46 
 
 
363 aa  273  3e-72  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1258  NADH-flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.51 
 
 
371 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2058  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.69 
 
 
363 aa  272  7e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56660  xenobiotic reductase  44.01 
 
 
350 aa  268  1e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4063  N-ethylmaleimide reductase, putative  43.19 
 
 
367 aa  265  8e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1865  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase family protein  45 
 
 
360 aa  264  2e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4103  N-ethylmaleimide reductase  42.9 
 
 
369 aa  264  2e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4927  xenobiotic reductase  43.75 
 
 
350 aa  262  4.999999999999999e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1327  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.15 
 
 
364 aa  262  6e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0104  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.92 
 
 
369 aa  262  6e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2173  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.19 
 
 
363 aa  261  1e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.789599  hitchhiker  0.00631395 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000261  N-ethylmaleimide reductase  43.1 
 
 
366 aa  261  2e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3689  GTN reductase  45.72 
 
 
360 aa  260  2e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0113  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.92 
 
 
364 aa  261  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.15352  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0507  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.05 
 
 
363 aa  260  2e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0101  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.62 
 
 
369 aa  259  3e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.70129 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2240  N-ethylmaleimide reductase, FMN-linked  43.48 
 
 
365 aa  259  4e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0986  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.94 
 
 
349 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000257245 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05639  N-ethylmaleimide reductase  42.52 
 
 
366 aa  258  8e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2094  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.94 
 
 
368 aa  258  1e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0593  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.23 
 
 
363 aa  258  1e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1120  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.64 
 
 
349 aa  257  2e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.395455 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0217  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.51 
 
 
358 aa  257  2e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1368  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.82 
 
 
367 aa  257  2e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.523786  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1830  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.67 
 
 
358 aa  257  2e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.028835  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2479  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.97 
 
 
366 aa  256  3e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4736  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.29 
 
 
360 aa  255  6e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0423  FMN oxidoreductase protein  43.9 
 
 
364 aa  255  9e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0920  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.64 
 
 
349 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4053  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.14 
 
 
349 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.477429  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1242  NADH-flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.12 
 
 
371 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.102798  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1643  putative NADH-dependent flavin oxidoreductase  41.88 
 
 
387 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4210  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.9 
 
 
372 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4468  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.34 
 
 
349 aa  253  3e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.101693 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3087  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  40.86 
 
 
370 aa  253  3e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.138011 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26130  morphinone reductase  44.64 
 
 
369 aa  253  3e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.243745  normal  0.290118 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1172  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.23 
 
 
359 aa  253  4.0000000000000004e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.210538 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5133  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.38 
 
 
374 aa  252  5.000000000000001e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.249326  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5271  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.29 
 
 
360 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2616  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.06 
 
 
365 aa  252  5.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0959  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.34 
 
 
349 aa  252  6e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.224706 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3143  oxidoreductase  41.97 
 
 
371 aa  252  6e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.683924  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3698  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.98 
 
 
364 aa  252  8.000000000000001e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.014573 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2082  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.35 
 
 
358 aa  251  1e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06498  NADH-flavin oxidoreductase  42.52 
 
 
363 aa  251  1e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1282  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.64 
 
 
349 aa  251  1e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3683  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  40 
 
 
368 aa  251  1e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0244  N-ethylmaleimide reductase  42.94 
 
 
367 aa  250  2e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4760  flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.32 
 
 
365 aa  251  2e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000142373  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2984  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.1 
 
 
361 aa  251  2e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.167784  normal  0.0406088 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0473  NADH:flavin oxidoreductase  44.25 
 
 
368 aa  250  3e-65  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0845  oxidoreductase, FMN-binding  42.58 
 
 
371 aa  249  4e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0902  oxidoreductase, FMN-binding  42.58 
 
 
371 aa  249  4e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5550  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.01 
 
 
358 aa  249  7e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.088188  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000624  N-ethylmaleimide reductase  42.52 
 
 
374 aa  248  8e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1539  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  40.83 
 
 
358 aa  248  1e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.31269  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4358  oxidoreductase, FAD/FMN-binding protein  40.95 
 
 
349 aa  248  1e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3889  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.4 
 
 
366 aa  248  1e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.212192  normal  0.106591 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1245  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.54 
 
 
373 aa  247  2e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.939474  normal  0.298722 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3133  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  40.41 
 
 
375 aa  247  2e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.656366  normal  0.303319 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2805  putative NADH-flavin oxidoreductase  43.84 
 
 
362 aa  246  4e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2710  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  41.29 
 
 
366 aa  245  6.999999999999999e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4062  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.35 
 
 
462 aa  245  6.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00355793  normal  0.310254 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2005  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.86 
 
 
359 aa  245  6.999999999999999e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.036883  normal  0.0112821 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4153  N-ethylmaleimide reductase, putative  44.08 
 
 
378 aa  245  8e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001682  NADH:flavin oxidoreductases Old Yellow Enzyme family  42.18 
 
 
358 aa  245  8e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1494  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.84 
 
 
362 aa  245  8e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0995744  normal  0.674714 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0639  Oye family NADH-dependent flavin oxidoreductase  41.11 
 
 
372 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37800  NADH:flavin xenobiotic reductase  42.04 
 
 
349 aa  244  9.999999999999999e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1468  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  41.74 
 
 
371 aa  243  1.9999999999999999e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5519  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.34 
 
 
353 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.824672 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4764  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.34 
 
 
353 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.211845 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0454  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.01 
 
 
378 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4767  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.25 
 
 
371 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.323845  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1157  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.77 
 
 
362 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.10298  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0961  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  40.84 
 
 
351 aa  243  1.9999999999999999e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.943991  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3603  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.34 
 
 
353 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.682555  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2099  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  40.51 
 
 
366 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.732064  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0473  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.01 
 
 
378 aa  243  3e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0951  NADH-flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.28 
 
 
353 aa  243  3e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>